Show simple item record

Rozpoznávání mikrobiálních vzorů u žížal
dc.contributor.advisorBilej, Martin
dc.creatorŠkanta, František
dc.date.accessioned2019-05-03T20:16:28Z
dc.date.available2019-05-03T20:16:28Z
dc.date.issued2016
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/82419
dc.description.abstractSurvival of earthworms in the environment depends on their ability to recognize and eliminate potential pathogens. Two closely related earthworm species Eisenia andrei and Eisenia fetida inhabit different environment with specific microbiota. Both species can be reliably determined using of species-specific primers for cytochrome c oxidase I (COI) and stringent PCR conditions. Whereas, we did not observed any substantial differences in the expression and activity of CCF and lysozyme upon microbial challenge, the expression as well as the hemolytic activity of fetidin/lysenins was considerably higher in E. andrei as compared to E. fetida. Genomic DNA analyses revealed significantly higher level of fetidin/lysenins in E. andrei compared to E. fetida suggesting hypothetical gene duplication. Earthworms live in permanent close contact with microbial environment. Coelom cavity as well as the gut of E. andrei earthvworm differs in the number of bacteria. The number of bacteria in the gut is more than six time higher than in coelomic fluid. High microbial load of E. coli O55, B. subtilis W23, and S. cerevisiae S288 in the earthworm environment, resulted in an increase of microorganisms in both, the coelom and the gut. The changes in mRNA levels of defense molecules (pattern recognition receptors CCF,...en_US
dc.description.abstract1 Abstrakt Přežití žížal v prostředí závisí na jejich schopnosti rozpoznat a zlikvidovat potenciální patogeny. V této práci jsme se zaměřili na studium imunity dvou blízce příbuzných druhů žížal Eisenia andrei a Eisenia fetida, žijících v rozdílném životním prostředí se specifickou mikroflórou. Zatímco E. andrei žije v kompostu, E. fetida se vyskytuje v lesní hrabance, kde je množství a rozmanitost půdní mikroflóry řádově nižší. Oba druhy lze spolehlivě odlišit s použitím druhově specifických primerů pro gen kódující cytochrom c oxidázu I (COI) při dodržení přísných podmínek PCR. Po vzájemné zkřížené mikrobiální stimulaci jsme nepozorovali velké rozdíly v aktivitě a ani v expresi genů kódujících CCF a lysozym. Hemolytická aktivita fetidinu/lyseninu však byla výrazně vyšší u E. andrei než u E. fetida. Genomová analýza DNA také prokázala výrazně vyšší hodnotu v počtu kopií fetidinu/lyseninu v genomu E. andrei ve srovnání s E. fetida, což naznačuje hypotetickou genovou duplicitu. Žížaly žijí v neustálém úzkém kontaktu s mikrobiálním prostředím. Coelomová tekutina, stejně jako střevo žížaly E. andrei obsahuje mikroorganismy, jejichž množství se však liší. Počet bakterií ve střevě je více než šestkrát vyšší než v coelomové tekutině. Stimulace mikroorganismy E. coli O55, B. subtilis W23 nebo S. cerevisiae S288,...cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleRecognition of microbial patterns in earthwormsen_US
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2016
dcterms.dateAccepted2016-09-22
dc.description.departmentDepartment of Cell Biologyen_US
dc.description.departmentKatedra buněčné biologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId84758
dc.title.translatedRozpoznávání mikrobiálních vzorů u žížalcs_CZ
dc.contributor.refereeKopečný, Jan
dc.contributor.refereeŠimek, Miloslav
dc.identifier.aleph002105513
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.discipline-cs_CZ
thesis.degree.discipline-en_US
thesis.degree.programMikrobiologiecs_CZ
thesis.degree.programMicrobiologyen_US
uk.thesis.typedizertační prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra buněčné biologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Cell Biologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.cs-cs_CZ
uk.degree-discipline.en-en_US
uk.degree-program.csMikrobiologiecs_CZ
uk.degree-program.enMicrobiologyen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.cs1 Abstrakt Přežití žížal v prostředí závisí na jejich schopnosti rozpoznat a zlikvidovat potenciální patogeny. V této práci jsme se zaměřili na studium imunity dvou blízce příbuzných druhů žížal Eisenia andrei a Eisenia fetida, žijících v rozdílném životním prostředí se specifickou mikroflórou. Zatímco E. andrei žije v kompostu, E. fetida se vyskytuje v lesní hrabance, kde je množství a rozmanitost půdní mikroflóry řádově nižší. Oba druhy lze spolehlivě odlišit s použitím druhově specifických primerů pro gen kódující cytochrom c oxidázu I (COI) při dodržení přísných podmínek PCR. Po vzájemné zkřížené mikrobiální stimulaci jsme nepozorovali velké rozdíly v aktivitě a ani v expresi genů kódujících CCF a lysozym. Hemolytická aktivita fetidinu/lyseninu však byla výrazně vyšší u E. andrei než u E. fetida. Genomová analýza DNA také prokázala výrazně vyšší hodnotu v počtu kopií fetidinu/lyseninu v genomu E. andrei ve srovnání s E. fetida, což naznačuje hypotetickou genovou duplicitu. Žížaly žijí v neustálém úzkém kontaktu s mikrobiálním prostředím. Coelomová tekutina, stejně jako střevo žížaly E. andrei obsahuje mikroorganismy, jejichž množství se však liší. Počet bakterií ve střevě je více než šestkrát vyšší než v coelomové tekutině. Stimulace mikroorganismy E. coli O55, B. subtilis W23 nebo S. cerevisiae S288,...cs_CZ
uk.abstract.enSurvival of earthworms in the environment depends on their ability to recognize and eliminate potential pathogens. Two closely related earthworm species Eisenia andrei and Eisenia fetida inhabit different environment with specific microbiota. Both species can be reliably determined using of species-specific primers for cytochrome c oxidase I (COI) and stringent PCR conditions. Whereas, we did not observed any substantial differences in the expression and activity of CCF and lysozyme upon microbial challenge, the expression as well as the hemolytic activity of fetidin/lysenins was considerably higher in E. andrei as compared to E. fetida. Genomic DNA analyses revealed significantly higher level of fetidin/lysenins in E. andrei compared to E. fetida suggesting hypothetical gene duplication. Earthworms live in permanent close contact with microbial environment. Coelom cavity as well as the gut of E. andrei earthvworm differs in the number of bacteria. The number of bacteria in the gut is more than six time higher than in coelomic fluid. High microbial load of E. coli O55, B. subtilis W23, and S. cerevisiae S288 in the earthworm environment, resulted in an increase of microorganisms in both, the coelom and the gut. The changes in mRNA levels of defense molecules (pattern recognition receptors CCF,...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra buněčné biologiecs_CZ
thesis.grade.codeP


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV