Characterization of T-cell clones from naïve and virtual memory compartment
Charakterizace naivních a virtuálně paměťových T lymfocytárních klonů
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/110092Identifikátory
SIS: 196739
Kolekce
- Kvalifikační práce [19062]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Drbal, Karel
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Imunologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
13. 9. 2019
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
T-buněčný receptor, TCR, adaptivní imunita, antigen, virtuální paměťové T lymfocytyKlíčová slova (anglicky)
T-cell receptor, TCR, adaptive immunity, antigen, virtual memory T cellsVirtuálně paměťové (VM) CD8+ T buňky představují populaci tzv. antigeně-nezkušených T buněk, které mají centrálně paměťový fenotyp. Tvoří 10-20% všech periferních CD8+ T buněk v neimunizované bezmikrobní myši. Formují se z vysoce autoreaktivních T buněčných klonů na periferii prostřednictvím silných homeostatických signálů T-buněčného receptoru (TCR). V první části této diplomové práce bylo cílem porovnat TCR repertoáry VM a naivních CD8+ T buněk. Ukázali jsme, že obě skupiny buněk mají tyto repertoáry odlišné a T-buněčné podmnožiny navíc obsahují odlišné klonotypy. Dále jsme zjistili, že tzv. VM klony byly přítomny jak ve VM buňkách, tak i v naivních buňkách. Na druhou stranu tzv. naivní klony se vyskytovaly pouze v buňkách naivních. V druhé části této práce bylo cílem charakterizovat signalizaci jednotlivých OVA-reaktivních TCR z VM a naivní podmnožiny T buněk. Úspěšně jsme dokázali, že šest z osmi testovaných TCR odpovídají na Kb-OVA. V poslední části práce jsme navrhli a optimalizovali qPCR metodu, která je určena pro relativní kvantifikaci specifických T- buněčných klonotypů před a během imunitní odpovědi. Tato metoda bude sloužit jako efektivní nástroj pro studování biologie jednotlivých VM a naivních podmnožin T buněk a jejich role během imunitní odpovědi. Klíčová slova: T-buněčný receptor,...
Virtual memory (VM) CD8+ T cells represent a population of antigen-inexperienced T cells with an apparent memory phenotype. In lymphoreplete germ-free mice VM CD8+ T cells represent 10-20% of all peripheral CD8+ T cells. Their origin correlates with the levels of self-reactivity where the main factor that determinates the T-cell fate decision is the strength of homeostatic signals. In the first part of this thesis, we demonstrated that VM CD8+ T cells and naïve CD8+ T cells had distinct TCR repertoire and T-cell subsets contained different clonotypes. Moreover, 'VM clones' were enriched among VM T cells and were also present in naïve T cells. In contrast, 'naïve clones' were almost exclusively detected in naïve T cells. Next, we characterized the signaling of particular OVA-reactive TCRs from both naïve and VM subsets. We confirmed that 6 out of 8 tested TCRs were responsive to Kb-OVA. In the last part of the thesis, we developed and optimized a qPCR-based method for the relative quantification of specific T-cell clonotypes prior to and during the immune response. This method will serve as a tool for studying the biology of particular VM and naïve T-cell subsets and their role during the immune response. Keywords: T-cell receptor, homeostatic signaling, self-reactivity, virtual memory cells, T cells