Show simple item record

Structural characterization of human Aichi virus RNA replication
dc.contributor.advisorBouřa, Evžen
dc.creatorDubánková, Anna
dc.date.accessioned2017-06-01T02:18:21Z
dc.date.available2017-06-01T02:18:21Z
dc.date.issued2016
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/75650
dc.description.abstractVirové RNA dependentní RNA polymerasy (RdRp) jsou enzymy, které umožňují RNA virům replikovat svůj genom a také připravit mediátorovou RNA pro translaci virových proteinů. Díky své relativní evoluční konzervovanosti jsou RdRp dobrým cílem pro design léčiv. V této práci ukazujeme strukturu RdRp, 3Dpol z Aichi viru, která doposud nebyla vyřešena. Aichi virus je lidský patogen, který způsobuje gastroenteritidu. Aichi virus se také používá jako modelový organismus pro studium příbuzných virů, které jsou svou virulencí mnohem nebezpečnější, jako je Rhinovirus, virus hepatitidy A, SARS, virus hepatitidy C, virus žluté horečky nebo západo-Nilský virus. Kromě strukturní studie 3Dpol z Aichi viru se v této práci zabýváme ověřením hypothesy, podle které se protein 3Dpol váže na membránu skrze fosfatidylinositol 4 fosfát (PI4P z angl. "phosphatidylinositol 4 phosphate") - významný regulační lipid. Membrány bohaté na PI4P vznikají v buňkách po infekci jednovláknovými plus RNA (ssRNA z angl. "single - stranded") viry. V neposlední řadě jsme zkoumali vliv ribonukleotidů na stabilitu proteinu 3Dpol.cs_CZ
dc.description.abstractViral RNA dependent RNA polymerases (RdRps) are enzymes which enable RNA viruses to replicate their genome and to prepare mRNA for translation of viral proteins. Due to its relative evolutionary conservation RdRps are good targets for drug design. In this work we present a structure of the RdRp (3Dpol ) of Aichi virus, which has not been solved yet. Aichi virus is a human pathogen that causes gastroenteritis. Aichi virus is also used as a model organism for studying cognate viruses which virulence is more dangerous, for example: Rhinovirus, Hepatitis A virus, SARS virus, hepatitis C virus, yellow fever, and West-Nile virus. In addition to structural studies of Aichi virus 3Dpol we also tested a previously published hypothesis that, 3Dpol is recruited to the membrane through phosphatidylinositol 4 phosphate (PI4P) - an important regulatory lipid. Membranes highly enriched in PI4P are formed in cells infected by single stranded positive sense RNA (plus ssRNA) viruses. Finally we tested the influence of ribonucleotides on the 3Dpol protein stability. (In Czech)en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectproteincs_CZ
dc.subjectmembránacs_CZ
dc.subjectvazbacs_CZ
dc.subjectproteinen_US
dc.subjectmembraneen_US
dc.subjectbindingen_US
dc.titleStrukturní charakterizace replikace RNA lidského Aichi virucs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2016
dcterms.dateAccepted2016-05-25
dc.description.departmentDepartment of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
dc.description.departmentKatedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId157723
dc.title.translatedStructural characterization of human Aichi virus RNA replicationen_US
dc.contributor.refereeTeisinger, Jan
dc.identifier.aleph002092159
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiofyzikální chemiecs_CZ
thesis.degree.disciplineBiophysical Chemistryen_US
thesis.degree.programChemiecs_CZ
thesis.degree.programChemistryen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiofyzikální chemiecs_CZ
uk.degree-discipline.enBiophysical Chemistryen_US
uk.degree-program.csChemiecs_CZ
uk.degree-program.enChemistryen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csVirové RNA dependentní RNA polymerasy (RdRp) jsou enzymy, které umožňují RNA virům replikovat svůj genom a také připravit mediátorovou RNA pro translaci virových proteinů. Díky své relativní evoluční konzervovanosti jsou RdRp dobrým cílem pro design léčiv. V této práci ukazujeme strukturu RdRp, 3Dpol z Aichi viru, která doposud nebyla vyřešena. Aichi virus je lidský patogen, který způsobuje gastroenteritidu. Aichi virus se také používá jako modelový organismus pro studium příbuzných virů, které jsou svou virulencí mnohem nebezpečnější, jako je Rhinovirus, virus hepatitidy A, SARS, virus hepatitidy C, virus žluté horečky nebo západo-Nilský virus. Kromě strukturní studie 3Dpol z Aichi viru se v této práci zabýváme ověřením hypothesy, podle které se protein 3Dpol váže na membránu skrze fosfatidylinositol 4 fosfát (PI4P z angl. "phosphatidylinositol 4 phosphate") - významný regulační lipid. Membrány bohaté na PI4P vznikají v buňkách po infekci jednovláknovými plus RNA (ssRNA z angl. "single - stranded") viry. V neposlední řadě jsme zkoumali vliv ribonukleotidů na stabilitu proteinu 3Dpol.cs_CZ
uk.abstract.enViral RNA dependent RNA polymerases (RdRps) are enzymes which enable RNA viruses to replicate their genome and to prepare mRNA for translation of viral proteins. Due to its relative evolutionary conservation RdRps are good targets for drug design. In this work we present a structure of the RdRp (3Dpol ) of Aichi virus, which has not been solved yet. Aichi virus is a human pathogen that causes gastroenteritis. Aichi virus is also used as a model organism for studying cognate viruses which virulence is more dangerous, for example: Rhinovirus, Hepatitis A virus, SARS virus, hepatitis C virus, yellow fever, and West-Nile virus. In addition to structural studies of Aichi virus 3Dpol we also tested a previously published hypothesis that, 3Dpol is recruited to the membrane through phosphatidylinositol 4 phosphate (PI4P) - an important regulatory lipid. Membranes highly enriched in PI4P are formed in cells infected by single stranded positive sense RNA (plus ssRNA) viruses. Finally we tested the influence of ribonucleotides on the 3Dpol protein stability. (In Czech)en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
dc.identifier.lisID990020921590106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV