Show simple item record

A taxonomic study of Physconia muscigena group
dc.contributor.advisorSvoboda, David
dc.creatorStarosta, Jakub
dc.date.accessioned2017-06-02T04:10:43Z
dc.date.available2017-06-02T04:10:43Z
dc.date.issued2016
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/82244
dc.description.abstractHlavním cílem studie bylo najít rozdíly v ekologii a v produkci sekundárních metabolitů v různých populacích lišejníku Physconia muscigena a zjistit, zda je druh dobře definován i chemicky a molekulárně. Pro studii jsem použil hlavně populace z Evropy a Kanady. Pro rekonstrukci fylogenetických stromů jsem využil data ze tří sekvenovaných úseků DNA (ITS rDNA, mtSSU rDNA a TEF1). Dalším cílem studie bylo zjistit taxonomické postavení blízce příbuzných druhů P. muscigena, P. bayeri, P. rossica, a P. isidiomuscigena. Vzhledem ke vzácnosti P. muscigena a P. bayeri na našem území jsem prozkoumal i všechny historické lokality, kde byl druh v minulosti z ČR udáván. Výsledky ukázaly, že (1) sekvenační data z úseků ITS rDNA a TEF1 ukazují velikou vnitrodruhovou variabilitu u populací P. muscigena. S touto variabilitou nekoreluje geografické rozložení populací ani chemie stélek, (2) druh Physconia bayeri popsaný v roce 1947 J. Nádvorníkem je synonymní s druhem P. muscigena, (3) některé položky P. muscigena obsahují zatím neurčený sekundární metabolit, (4) P. muscigena se v současné době vyskytuje pouze na třech lokalitách v ČR. Klíčová slova: Physconia muscigena, Physconia bayeri, vnitrodruhová variabilita, taxonomie, TEF1, ITS rDNA, mtSSUcs_CZ
dc.description.abstractThe principal goal of my study was to find if ecologically and chemically different populations of lichens in the Physconia muscigena (Ach.) Poelt group belong to several species or a single one. This study focused on the molecular and chemical investigations of mostly European and Canadian populations. I use sequence data from three genes (ITS rDNA, mtSSU rDNA and TEF1) for the reconstruction of phylogenetic trees. I investigate phylogenetic relationships among the closely related species P. muscigena, P. bayeri, P. rossica, and P. isidiomuscigena. Also, I wanted to detect any possible geographical or ecological trends among chemotypes and haplotypes. As an additional goal I checked the recent localities of P. muscigena in the Czech Republic for valorising its conservation status. Results show that: (1) sequenced data of ITS rDNA and TEF1 show high intraspecific variability in P. muscigena samples. This genetic variability does not correlate neither with geographical distribution nor thallus chemistry; (2) P. bayeri is synonymous with P. muscigena; (3) some samples P. muscigena contain new undetermined secondary metabolite, (4) Physconia muscigena has only three recent localities in Czech Republic. Key words: Physconia muscigena, Physconia bayeri, infraspecific variability, taxonomy, TEF1, ITS...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectPhysconia muscigenacs_CZ
dc.subjectPhysconia bayerics_CZ
dc.subjectvnitrodruhová variabilitacs_CZ
dc.subjecttaxonomiecs_CZ
dc.subjectTEF1cs_CZ
dc.subjectITS rDNAcs_CZ
dc.subjectmtSSUcs_CZ
dc.subjectPhysconia muscigenaen_US
dc.subjectPhysconia bayerien_US
dc.subjectinfraspecific variabilityen_US
dc.subjecttaxonomyen_US
dc.subjectTEF1en_US
dc.subjectITS rDNAen_US
dc.subjectmtSSUen_US
dc.titleTaxonomická studie okruhu terčovníku Physconia muscigenacs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2016
dcterms.dateAccepted2016-09-15
dc.description.departmentDepartment of Botanyen_US
dc.description.departmentKatedra botanikycs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId115999
dc.title.translatedA taxonomic study of Physconia muscigena groupen_US
dc.contributor.refereeŠoun, Jaroslav
dc.identifier.aleph002104742
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBotanikacs_CZ
thesis.degree.disciplineBotanyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra botanikycs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Botanyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBotanikacs_CZ
uk.degree-discipline.enBotanyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVelmi dobřecs_CZ
thesis.grade.enVery gooden_US
uk.abstract.csHlavním cílem studie bylo najít rozdíly v ekologii a v produkci sekundárních metabolitů v různých populacích lišejníku Physconia muscigena a zjistit, zda je druh dobře definován i chemicky a molekulárně. Pro studii jsem použil hlavně populace z Evropy a Kanady. Pro rekonstrukci fylogenetických stromů jsem využil data ze tří sekvenovaných úseků DNA (ITS rDNA, mtSSU rDNA a TEF1). Dalším cílem studie bylo zjistit taxonomické postavení blízce příbuzných druhů P. muscigena, P. bayeri, P. rossica, a P. isidiomuscigena. Vzhledem ke vzácnosti P. muscigena a P. bayeri na našem území jsem prozkoumal i všechny historické lokality, kde byl druh v minulosti z ČR udáván. Výsledky ukázaly, že (1) sekvenační data z úseků ITS rDNA a TEF1 ukazují velikou vnitrodruhovou variabilitu u populací P. muscigena. S touto variabilitou nekoreluje geografické rozložení populací ani chemie stélek, (2) druh Physconia bayeri popsaný v roce 1947 J. Nádvorníkem je synonymní s druhem P. muscigena, (3) některé položky P. muscigena obsahují zatím neurčený sekundární metabolit, (4) P. muscigena se v současné době vyskytuje pouze na třech lokalitách v ČR. Klíčová slova: Physconia muscigena, Physconia bayeri, vnitrodruhová variabilita, taxonomie, TEF1, ITS rDNA, mtSSUcs_CZ
uk.abstract.enThe principal goal of my study was to find if ecologically and chemically different populations of lichens in the Physconia muscigena (Ach.) Poelt group belong to several species or a single one. This study focused on the molecular and chemical investigations of mostly European and Canadian populations. I use sequence data from three genes (ITS rDNA, mtSSU rDNA and TEF1) for the reconstruction of phylogenetic trees. I investigate phylogenetic relationships among the closely related species P. muscigena, P. bayeri, P. rossica, and P. isidiomuscigena. Also, I wanted to detect any possible geographical or ecological trends among chemotypes and haplotypes. As an additional goal I checked the recent localities of P. muscigena in the Czech Republic for valorising its conservation status. Results show that: (1) sequenced data of ITS rDNA and TEF1 show high intraspecific variability in P. muscigena samples. This genetic variability does not correlate neither with geographical distribution nor thallus chemistry; (2) P. bayeri is synonymous with P. muscigena; (3) some samples P. muscigena contain new undetermined secondary metabolite, (4) Physconia muscigena has only three recent localities in Czech Republic. Key words: Physconia muscigena, Physconia bayeri, infraspecific variability, taxonomy, TEF1, ITS...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra botanikycs_CZ
dc.identifier.lisID990021047420106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV