Show simple item record

Synthesis of low-symmetry azaphthalocyanine for the labeling of DNA probes increasing the susceptibility of the molecular-biological methods
dc.contributor.advisorNováková, Veronika
dc.creatorSchimmerová, Aneta
dc.date.accessioned2017-06-22T08:32:07Z
dc.date.available2017-06-22T08:32:07Z
dc.date.issued2017
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/85225
dc.description.abstract1. ABSTRAKT Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Katedra biofyziky a fyzikální chemie Student Aneta Schimmerová Školitel doc. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Název diplomové práce Příprava nesymetrického azaftalocyaninu pro značení DNA sond zvyšujících citlivost molekulárně-biologických metod Azaftalocyaniny (AzaPc, z angl. azaphthalocyanines) jsou planární makrocyklické sloučeniny. AzaPc nesoucí ve své molekule alkylaminové periferní substituenty se ukázaly být vhodné jako zhášeče fluorescence jiných sloučenin. Tohoto faktu může být využito v DNA- hybridizačních metodách. V případě, že je na jedné DNA sondě navázán AzaPc zhášeč i fluorofor, není patrná žádná fluorescence. Pokud dojde k rozštěpení oligonukleotidového řetězce DNA sondy, dostane se zhášeč do dostatečně velké vzdálenosti od fluoroforu a není již tak schopen zhášet fluorescenci fluoroforu. AzaPc díky rozsáhlému systému konjugovaných dvojných vazeb absorbují téměř v celé škále absorpčního spektra od 300 nm do 750 nm a jsou tak schopni zhášet fluorescenci všech v praxi používaných fluoroforů. Cílem této diplomové práce bylo připravit AzaPc, který bude možno navázat doprostřed DNA sondy a současně ponese planární molekulu, která se vklíní do dvoušroubovice DNA a zpevní tak vazbu celé DNA sondy. Nejprve byly...cs_CZ
dc.description.abstract1. ABSTRACT Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department Department od Biophysics and Physical Chemistry Student Aneta Schimmerová Supervisor Assoc. Prof. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Title of thesis Synthesis of low-symmetry azaphthalocyanine for the labeling of DNA probes increasing the susceptibility of the molecular- biological methods Azaphthalocyanines (AzaPc) are planar macrocyclic compounds. The alkylamino substituted derivatives can be used as dark quenchers in DNA-hybridization assays. A probe usually contains a quencher and a fluorophore. If these two moieties are close enough, the emitted fluorescence is quenched by the quencher. After the hydrolysis of the oligonucleotide probe, the fluorescence appears because of the long distance between the quencher and fluorophore. Thanks to the large system of conjugated double bounds, AzaPc absorb over a wide range of wavelengths from 300 nm to 750 nm. Such absorption covers all fluorophores used in hybridization assays nowadays, thus AzaPc may serve as universal dark quenchers. The aim of this study was to prepare an AzaPc, that will be possible to attach inside an oligonucleotide strand. Furthermore, a planar moiety bounded to AzaPc will intercalate into DNA and improve the strength of binding of the probe to DNA. First, the...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.titlePříprava nesymetrického azaftalocyaninu pro značení DNA sond zvyšujících citlivost molekulárně-biologických metodcs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2017
dcterms.dateAccepted2017-06-01
dc.description.departmentDepartment of Biophysics and Physical Chemistryen_US
dc.description.departmentKatedra biofyziky a fyzikální chemiecs_CZ
dc.description.facultyFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
dc.identifier.repId171001
dc.title.translatedSynthesis of low-symmetry azaphthalocyanine for the labeling of DNA probes increasing the susceptibility of the molecular-biological methodsen_US
dc.contributor.refereeMiletín, Miroslav
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelmagisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineFarmaciecs_CZ
thesis.degree.disciplinePharmacyen_US
thesis.degree.programPharmacyen_US
thesis.degree.programFarmaciecs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csFarmaceutická fakulta v Hradci Králové::Katedra biofyziky a fyzikální chemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Pharmacy in Hradec Králové::Department of Biophysics and Physical Chemistryen_US
uk.faculty-name.csFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
uk.faculty-abbr.csFaFcs_CZ
uk.degree-discipline.csFarmaciecs_CZ
uk.degree-discipline.enPharmacyen_US
uk.degree-program.csFarmaciecs_CZ
uk.degree-program.enPharmacyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.cs1. ABSTRAKT Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Katedra biofyziky a fyzikální chemie Student Aneta Schimmerová Školitel doc. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Název diplomové práce Příprava nesymetrického azaftalocyaninu pro značení DNA sond zvyšujících citlivost molekulárně-biologických metod Azaftalocyaniny (AzaPc, z angl. azaphthalocyanines) jsou planární makrocyklické sloučeniny. AzaPc nesoucí ve své molekule alkylaminové periferní substituenty se ukázaly být vhodné jako zhášeče fluorescence jiných sloučenin. Tohoto faktu může být využito v DNA- hybridizačních metodách. V případě, že je na jedné DNA sondě navázán AzaPc zhášeč i fluorofor, není patrná žádná fluorescence. Pokud dojde k rozštěpení oligonukleotidového řetězce DNA sondy, dostane se zhášeč do dostatečně velké vzdálenosti od fluoroforu a není již tak schopen zhášet fluorescenci fluoroforu. AzaPc díky rozsáhlému systému konjugovaných dvojných vazeb absorbují téměř v celé škále absorpčního spektra od 300 nm do 750 nm a jsou tak schopni zhášet fluorescenci všech v praxi používaných fluoroforů. Cílem této diplomové práce bylo připravit AzaPc, který bude možno navázat doprostřed DNA sondy a současně ponese planární molekulu, která se vklíní do dvoušroubovice DNA a zpevní tak vazbu celé DNA sondy. Nejprve byly...cs_CZ
uk.abstract.en1. ABSTRACT Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department Department od Biophysics and Physical Chemistry Student Aneta Schimmerová Supervisor Assoc. Prof. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Title of thesis Synthesis of low-symmetry azaphthalocyanine for the labeling of DNA probes increasing the susceptibility of the molecular- biological methods Azaphthalocyanines (AzaPc) are planar macrocyclic compounds. The alkylamino substituted derivatives can be used as dark quenchers in DNA-hybridization assays. A probe usually contains a quencher and a fluorophore. If these two moieties are close enough, the emitted fluorescence is quenched by the quencher. After the hydrolysis of the oligonucleotide probe, the fluorescence appears because of the long distance between the quencher and fluorophore. Thanks to the large system of conjugated double bounds, AzaPc absorb over a wide range of wavelengths from 300 nm to 750 nm. Such absorption covers all fluorophores used in hybridization assays nowadays, thus AzaPc may serve as universal dark quenchers. The aim of this study was to prepare an AzaPc, that will be possible to attach inside an oligonucleotide strand. Furthermore, a planar moiety bounded to AzaPc will intercalate into DNA and improve the strength of binding of the probe to DNA. First, the...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placeHradec Královécs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra biofyziky a fyzikální chemiecs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV