Chromatinová imunoprecipitace vybraných transkripčních faktorů
Chromatin immunoprecipitation of selected transcription factors
diplomová práce (NEOBHÁJENO)

Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/98132Identifikátory
SIS: 182976
Kolekce
- Kvalifikační práce [20186]
Autor
Vedoucí práce
Konzultant práce
Novák, Petr
Oponent práce
Převorovský, Martin
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Imunologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
31. 5. 2018
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Neprospěl/a
Klíčová slova (česky)
Genová regulace, transkripční faktory, chromatinová imunoprecipitace, bioinformatikaKlíčová slova (anglicky)
Gene regulation, transcription factors, chromatin immunoprecipitation, bioinformaticsRodina transkripčních faktorů TEAD reguluje expresi genů, které regulují buněčnou proliferaci, diferenciaci a apoptózu. Aktivita TEAD1 je regulována prostřednictvím Hippo signální dráhy. Obecný mechanismus suprese nádorových buněk skrze Hippo signální dráhu zůstává nejasný. C-MYC a GLUT1, dva klíčové regulátory glykolýzy, byly recentně popsány v lidských leukemických buňkách jako cíle Hippo signální dráhy. V této diplomové práci byla pomocí ChIP analýzy v lidských leukemických buňkách experimentálně potvrzena vazba TEAD1 k prvnímu exonu genu C-MYC a dále objevena nová interakce TEAD1 s enhancerem genu C-MYC a s enhancerem genu GLUT1. Regulace glukózového metabolismu Hippo signální dráhou může představovat nový mechanismus suprese nádorových buněk. Klíčová slova: genová regulace, transkripční faktory, chromatinová imunoprecipitace, bioinformatika
The family of transcription factors TEAD regulates the expression of genes that affect cell proliferation, differentiation and apoptosis. Activity of TEAD1 is regulated via the Hippo signaling pathway. General mechanism of tumor cell suppression by the Hippo signaling pathway remains unclear. C-MYC and GLUT1, the two key regulators of glycolysis, were recently described as targets of the Hippo signaling pathway in human leukemia cells. In this diploma thesis, the interaction of TEAD1 with M-CAT binding motifs was experimentally confirmed in the first exon of C-MYC gene. In addition, a new interaction of TEAD1 with M-CAT binding motifs has been found in the enhancer of C-MYC promoter and enhancer of GLUT1 promoter by ChIP analysis. Regulation of glucose metabolism by the Hippo signaling pathway may represent a new mechanism of tumor cell suppression. Key words: Gene regulation, transcription factors, chromatin immunoprecipitation, bioinformatics