Koimunoprecipitace jako nástroj pro studium interakcí DHRS7 enzymu s proteiny

Abstract

Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidát: Dominika Fassmannová Školitel: RNDr. Lucie Zemanová, Ph.D. Název diplomové práce: Koimunoprecipitace jako nástroj pro studium interakcí enzymu DHRS7 s proteiny DHRS7 enzym je člen nadrodiny enzymů dehydrogenáz/reduktáz s krátkým řetězcem. Enzym se in vitro chová jako NADPH-dependentní reduktáza s katalytickou aktivitu pro některé endogenní sloučeniny obsahující karbonylovou skupinu, zahrnující androstendion nebo trans-retinal. Vykazuje také úzkou homologii s enzymem 11β-hydroxysteroiddehydrogenáza 1. Fyziologická funkce DHRS7 je zatím neznámá a úroveň poznání enzymu velmi nízká. V poslední době se objevují informace o roli DHRS7 v některých onemocnění, např. v rakovině prostaty nebo v inzulínové rezistenci. Role málo charakterizovaného enzymu DHRS7 může být poodhalena na základě znalosti jeho interakčních partnerů, protože proteiny v buňce obvykle nepracují samy, ale jsou součástí obrovského proteinového komplexu, označeného jako "interactome". Poznání takových interakcí nám pomáhá porozumět funkci a regulaci proteinů uvnitř buněk nebo organismu. Cílem této studie je výzkum proteinů interagujících s DHRS7 pomocí metody koimunoprecipice. Imunoprecipitace byla zavedena s využitím dostupné protilátky...

Charles University in Prague Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Dominika Fassmannová Supervisor: RNDr. Lucie Zemanová, Ph.D. Title of diploma thesis: Co-immunoprecipitace as a tool for the study of protein-protein interactions of DHRS7 enzyme DHRS7 enzyme is a member of short-chain dehydrogenase/reductase superfamily. The enzyme is at least in vitro NADPH-dependent reductase of some substance bearing carbonyl group, including androstenedione or all-trans retinal. DHRS7 is close homolog of well-known 11β-hydroxysteroid dehydrogenase 1. Physiological function of DHRS7 is unknown, the level of the knowledge is quite low. Recently, information about some role of DHRS7 in diseases as prostate cancer or insulin resistance was published. A role of poorly characterized proteins as DHRS7 can be predicted based on evidence of their interaction with a protein with revealed function, because proteins inside cells do not usually work alone, they are part of a huge protein complex known as interactome. Knowledge of such protein-protein interactions help us to understand the function and regulation of the protein inside a cell or organism. The aim of the study is initial investigation of proteins interacting with DHRS7 by co-immunoprecipitation, a basic method for...