Detekcia a variabilita patogénu račieho moru vo vybraných populáciách rakov
Detection and variation of the crayfish plague pathogen in selected crayfish populations
Detekce a variabilita patogenu račího moru ve vybraných populacích raků
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/109860Identifiers
Study Information System: 198045
Collections
- Kvalifikační práce [19113]
Author
Advisor
Referee
Buřič, Miloš
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Ecology
Department
Department of Ecology
Date of defense
10. 9. 2019
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Slovak
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
račí mor, Aphanomyces astaci, chronické infekce, úhyny, genotyp, přenašečiKeywords (English)
crayfish plague, Aphanomyces astaci, chronic infections, mortalities, genotype, vectorsRačí mor je tzv. "emerging disease", ktorej pôvodcom je oomycéta Aphanomyces astaci, patogén zaradený medzi 100 najhorších invazívnych nepôvodných druhov na svete. Introdukcia tohto patogénu zo Severnej Ameriky do Európy v druhej polovici 19. storočia, viedla ku kolapsom pôvodných európskych populácii rakov. V dnešnej dobre je A. astaci rozšírený v Európe a rozšíril sa i do iných častí sveta a ohrozuje všetky vnímavé druhy rakov neseveroamerického pôvodu. Ciele tejto diplomovej práce boli 1) poskytnúť informácie o úhynoch rakov na račí mor dokumentovaných v nedávnej dobe a pomocou mikrosatelitových a mtDNA markerov odhaliť, ktoré genotypové skupiny ich spôsobili; 2) otestovať zdravo vyzerajúce pôvodné raky pre potenciálny výskyt chronických infekcii spôsobených A. astaci v Česku. Medzi rokmi 2016 až 2018 bolo potvrdených šesť nových úhynov na račí mor, ktoré zahrňovali najmenej päť rôznych kmeňov A. astaci. Moje výsledky poskytujú prvý dôkaz o tom, že genotypová skupina D spôsobila masové úhyny Astacus astacus a Austropotamobius torrentium v Česku. Sekvenovaním mtDNA boli odhalené dva rôzne haplotypy z D haploskupiny, čo naznačuje dva nezávislé zdroje infekcie pravdepodobne, buď z okrasných rakov prítomných v krajine alebo sa rozšírili zo susediacich krajín. Genotypová skupina A bola zaznamenaná u...
Crayfish plague is an emerging disease caused by the oomycete Aphanomyces astaci, a pathogen listed among the 100 World's Worst Invasive Alien Species. It was introduced into Europe in the second half of 19th century from North America and caused collapses of European native crayfish populations. Nowadays, A. astaci is widespread in Europe and has spread also to other parts of the world, threatening all susceptible crayfish of non-North American origin. The aims of this MSc thesis were 1) to provide information about crayfish plague outbreaks from recent years, and by using microsatellite and mtDNA markers reveal A. astaci genotypes involved; 2) to test healthy-looking indigenous crayfish for potential occurrence of chronic infections by A. astaci in Czechia. Six new crayfish plague outbreaks were confirmed from 2016 to 2018, involving at least five distinct pathogen strains. My results provide first evidence of the A. astaci genotype group D causing Astacus astacus and Austropotamobius torrentium mass mortalities in Czechia. MtDNA sequencing revealed two haplotypes of the D haplogroup, indicating two independent sources of infection presumably either from ornamental crayfish or spreading from neighbouring countries. The genotype group A was recorded in two A. astacus mortalities and genotype group...