Show simple item record

Význam nabitých reziduí pro aktivaci a modulaci iontového kanálu TRPA1
dc.contributor.advisorVlachová, Viktorie
dc.creatorZímová, Lucie
dc.date.accessioned2021-01-15T16:00:24Z
dc.date.available2021-01-15T16:00:24Z
dc.date.issued2015
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/82645
dc.description.abstractDůležitým receptorem pro detekci bolestivých podnětů je iontový kanál TRPA1 exprimovaný na periferních zakončeních nociceptivních neuronů, kde slouží k převodu fyzikálních a chemických signálů z okolí na signalizaci nervové soustavy. Snaha porozumět mechanizmům aktivace TRPA1 na molekulární úrovni je vedená snahou najít vhodné přístupy k léčení chronických bolestivých stavů u člověka. Naše práce se zaměřila na C-koncovou cytoplazmatickou doménu TRPA1 receptoru, kde jsme popsali možné vazebné místo pro vápník, který je nejdůležitějším modulátorem TRPA1. Díky kombinaci homologního modelování a molekulárně dynamických simulací s elektrofyziologickým měřením se nám podařilo navrhnout hypotézu, která vysvětluje molekulární podstatu dědičného bolestivého syndromu způsobeného bodovou mutací TRPA1. K objasnění principu napěťové aktivace tohoto receptoru jsme přispěli popisem aminokyselin na proximálním C-konci a v S4-S5 oblasti transmembránové domény, které se na napěťové aktivaci podílí. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)cs_CZ
dc.description.abstractImportant receptor for sensing painful stimuli is ion channel TRPA1, which is expressed in peripheral endings of nociceptive neurons, where it serves as transducer of physical and chemical environmental signals to the language of the nervous system. The effort to understand the mechanisms of its activity on a molecular level is driven by the vision of progress in treatment of chronic pain in humans. Our work focused on C-terminal cytoplasmic domain of TRPA1 receptor, where we described i.a. the probable binding site for calcium, which is the most important TRPA1 modulator. Using the combination of homology modeling and molecular dynamic simulations with electrophysiological measurements we were able to explain molecular basis of familial pain syndrome caused by TRPA1 point mutation. We contributed to the understanding of the TRPA1 voltage-dependent activation mechanism by describing the amino acids in proximal C-terminus and in S4-S5 linker of transmembrane domain that are directly involved in voltage-dependent gating. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.subjectTransient receptor potential ankyrin (TRPA)en_US
dc.subjectC-terminal domainen_US
dc.subjectstructurefunction relationshipen_US
dc.subjectvoltage-dependent gatingen_US
dc.subjectcalcium modulationen_US
dc.subjectAnkyrinový receptor (TRPA)cs_CZ
dc.subjectC-terminální doménacs_CZ
dc.subjectstrukturně-funkční vztahcs_CZ
dc.subjectnapěťově závislé vrátkovánícs_CZ
dc.subjectmodulace vápníkemcs_CZ
dc.titleThe role of charged residues in the activation and modulation of the TRPA1 ion channelen_US
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2015
dcterms.dateAccepted2015-09-17
dc.description.facultyMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Mathematics and Physicsen_US
dc.identifier.repId71598
dc.title.translatedVýznam nabitých reziduí pro aktivaci a modulaci iontového kanálu TRPA1cs_CZ
dc.contributor.refereeDoležal, Vladimír
dc.contributor.refereeRokyta, Richard
dc.identifier.aleph002028672
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiophysics, Chemical and Macromolecular Physicsen_US
thesis.degree.disciplineBiofyzika, chemická a makromolekulární fyzikacs_CZ
thesis.degree.programPhysicsen_US
thesis.degree.programFyzikacs_CZ
uk.thesis.typedizertační prácecs_CZ
uk.faculty-name.csMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Mathematics and Physicsen_US
uk.faculty-abbr.csMFFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiofyzika, chemická a makromolekulární fyzikacs_CZ
uk.degree-discipline.enBiophysics, Chemical and Macromolecular Physicsen_US
uk.degree-program.csFyzikacs_CZ
uk.degree-program.enPhysicsen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.csDůležitým receptorem pro detekci bolestivých podnětů je iontový kanál TRPA1 exprimovaný na periferních zakončeních nociceptivních neuronů, kde slouží k převodu fyzikálních a chemických signálů z okolí na signalizaci nervové soustavy. Snaha porozumět mechanizmům aktivace TRPA1 na molekulární úrovni je vedená snahou najít vhodné přístupy k léčení chronických bolestivých stavů u člověka. Naše práce se zaměřila na C-koncovou cytoplazmatickou doménu TRPA1 receptoru, kde jsme popsali možné vazebné místo pro vápník, který je nejdůležitějším modulátorem TRPA1. Díky kombinaci homologního modelování a molekulárně dynamických simulací s elektrofyziologickým měřením se nám podařilo navrhnout hypotézu, která vysvětluje molekulární podstatu dědičného bolestivého syndromu způsobeného bodovou mutací TRPA1. K objasnění principu napěťové aktivace tohoto receptoru jsme přispěli popisem aminokyselin na proximálním C-konci a v S4-S5 oblasti transmembránové domény, které se na napěťové aktivaci podílí. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)cs_CZ
uk.abstract.enImportant receptor for sensing painful stimuli is ion channel TRPA1, which is expressed in peripheral endings of nociceptive neurons, where it serves as transducer of physical and chemical environmental signals to the language of the nervous system. The effort to understand the mechanisms of its activity on a molecular level is driven by the vision of progress in treatment of chronic pain in humans. Our work focused on C-terminal cytoplasmic domain of TRPA1 receptor, where we described i.a. the probable binding site for calcium, which is the most important TRPA1 modulator. Using the combination of homology modeling and molecular dynamic simulations with electrophysiological measurements we were able to explain molecular basis of familial pain syndrome caused by TRPA1 point mutation. We contributed to the understanding of the TRPA1 voltage-dependent activation mechanism by describing the amino acids in proximal C-terminus and in S4-S5 linker of transmembrane domain that are directly involved in voltage-dependent gating. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultacs_CZ
thesis.grade.codeP
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO
uk.departmentExternal.nameFyziologický ústav AV ČR, v.v.i.cs
dc.identifier.lisID990020286720106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2025 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV