dc.contributor.advisor | Hirsch, Ivan | |
dc.creator | Hofman, Tomáš | |
dc.date.accessioned | 2017-06-01T17:55:29Z | |
dc.date.available | 2017-06-01T17:55:29Z | |
dc.date.issued | 2016 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11956/79945 | |
dc.description.abstract | Virus hepatitidy B vytváří v jádrech infikovaných hepatocytů stabilní cccDNA odolnou vůči degradaci se schopností perzistence po mnoho let. Hlavní roli v perzistenci cccDNA hrají epigenetické mechanismy regulující transkripci a replikaci v různých fázích infekce. Mezi hlavní regulační epigenetické mechanismy HBV patří metylace CpG ostrovů, acetylace a metylace cccDNA vazných histonů a RNA interference. Metylace CpG je spojena s interakcí kapsidového proteinu, jehož vazba na cccDNA podporuje transkripci a odlišuje tak strukturně virový genom od hostitelského. X protein kromě metylace CpG ovlivňuje hlavně histonové modifikace interakcí s hostitelskými proteiny, čímž je schopen vyřadit inhibiční vlivy a podpořit virovou transkripci aktivačními modifikacemi. Tato práce shrnuje dosavadní poznatky týkající se epigenetické regulace cccDNA. Klíčová slova: HBV, cccDNA, replikace a transkripce HBV DNA, histonové modifikace, metylace CpG, CpG ostrovy, HBx, HBc, IFNα, IL-6 | cs_CZ |
dc.description.abstract | The hepatitis B virus forms in a nuclei of infected hepatocytes a stable cccDNA resistant to degradation and capable to persist for many years. The main role in the persistence of cccDNA play the epigenetic mechanisms that regulates viral transcription and replication in various stages of the infection. Major epigenetic mechanisms involved in the regulation of HBV include CpG islands methylation, cccDNA-bound histone acetylation and methylation and RNA interference. CpG methylation is associated with the activity of capsid protein, which binds to the cccDNA and promotes transcription and structurally distinguishes viral and the host genome. HBx protein besides CpG methylation mainly affects histone modifications via its interaction with host proteins and thus eliminates the inhibitory effects and promotes the active modifications favoring virus transcription. This work summarizes current knowledges concerning the cccDNA epigenetic regulation. Keywords: HBV, cccDNA, replication and transcription of HBV DNA, histone modifications, methylation of CpG, CpG islands, HBx, HBc, IFNα, IL-6 | en_US |
dc.language | Čeština | cs_CZ |
dc.language.iso | cs_CZ | |
dc.publisher | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.subject | virus hepatitidy B (HBV) | cs_CZ |
dc.subject | kovalentně uzavřená kruhová DNA HBV (cccDNA) | cs_CZ |
dc.subject | replikace a transkripce HBV DNA | cs_CZ |
dc.subject | histonové modifikace | cs_CZ |
dc.subject | metylace CpG | cs_CZ |
dc.subject | CpG ostrovy | cs_CZ |
dc.subject | protein X HBV (HBx) | cs_CZ |
dc.subject | kapsidový protein HBV (HBc) | cs_CZ |
dc.subject | interferon alfa (IFNα) | cs_CZ |
dc.subject | interleukin 6 (IL-6) | cs_CZ |
dc.subject | hepatitis B virus (HBV) | en_US |
dc.subject | covalently closed circular HBV DNA (cccDNA) | en_US |
dc.subject | replication and transcription of HBV DNA | en_US |
dc.subject | histone modifications | en_US |
dc.subject | CpG methylation | en_US |
dc.subject | CpG islands | en_US |
dc.subject | HBV protein X (HBx) | en_US |
dc.subject | HBV capsid protein (HBc) | en_US |
dc.subject | interferon alpha (IFNα) | en_US |
dc.subject | interleukin 6 (IL-6) | en_US |
dc.title | Vliv epigenetických modifikací na replikaci a transkripci DNA viru hepatitidy B | cs_CZ |
dc.type | bakalářská práce | cs_CZ |
dcterms.created | 2016 | |
dcterms.dateAccepted | 2016-06-07 | |
dc.description.department | Department of Genetics and Microbiology | en_US |
dc.description.department | Katedra genetiky a mikrobiologie | cs_CZ |
dc.description.faculty | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.description.faculty | Faculty of Science | en_US |
dc.identifier.repId | 171298 | |
dc.title.translated | Effect of epigenetic modifications on replication and transcription of hepatitis B virus DNA | en_US |
dc.contributor.referee | Roučová, Kristina | |
dc.identifier.aleph | 002092055 | |
thesis.degree.name | Bc. | |
thesis.degree.level | bakalářské | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Molekulární biologie a biochemie organismů | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Molecular Biology and Biochemistry of Organisms | en_US |
thesis.degree.program | Speciální chemicko-biologické obory | cs_CZ |
thesis.degree.program | Special Chemical and Biological Programmes | en_US |
uk.thesis.type | bakalářská práce | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-cs | Přírodovědecká fakulta::Katedra genetiky a mikrobiologie | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-en | Faculty of Science::Department of Genetics and Microbiology | en_US |
uk.faculty-name.cs | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
uk.faculty-name.en | Faculty of Science | en_US |
uk.faculty-abbr.cs | PřF | cs_CZ |
uk.degree-discipline.cs | Molekulární biologie a biochemie organismů | cs_CZ |
uk.degree-discipline.en | Molecular Biology and Biochemistry of Organisms | en_US |
uk.degree-program.cs | Speciální chemicko-biologické obory | cs_CZ |
uk.degree-program.en | Special Chemical and Biological Programmes | en_US |
thesis.grade.cs | Výborně | cs_CZ |
thesis.grade.en | Excellent | en_US |
uk.abstract.cs | Virus hepatitidy B vytváří v jádrech infikovaných hepatocytů stabilní cccDNA odolnou vůči degradaci se schopností perzistence po mnoho let. Hlavní roli v perzistenci cccDNA hrají epigenetické mechanismy regulující transkripci a replikaci v různých fázích infekce. Mezi hlavní regulační epigenetické mechanismy HBV patří metylace CpG ostrovů, acetylace a metylace cccDNA vazných histonů a RNA interference. Metylace CpG je spojena s interakcí kapsidového proteinu, jehož vazba na cccDNA podporuje transkripci a odlišuje tak strukturně virový genom od hostitelského. X protein kromě metylace CpG ovlivňuje hlavně histonové modifikace interakcí s hostitelskými proteiny, čímž je schopen vyřadit inhibiční vlivy a podpořit virovou transkripci aktivačními modifikacemi. Tato práce shrnuje dosavadní poznatky týkající se epigenetické regulace cccDNA. Klíčová slova: HBV, cccDNA, replikace a transkripce HBV DNA, histonové modifikace, metylace CpG, CpG ostrovy, HBx, HBc, IFNα, IL-6 | cs_CZ |
uk.abstract.en | The hepatitis B virus forms in a nuclei of infected hepatocytes a stable cccDNA resistant to degradation and capable to persist for many years. The main role in the persistence of cccDNA play the epigenetic mechanisms that regulates viral transcription and replication in various stages of the infection. Major epigenetic mechanisms involved in the regulation of HBV include CpG islands methylation, cccDNA-bound histone acetylation and methylation and RNA interference. CpG methylation is associated with the activity of capsid protein, which binds to the cccDNA and promotes transcription and structurally distinguishes viral and the host genome. HBx protein besides CpG methylation mainly affects histone modifications via its interaction with host proteins and thus eliminates the inhibitory effects and promotes the active modifications favoring virus transcription. This work summarizes current knowledges concerning the cccDNA epigenetic regulation. Keywords: HBV, cccDNA, replication and transcription of HBV DNA, histone modifications, methylation of CpG, CpG islands, HBx, HBc, IFNα, IL-6 | en_US |
uk.file-availability | V | |
uk.publication.place | Praha | cs_CZ |
uk.grantor | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologie | cs_CZ |
dc.identifier.lisID | 990020920550106986 | |