Zobrazit minimální záznam

Úloha translačních elongačních faktorů v dynamice stresových granulí
dc.contributor.advisorHašek, Jiří
dc.creatorHlaváček, Adam
dc.date.accessioned2017-06-01T00:05:24Z
dc.date.available2017-06-01T00:05:24Z
dc.date.issued2015
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/75017
dc.description.abstractTranslační faktor eIF5A se pravděpodobně podílí na iniciaci i elongaci. Existují také zmínky o jeho roli v tvorbě P-bodies. Vzhledem k podobnosti P-bodies a stressových granulí (SGs) jsme se rozhodli otestovat roli eIF5A v dynamice teplem-navozených SGs a jeho důsledky pro zotavení buněk. Pro hodnocení funkce eIF5A v tvorbě SGs byla použita teplotně citlivá (ts) mutanta eIF5A-3 (C39Y/G188D) kultivovaná za permisivní teploty 25řC, s Rpg1-GFP fúzním proteinem jako značkou SGs. Buňky byly vystaveny robustnímu tepelnému šoku 46řC po 10 minut. Schopnost mutovaných buněk přežít byla testována propidium iodidovým barvením a výsevem jednotek tvořících kolonie (CFU). Zjistili jsme, že mutanta eIF5A-3 tvoří teplem navozené SGs, které agregují volněji. To naznačuje, že pro skládání SGs je nutný plně funkční eIF5A. Nicméně mutace nejeví dopad na míru rozpouštění SGs. Testy přežívání ukazují, že mutanta eIF5A-3 je citlivá vůči buněčné smrti obdobně jako WT buňky, avšak její schopnost znovu nastolit proliferaci je znatelně lepší. Pozorovali jsme také ztrátu ts fenotypu eIF5A-3 mutanty. Tyto změny vlastností nebyly způsobeny zpětnou změnou mutované sekvence genů pro eIF5A. Jejich pravděpodobná příčina leží v adaptivní evoluci. Naše výsledky také naznačují účast eIF5A v aktinové dynamice. Navrhujeme, že účast eIF5A v...cs_CZ
dc.description.abstracteIF5A seems to be involved in both, translation initiation and elongation. It was also reported to affect assembly of P-bodies. Given similarities of P-bodies with stress granules (SGs) we decided to test the role of eIF5A in dynamics of heat-induced SGs and its implications for the cell recovery. For the evaluation of eIF5A function in SGs formation was used the temperature- sensitive (ts) mutant eIF5A-3 (C39Y/G118D) cultivated under permissive temperature 25řC and Rpg1-GFP fusion protein as a marker of SGs. The cells were exposed to robust heat shock at 46řC for 10 minutes. The ability of the mutant cells to recover was tested by propidium iodine staining and colony forming units plating. We found that the eIF5A-3 mutant forms heat-induced SGs more loosely aggregated, indicating that the fully functional eIF5A is necessary for SGs assembly. However, it does not seem to affect the rate of SGs dissolution. Survival tests indicate that eIF5A-3 mutant cells are susceptible to dying in a similar way as WT cells; nevertheless, their ability to resume proliferation is significantly better. We also observed a loss of the ts phenotype of the eIF5A-3 mutant. This loss cannot be explained by reversion of mutated eIF5A sequence into normal. Probable cause lies in the adaptive evolution. Our results indicate role of...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjecttranslacecs_CZ
dc.subjectteplotní stresové granulecs_CZ
dc.subjectaktincs_CZ
dc.subjectelongacecs_CZ
dc.subjectfaktorycs_CZ
dc.subjecttranslationen_US
dc.subjectheat stress granulesen_US
dc.subjectactinen_US
dc.subjectelongationen_US
dc.subjectfactorsen_US
dc.titleRole of translational elongation factors in dynamics of stress granules.en_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2015
dcterms.dateAccepted2015-09-14
dc.description.departmentDepartment of Genetics and Microbiologyen_US
dc.description.departmentKatedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId143997
dc.title.translatedÚloha translačních elongačních faktorů v dynamice stresových granulícs_CZ
dc.contributor.refereeJanderová, Blanka
dc.identifier.aleph002029141
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineGenetika, molekulární biologie a virologiecs_CZ
thesis.degree.disciplineGenetics, Molecular Biology and Virologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Genetics and Microbiologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csGenetika, molekulární biologie a virologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enGenetics, Molecular Biology and Virologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csTranslační faktor eIF5A se pravděpodobně podílí na iniciaci i elongaci. Existují také zmínky o jeho roli v tvorbě P-bodies. Vzhledem k podobnosti P-bodies a stressových granulí (SGs) jsme se rozhodli otestovat roli eIF5A v dynamice teplem-navozených SGs a jeho důsledky pro zotavení buněk. Pro hodnocení funkce eIF5A v tvorbě SGs byla použita teplotně citlivá (ts) mutanta eIF5A-3 (C39Y/G188D) kultivovaná za permisivní teploty 25řC, s Rpg1-GFP fúzním proteinem jako značkou SGs. Buňky byly vystaveny robustnímu tepelnému šoku 46řC po 10 minut. Schopnost mutovaných buněk přežít byla testována propidium iodidovým barvením a výsevem jednotek tvořících kolonie (CFU). Zjistili jsme, že mutanta eIF5A-3 tvoří teplem navozené SGs, které agregují volněji. To naznačuje, že pro skládání SGs je nutný plně funkční eIF5A. Nicméně mutace nejeví dopad na míru rozpouštění SGs. Testy přežívání ukazují, že mutanta eIF5A-3 je citlivá vůči buněčné smrti obdobně jako WT buňky, avšak její schopnost znovu nastolit proliferaci je znatelně lepší. Pozorovali jsme také ztrátu ts fenotypu eIF5A-3 mutanty. Tyto změny vlastností nebyly způsobeny zpětnou změnou mutované sekvence genů pro eIF5A. Jejich pravděpodobná příčina leží v adaptivní evoluci. Naše výsledky také naznačují účast eIF5A v aktinové dynamice. Navrhujeme, že účast eIF5A v...cs_CZ
uk.abstract.eneIF5A seems to be involved in both, translation initiation and elongation. It was also reported to affect assembly of P-bodies. Given similarities of P-bodies with stress granules (SGs) we decided to test the role of eIF5A in dynamics of heat-induced SGs and its implications for the cell recovery. For the evaluation of eIF5A function in SGs formation was used the temperature- sensitive (ts) mutant eIF5A-3 (C39Y/G118D) cultivated under permissive temperature 25řC and Rpg1-GFP fusion protein as a marker of SGs. The cells were exposed to robust heat shock at 46řC for 10 minutes. The ability of the mutant cells to recover was tested by propidium iodine staining and colony forming units plating. We found that the eIF5A-3 mutant forms heat-induced SGs more loosely aggregated, indicating that the fully functional eIF5A is necessary for SGs assembly. However, it does not seem to affect the rate of SGs dissolution. Survival tests indicate that eIF5A-3 mutant cells are susceptible to dying in a similar way as WT cells; nevertheless, their ability to resume proliferation is significantly better. We also observed a loss of the ts phenotype of the eIF5A-3 mutant. This loss cannot be explained by reversion of mutated eIF5A sequence into normal. Probable cause lies in the adaptive evolution. Our results indicate role of...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
dc.identifier.lisID990020291410106986


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Tento záznam se objevuje v následujících sbírkách

Zobrazit minimální záznam


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV