Show simple item record

Funkční analýza eIF3e podjednotky lidského translačního iniciačního faktoru eIF3 v živých buňkách.
dc.contributor.advisorValášek, Leoš
dc.creatorŠikrová, Darina
dc.date.accessioned2017-05-31T21:59:33Z
dc.date.available2017-05-31T21:59:33Z
dc.date.issued2015
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/74496
dc.description.abstract3 Abstrakt Eukaryotický iniciační faktor 3 (eIF3) je významným hráčem zúčastňujícim se více kroků iniciace translace, která v konečném důsledku vede k vytvoření elongace-schopného 80S ribosómu. Se svými 13 podjednotkami (eIF3a - eIF3m) představuje najvětší a nejkomplexnější translační iniciační factor, který se skládá ze tří vzájemně popřepájených modulů (i - iii). Navzdory jeho bezesporné důležitosti, přínos jednotlivých podjednotek pro jeho struktúrní integritu a správnou funkci není plně proskúmaný. Bylo zjistěné, že eIF3e podjednotka je součásti oktamerního jadra lidského eIF3 komplexu a navyše bylo proukázané, že je komponentem molekulárního přemostění mezi 40S ribosomální podjednotkou a čepička- vazebným komplexem, čím tak napomáha vazbě mRNA na 43S preiniciační komplex. V této práci byl analyzovaný dopad siRNA navozenej zníženej exprese eIF3e podjednotky na integritu a funkci eIF3 v in vivo podmínkach. Znížení tvorby eIF3e, tzv. eIF3e knock-down (eIF3eK.D. ), vedlo k výraznýmu úbytku dalších 3 podjednotek (d, k a l), které spolu s podjednotkami c a e tvoří modul ii lidského eIF3 komplexu. Zvyšné moduly i (obsahujíci a, b, g a i) a iii (pozostávajíci z f, h a m) ostali sčásti spolu asociované pravděpodobně za pomoci eIF3c a ich vazebná afinita voči 40S podjednotce klesla. Navyše buňky s nedostatkem...cs_CZ
dc.description.abstract2 Abstract Eukaryotic initiation factor 3 (eIF3) is a critical player involved in many steps of translation initiation, which ultimately result in the formation of the elongation competent 80S ribosome. With its 13 subunits (eIF3a - eIF3m) it is the largest and the most complex translation initiation factor composed of three mutually interconnected modules (i - iii), however, the role of individual subunits involved in its structural integrity and proper function is not fully explored. The eIF3e subunit was shown to be a part of the human eIF3 structural core and to help in the mRNA recruitment to the 43S pre-initiation complex by forming a molecular bridge between the 40S ribosomal subunit and the mRNA cap-binding complex. In this study, we employed siRNA-directed downregulation of eIF3e in HeLa cells and analysed its impact on the overall eIF3 integrity and function in vivo. The eIF3e knock-down (eIF3eK.D. ) led to the severe reduction of protein amounts of other three subunits (eIF3d, k and l), which together with the subunit eIF3c and e form module ii of the eIF3 complex. Remaining module i (composed of a, b, g and i) and iii (containing f, h and m) stayed partially bound perhaps thanks to a bridging effect of eIF3c, and showed reduced binding efficiency towards the 40S subunit compared to control...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjecteukaryotická iniciace translacecs_CZ
dc.subjectlidský eIF3cs_CZ
dc.subjecteIF3ecs_CZ
dc.subjectsiRNA-navozená snížená expresecs_CZ
dc.subjecteukaryotic translation initationen_US
dc.subjecteIF3en_US
dc.subjecteIF3een_US
dc.subjectsiRNA-directed knock-downen_US
dc.titleFunctional analysis of eIF3e subunit of human translation initiation factor 3 in living cells.en_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2015
dcterms.dateAccepted2015-09-16
dc.description.departmentDepartment of Genetics and Microbiologyen_US
dc.description.departmentKatedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId140609
dc.title.translatedFunkční analýza eIF3e podjednotky lidského translačního iniciačního faktoru eIF3 v živých buňkách.cs_CZ
dc.contributor.refereeŠanderová, Hana
dc.identifier.aleph002029121
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineGenetika, molekulární biologie a virologiecs_CZ
thesis.degree.disciplineGenetics, Molecular Biology and Virologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csGenetika, molekulární biologie a virologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enGenetics, Molecular Biology and Virologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.cs3 Abstrakt Eukaryotický iniciační faktor 3 (eIF3) je významným hráčem zúčastňujícim se více kroků iniciace translace, která v konečném důsledku vede k vytvoření elongace-schopného 80S ribosómu. Se svými 13 podjednotkami (eIF3a - eIF3m) představuje najvětší a nejkomplexnější translační iniciační factor, který se skládá ze tří vzájemně popřepájených modulů (i - iii). Navzdory jeho bezesporné důležitosti, přínos jednotlivých podjednotek pro jeho struktúrní integritu a správnou funkci není plně proskúmaný. Bylo zjistěné, že eIF3e podjednotka je součásti oktamerního jadra lidského eIF3 komplexu a navyše bylo proukázané, že je komponentem molekulárního přemostění mezi 40S ribosomální podjednotkou a čepička- vazebným komplexem, čím tak napomáha vazbě mRNA na 43S preiniciační komplex. V této práci byl analyzovaný dopad siRNA navozenej zníženej exprese eIF3e podjednotky na integritu a funkci eIF3 v in vivo podmínkach. Znížení tvorby eIF3e, tzv. eIF3e knock-down (eIF3eK.D. ), vedlo k výraznýmu úbytku dalších 3 podjednotek (d, k a l), které spolu s podjednotkami c a e tvoří modul ii lidského eIF3 komplexu. Zvyšné moduly i (obsahujíci a, b, g a i) a iii (pozostávajíci z f, h a m) ostali sčásti spolu asociované pravděpodobně za pomoci eIF3c a ich vazebná afinita voči 40S podjednotce klesla. Navyše buňky s nedostatkem...cs_CZ
uk.abstract.en2 Abstract Eukaryotic initiation factor 3 (eIF3) is a critical player involved in many steps of translation initiation, which ultimately result in the formation of the elongation competent 80S ribosome. With its 13 subunits (eIF3a - eIF3m) it is the largest and the most complex translation initiation factor composed of three mutually interconnected modules (i - iii), however, the role of individual subunits involved in its structural integrity and proper function is not fully explored. The eIF3e subunit was shown to be a part of the human eIF3 structural core and to help in the mRNA recruitment to the 43S pre-initiation complex by forming a molecular bridge between the 40S ribosomal subunit and the mRNA cap-binding complex. In this study, we employed siRNA-directed downregulation of eIF3e in HeLa cells and analysed its impact on the overall eIF3 integrity and function in vivo. The eIF3e knock-down (eIF3eK.D. ) led to the severe reduction of protein amounts of other three subunits (eIF3d, k and l), which together with the subunit eIF3c and e form module ii of the eIF3 complex. Remaining module i (composed of a, b, g and i) and iii (containing f, h and m) stayed partially bound perhaps thanks to a bridging effect of eIF3c, and showed reduced binding efficiency towards the 40S subunit compared to control...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV