Studium nově objeveného proteinu GL50803_16424 u Giardia intestinalis.
Investigation of newly discovered protein GL50803_16424 in Giardia intestinalis.
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/102173Identifikátory
SIS: 184706
Kolekce
- Kvalifikační práce [19109]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Pyrih, Jan
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Buněčná a vývojová biologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
17. 9. 2018
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Velmi dobře
Klíčová slova (česky)
Giardia intestinalis, mitosom, GL50803_16424, biotinylace, Mlf1IPKlíčová slova (anglicky)
Giardia intestinalis, mitosom, GL50803_16424, biotinylation, Mlf1IPAnaerobní jednobuněčný eukaryotický organismus Giardia intestinalis je celosvětově rozšířený střevní parazit člověka a zvířat. Způsobované onemocnění giardióza je jednou z nejčastějších parazitárních infekcí ve vyspělých částech světa. G. intestinalis je také zajímavá svými unikátními buněčnými znaky. Jedním z nich je přítomnost mitosomů, speciálních organel odvozených od mitochondrií. Podobně jako mitochondrie je mitosom ohraničen dvěma membránami a má stejný způsob transportu proteinů. Nicméně mitosom nemá vlastní genom a doposud je známá pouze jedna mitosomální metabolická dráha - syntéza železo-sirných klastrů. Za použití in vivo enzymatického značení bylo identifikováno několik nových mitosomálních proteinů včetně GL50803_16424. Naši pozornost upoutal protein GL50803_16424 tím, že interagoval s proteiny všech mitosomálních subkompartmentů: vnější membránou, vnitřní membránou a matrix. Navíc exprese proteinu GL50803_16424 značeného HA tagem vedla k tvorbě neobvyklých struktur v blízkosti mitosomů, které nebyly dříve pozorovány. Bioinformatické přístupy ukázaly, že GL50803_16424 má doménu podobnou "myelodysplasia-myeloid leukemia factor 1-interacting protein". Naše data z hmotnostní spektrometrie ukazují, že protein GL50803_16424 interaguje s proteiny endoplazmatického retikula a mitosomu. Úzké...
The anaerobic unicellular eukaryotic organism Giardia intestinalis is a worldwide parasite. Giardiasis, the intestinal disease caused by Giardia, is one of the most common parasitic disease in the developed part of the world, that causes health problems not only to humans but also to animals. This organism is also interesting for its many unique cellular features. One of them is the presence of mitosomes - the organelles derived from mitochondria. Analogously to mitochondria, mitosome is limited by two membranes and shares the mode of the protein transport. However, mitosome does not have its own genome and as far as we know, there is only one pathway of the iron-sulfur cluster biosynthesis in this organelle. Using the in vivo enzymatic tagging technique, several novel mitosomal proteins were identified, including GL50803_16424. The protein GL50803_16424 attracted our attention by interacting with components of all mitosomal subcompartments: the outer membrane, the membrane and the matrix. In addition, the expression of HA-tagged GL50803_16424 resulted in the formation of peculiar structures near the mitosomes never seen before in G. intestinalis. Bioinformatic approaches revealed that the GL50803_16424 has domain similar to the myelodysplasia- myeloid leukemia factor 1-interacting protein. Our...