dc.contributor.advisor | Svoboda, David | |
dc.creator | Starosta, Jakub | |
dc.date.accessioned | 2017-06-02T04:10:43Z | |
dc.date.available | 2017-06-02T04:10:43Z | |
dc.date.issued | 2016 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11956/82244 | |
dc.description.abstract | Hlavním cílem studie bylo najít rozdíly v ekologii a v produkci sekundárních metabolitů v různých populacích lišejníku Physconia muscigena a zjistit, zda je druh dobře definován i chemicky a molekulárně. Pro studii jsem použil hlavně populace z Evropy a Kanady. Pro rekonstrukci fylogenetických stromů jsem využil data ze tří sekvenovaných úseků DNA (ITS rDNA, mtSSU rDNA a TEF1). Dalším cílem studie bylo zjistit taxonomické postavení blízce příbuzných druhů P. muscigena, P. bayeri, P. rossica, a P. isidiomuscigena. Vzhledem ke vzácnosti P. muscigena a P. bayeri na našem území jsem prozkoumal i všechny historické lokality, kde byl druh v minulosti z ČR udáván. Výsledky ukázaly, že (1) sekvenační data z úseků ITS rDNA a TEF1 ukazují velikou vnitrodruhovou variabilitu u populací P. muscigena. S touto variabilitou nekoreluje geografické rozložení populací ani chemie stélek, (2) druh Physconia bayeri popsaný v roce 1947 J. Nádvorníkem je synonymní s druhem P. muscigena, (3) některé položky P. muscigena obsahují zatím neurčený sekundární metabolit, (4) P. muscigena se v současné době vyskytuje pouze na třech lokalitách v ČR. Klíčová slova: Physconia muscigena, Physconia bayeri, vnitrodruhová variabilita, taxonomie, TEF1, ITS rDNA, mtSSU | cs_CZ |
dc.description.abstract | The principal goal of my study was to find if ecologically and chemically different populations of lichens in the Physconia muscigena (Ach.) Poelt group belong to several species or a single one. This study focused on the molecular and chemical investigations of mostly European and Canadian populations. I use sequence data from three genes (ITS rDNA, mtSSU rDNA and TEF1) for the reconstruction of phylogenetic trees. I investigate phylogenetic relationships among the closely related species P. muscigena, P. bayeri, P. rossica, and P. isidiomuscigena. Also, I wanted to detect any possible geographical or ecological trends among chemotypes and haplotypes. As an additional goal I checked the recent localities of P. muscigena in the Czech Republic for valorising its conservation status. Results show that: (1) sequenced data of ITS rDNA and TEF1 show high intraspecific variability in P. muscigena samples. This genetic variability does not correlate neither with geographical distribution nor thallus chemistry; (2) P. bayeri is synonymous with P. muscigena; (3) some samples P. muscigena contain new undetermined secondary metabolite, (4) Physconia muscigena has only three recent localities in Czech Republic. Key words: Physconia muscigena, Physconia bayeri, infraspecific variability, taxonomy, TEF1, ITS... | en_US |
dc.language | Čeština | cs_CZ |
dc.language.iso | cs_CZ | |
dc.publisher | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.subject | Physconia muscigena | cs_CZ |
dc.subject | Physconia bayeri | cs_CZ |
dc.subject | vnitrodruhová variabilita | cs_CZ |
dc.subject | taxonomie | cs_CZ |
dc.subject | TEF1 | cs_CZ |
dc.subject | ITS rDNA | cs_CZ |
dc.subject | mtSSU | cs_CZ |
dc.subject | Physconia muscigena | en_US |
dc.subject | Physconia bayeri | en_US |
dc.subject | infraspecific variability | en_US |
dc.subject | taxonomy | en_US |
dc.subject | TEF1 | en_US |
dc.subject | ITS rDNA | en_US |
dc.subject | mtSSU | en_US |
dc.title | Taxonomická studie okruhu terčovníku Physconia muscigena | cs_CZ |
dc.type | diplomová práce | cs_CZ |
dcterms.created | 2016 | |
dcterms.dateAccepted | 2016-09-15 | |
dc.description.department | Department of Botany | en_US |
dc.description.department | Katedra botaniky | cs_CZ |
dc.description.faculty | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.description.faculty | Faculty of Science | en_US |
