The analysis of structural details of the NMDA receptor
Analýza strukturních detailů NMDA receptoru
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/102203Identifiers
Study Information System: 186067
Collections
- Kvalifikační práce [19592]
Author
Advisor
Consultant
Bendová, Zdeňka
Referee
Jakubík, Jan
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Animal Physiology
Department
Department of Physiology
Date of defense
6. 9. 2018
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
NMDA receptor, glutamátový receptor, počátačové modelování, struktura, klonování, exprese proteinuKeywords (English)
NMDA receptor, glutamate receptor, comutational modelling, structure, cloning, protein expressionNMDA receptor je nezbytnou součástí exitační transmise v centrální nervové soustavě. Pozměněná funkce NMDA receptorů je spojována s mnoha neurodegenerativními a neuropsychiatrickými chorobami. Vyřešené krystalové struktury NMDA receptorů znamenaly velký posun v pochopení detailů jejich funkce. Bohužel tyto v současnosti dostupné struktury představují jen některé funkční stavy receptoru a také několik strukturních informací stále chybí. Ke kompletnímu porozumění procesu aktivace a deaktivace NMDA receptorů je potřeba doplnit stávající informace dalšími studiemi. Cílem této práce bylo pomocí kombinace různých metod (počítačové modelování, klonování, biochemické metody, exprese a purifikace proteinu a strukturní hmotnostní spektrometrii) získat nová strukturní data, kterými bychom byli schopni doplnit mezery v současnosti dostupných modelech a strukturách receptoru, zejména pak receptoru v různých funkčních stavech. Klíčová slova NMDA receptor, glutamátový receptor, počítačové modelování, struktura, klonování, exprese proteinu
NMDA receptor is necessary for excitatory transmission in the central nervous system. Altered funtion of the NMDA receptors is associated with many neurodegenerative and neuropsychiatric diseases. All available crystal structures of the NMDAR meant great shift towards our understanding of details of the receptor and its function. Unfortunately, these up- to-date available structures present only certain functional states of receptors and also a few structural data are still missing. For complete comprehension of the process of activation and deactivation of NMDA receptors, we need to supplement the current information with more data. The aim of this thesis was to employ a combination of different approaches (computational modelling, cloning, biochemistry, protein expression and purification and mass spectrometry) to obtain new structural data, by which we would be able to fill in the gaps in current receptor models, especially at various functional states of the receptor. Key words: NMDA receptor, glutamate receptor, computational modelling, structure, cloning, protein expression
Citace dokumentu
Metadata
Show full item recordRelated items
Showing items related by title, author, creator and subject.
-
Role of β-arrestin in μ-opioid and TRPV1 receptor signalling
Defence status: DEFENDEDNagy Marková, Vendula (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2023)Date of defense: 20. 9. 2023β-Arrestin belongs to the protein family which has a huge impact not only on GPCR signaling, but its role exceeds the function of the membrane channel, its own signaling cascade, or as a scaffold protein, etc. Here we aimed ... -
Role Argininu 717 v inzulínovém receptoru, respektive Argininu 704 v IGF-1 receptoru při vazbě ligandů
Defence status: DEFENDEDKertisová, Anna (Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2023)Date of defense: 30. 5. 2023Insulin and insulin-like growth factor 1 (IGF-1) are peptide hormones that are important regulators of cellular metabolism, proliferation and apoptosis. Disruptions in signalling pathways may cause a whole range of diseases ... -
Development of a reliable test system for purinergic P2X3 receptors
Defence status: DEFENDEDTomanová, Šárka (Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, 2016)Date of defense: 1. 6. 2016Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Studentka: Šárka Tomanová Školitelé: Prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D., Prof. Dr. Christa Elisabeth Müller ...