dc.contributor.advisor | Kalina, Tomáš | |
dc.creator | Novák, David | |
dc.date.accessioned | 2019-05-03T13:47:11Z | |
dc.date.available | 2019-05-03T13:47:11Z | |
dc.date.issued | 2018 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11956/98276 | |
dc.description.abstract | Development of human B-lymphocytes is a convoluted process. A self-renewing stem cell progenitor in a primary lymphoid tissue commits to the lymphoid lineage. Subsequent B-lineage commitment entails somatic gene recombination processes which lead to the eventual expression of a surface antigen receptor. Functionality of the B-cell receptor, as well as successful testing for autoreactivity by the cell, are preconditions for the differenti- ation of a mature B-lymphocyte. Processes within this development are often investigated using single-cell analysis via flow cytometry, fluorescence-activated cell sorting and mass cytometry. Coupling these high-throughput methods with modern approaches to data analysis carries enormous potential in revealing rare cell populations and aberrant events in haematopoiesis. Keywords: B-lymphocyte, lymphopoiesis, flow cytometry, FACS, mass cytometry, clus- ter analysis, FlowSOM, PCA, t-SNE, Wanderlust. | en_US |
dc.description.abstract | Vývoj lidských B-lymfocytů je spletitým dějem. Samoobnovující se kmenový progeni- tor v primární lymfoidní tkáni je nejdříve předurčen k vývoji v lymfoidní linii. Vývoj B-buněčnou cestou pak zahrnuje somatické genové rekombinace, které vedou k expresi povrchového antigenního receptoru. Funkčnost B-buněčného receptoru a podrobení buňky testování na autoreaktivitu jsou podmínkami pro diferenciaci ve zralý B-lymfocyt. Děje v rámci tohoto vývoje jsou často zkoumány pomocí single-cell analýzy skrze průtokovou cy- tometrii, fluorescencí aktivované třídění buněk a hmotnostní cytometrii. Propojení těchto vysoce výkonných metod s moderními přístupy k analýze dat skýtá obrovský potenciál v nacházení vzácných buněčných populací a odchylných událostí v rámci krvetvorby. Klíčová slova: B-lymfocyt, lymfopoéza, průtoková cytometrie, FACS, hmotnostní cy- tometrie, shluková analýza, FlowSOM, PCA, t-SNE, Wanderlust. 1 | cs_CZ |
dc.language | English | cs_CZ |
dc.language.iso | en_US | |
dc.publisher | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.subject | B-lymfocyt | cs_CZ |
dc.subject | lymfopoéza | cs_CZ |
dc.subject | průtoková cytometrie | cs_CZ |
dc.subject | FACS | cs_CZ |
dc.subject | hmotnostní cytometrie | cs_CZ |
dc.subject | shluková analýza | cs_CZ |
dc.subject | FlowSOM | cs_CZ |
dc.subject | PCA | cs_CZ |
dc.subject | t-SNE | cs_CZ |
dc.subject | Wanderlust | cs_CZ |
dc.subject | B-lymphocyte | en_US |
dc.subject | lymphopoiesis | en_US |
dc.subject | flow cytometry | en_US |
dc.subject | FACS | en_US |
dc.subject | mass cytometry | en_US |
dc.subject | cluster analysis | en_US |
dc.subject | FlowSOM | en_US |
dc.subject | PCA | en_US |
dc.subject | t-SNE | en_US |
dc.subject | Wanderlust | en_US |
dc.title | Human lymphopoiesis and its examination via single-cell analysis | en_US |
dc.type | bakalářská práce | cs_CZ |
dcterms.created | 2018 | |
dcterms.dateAccepted | 2018-06-01 | |
dc.description.department | Department of Cell Biology | en_US |
dc.description.department | Katedra buněčné biologie | cs_CZ |
dc.description.faculty | Faculty of Science | en_US |
dc.description.faculty | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.identifier.repId | 196823 | |
dc.title.translated | Lidská lymfopoéza a její výzkum pomocí single-cell analýzy | cs_CZ |
dc.contributor.referee | Drbal, Karel | |
dc.identifier.aleph | 002189751 | |
thesis.degree.name | Bc. | |
thesis.degree.level | bakalářské | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Biologie | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Biology | en_US |
thesis.degree.program | Biologie | cs_CZ |
thesis.degree.program | Biology | en_US |
uk.thesis.type | bakalářská práce | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-cs | Přírodovědecká fakulta::Katedra buněčné biologie | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-en | Faculty of Science::Department of Cell Biology | en_US |
uk.faculty-name.cs | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
uk.faculty-name.en | Faculty of Science | en_US |
uk.faculty-abbr.cs | PřF | cs_CZ |
uk.degree-discipline.cs | Biologie | cs_CZ |
uk.degree-discipline.en | Biology | en_US |
uk.degree-program.cs | Biologie | cs_CZ |
uk.degree-program.en | Biology | en_US |
thesis.grade.cs | Velmi dobře | cs_CZ |
thesis.grade.en | Very good | en_US |
uk.abstract.cs | Vývoj lidských B-lymfocytů je spletitým dějem. Samoobnovující se kmenový progeni- tor v primární lymfoidní tkáni je nejdříve předurčen k vývoji v lymfoidní linii. Vývoj B-buněčnou cestou pak zahrnuje somatické genové rekombinace, které vedou k expresi povrchového antigenního receptoru. Funkčnost B-buněčného receptoru a podrobení buňky testování na autoreaktivitu jsou podmínkami pro diferenciaci ve zralý B-lymfocyt. Děje v rámci tohoto vývoje jsou často zkoumány pomocí single-cell analýzy skrze průtokovou cy- tometrii, fluorescencí aktivované třídění buněk a hmotnostní cytometrii. Propojení těchto vysoce výkonných metod s moderními přístupy k analýze dat skýtá obrovský potenciál v nacházení vzácných buněčných populací a odchylných událostí v rámci krvetvorby. Klíčová slova: B-lymfocyt, lymfopoéza, průtoková cytometrie, FACS, hmotnostní cy- tometrie, shluková analýza, FlowSOM, PCA, t-SNE, Wanderlust. 1 | cs_CZ |
uk.abstract.en | Development of human B-lymphocytes is a convoluted process. A self-renewing stem cell progenitor in a primary lymphoid tissue commits to the lymphoid lineage. Subsequent B-lineage commitment entails somatic gene recombination processes which lead to the eventual expression of a surface antigen receptor. Functionality of the B-cell receptor, as well as successful testing for autoreactivity by the cell, are preconditions for the differenti- ation of a mature B-lymphocyte. Processes within this development are often investigated using single-cell analysis via flow cytometry, fluorescence-activated cell sorting and mass cytometry. Coupling these high-throughput methods with modern approaches to data analysis carries enormous potential in revealing rare cell populations and aberrant events in haematopoiesis. Keywords: B-lymphocyte, lymphopoiesis, flow cytometry, FACS, mass cytometry, clus- ter analysis, FlowSOM, PCA, t-SNE, Wanderlust. | en_US |
uk.file-availability | V | |
uk.publication.place | Praha | cs_CZ |
uk.grantor | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra buněčné biologie | cs_CZ |
thesis.grade.code | 2 | |
dc.identifier.lisID | 990021897510106986 | |