Charakterizácia génu pop-1 u Caenorhabditis elegans
Characterization of the Caenorhabditis elegans pop-1 gene
Charakterizace genu pop-1 u Caenorhabditis elegans
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/110018Identifiers
Study Information System: 215876
Collections
- Kvalifikační práce [19113]
Author
Advisor
Referee
Macůrková, Marie
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Cellular and Developmental Biology
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
12. 9. 2019
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Slovak
Grade
Good
Keywords (Czech)
Wnt signalizace, genová exprese, transkripční regulace, alternativní izoformyKeywords (English)
Wnt signaling, gene expression, transcriptional regulation, alternative isoformsTranskripční faktory TCF/LEF regulují cílové geny signální dráhy Wnt - klíčového mechanismu ve vývoji mnohobuněčných organismů. Geny TCF/LEF produkují mnoho různých proteinových izoforem, čímž rozšiřují pole působnosti TCF/LEF proteinů. Diplomová práce využívá modelový organismus Caenorhabditis elegans, u kterého studuje gen pop-1, ortolog TCF/LEF. Žádná alternatívní izoforma proteinu POP-1 nebyla doposud identifikovaná. Hybridizační metodou Northern blot jsme se pokusili ověřit přítomnost alternativní pop-1 mRNA. Pomocí kvantitativního RT-PCR jsme analyzovali hladinu pop-1 mRNA v sedmi vývojových stádiích C. elegans. Kromě toho jsme stanovili expresní profil dvou významných interačních partnerů proteinu POP-1 - genů bar-1 a sys-1, jejichž proteinové produkty mají ve Wnt signalizaci úlohu transkripčních koaktivátorů. Klíčová slova: kanonická Wnt signální dráha, transkripční faktory TCF/LEF, Caenorhabditis elegans, pop-1
The TCF/LEF transcriptional factors regulate the target genes of the Wnt signalling pathway - one of the key signalling mechanisms involved in development of multicellular organisms. The TCF/LEF genes produce a number of various protein isoforms, which consequently leads to a great functional diversity of the TCF/LEF proteins. In this diploma project we focused on the Caenorhabditis elegans gene pop-1, the ortholog of the TCF/LEF genes, whose isoforms have not been studied yet. Using the Northern blot analysis we tried to identify alternative isoforms of the pop-1 mRNA in C. elegans. Using quantitative RT-PCR we also analyzed the pop-1 mRNA levels during seven developmental stages of C. elegans. Further, we also determined the expression profile of two important partners of pop-1, the bar-1 and sys-1 genes, whose protein products function as transcriptional co-activators. Key words: canonical Wnt signaling pathway, TCF/LEF transcription factors, Caenorhabditis elegans, pop-1