dc.identifier.repId | 115999 | |
dc.title.translated | A taxonomic study of Physconia muscigena group | en_US |
dc.contributor.referee | Šoun, Jaroslav | |
dc.identifier.aleph | 002104742 | |
thesis.degree.name | Mgr. | |
thesis.degree.level | navazující magisterské | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Botanika | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Botany | en_US |
thesis.degree.program | Biologie | cs_CZ |
thesis.degree.program | Biology | en_US |
uk.thesis.type | diplomová práce | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-cs | Přírodovědecká fakulta::Katedra botaniky | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-en | Faculty of Science::Department of Botany | en_US |
uk.faculty-name.cs | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
uk.faculty-name.en | Faculty of Science | en_US |
uk.faculty-abbr.cs | PřF | cs_CZ |
uk.degree-discipline.cs | Botanika | cs_CZ |
uk.degree-discipline.en | Botany | en_US |
uk.degree-program.cs | Biologie | cs_CZ |
uk.degree-program.en | Biology | en_US |
thesis.grade.cs | Velmi dobře | cs_CZ |
thesis.grade.en | Very good | en_US |
uk.abstract.cs | Hlavním cílem studie bylo najít rozdíly v ekologii a v produkci sekundárních metabolitů v různých populacích lišejníku Physconia muscigena a zjistit, zda je druh dobře definován i chemicky a molekulárně. Pro studii jsem použil hlavně populace z Evropy a Kanady. Pro rekonstrukci fylogenetických stromů jsem využil data ze tří sekvenovaných úseků DNA (ITS rDNA, mtSSU rDNA a TEF1). Dalším cílem studie bylo zjistit taxonomické postavení blízce příbuzných druhů P. muscigena, P. bayeri, P. rossica, a P. isidiomuscigena. Vzhledem ke vzácnosti P. muscigena a P. bayeri na našem území jsem prozkoumal i všechny historické lokality, kde byl druh v minulosti z ČR udáván. Výsledky ukázaly, že (1) sekvenační data z úseků ITS rDNA a TEF1 ukazují velikou vnitrodruhovou variabilitu u populací P. muscigena. S touto variabilitou nekoreluje geografické rozložení populací ani chemie stélek, (2) druh Physconia bayeri popsaný v roce 1947 J. Nádvorníkem je synonymní s druhem P. muscigena, (3) některé položky P. muscigena obsahují zatím neurčený sekundární metabolit, (4) P. muscigena se v současné době vyskytuje pouze na třech lokalitách v ČR. Klíčová slova: Physconia muscigena, Physconia bayeri, vnitrodruhová variabilita, taxonomie, TEF1, ITS rDNA, mtSSU | cs_CZ |
uk.abstract.en | The principal goal of my study was to find if ecologically and chemically different populations of lichens in the Physconia muscigena (Ach.) Poelt group belong to several species or a single one. This study focused on the molecular and chemical investigations of mostly European and Canadian populations. I use sequence data from three genes (ITS rDNA, mtSSU rDNA and TEF1) for the reconstruction of phylogenetic trees. I investigate phylogenetic relationships among the closely related species P. muscigena, P. bayeri, P. rossica, and P. isidiomuscigena. Also, I wanted to detect any possible geographical or ecological trends among chemotypes and haplotypes. As an additional goal I checked the recent localities of P. muscigena in the Czech Republic for valorising its conservation status. Results show that: (1) sequenced data of ITS rDNA and TEF1 show high intraspecific variability in P. muscigena samples. This genetic variability does not correlate neither with geographical distribution nor thallus chemistry; (2) P. bayeri is synonymous with P. muscigena; (3) some samples P. muscigena contain new undetermined secondary metabolite, (4) Physconia muscigena has only three recent localities in Czech Republic. Key words: Physconia muscigena, Physconia bayeri, infraspecific variability, taxonomy, TEF1, ITS... | en_US |
uk.file-availability | V | |
uk.publication.place | Praha | cs_CZ |
uk.grantor | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra botaniky | cs_CZ |
dc.identifier.lisID | 990021047420106986 | |