Show simple item record

Metabolism of iron in amoebas
dc.contributor.advisorŠuťák, Róbert
dc.creatorGlavanakovová, Marie
dc.date.accessioned2017-05-31T21:58:17Z
dc.date.available2017-05-31T21:58:17Z
dc.date.issued2015
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/74489
dc.description.abstractFeritiny jsou proteiny s komplexní strukturou důležité pro skladování a detoxifikaci iontů železa. Typicky jsou lokalizovány v cytoplazmě buněk; nicméně byly identifikovány i v mitochondriích a chloroplastech. Feritiny jsou rozšířeny napříč organismy, ale nejsou běžné u nefotosyntetizujících protist. Z tohoto důvodu je překvapivá přítomnost genu pro feritin v genomu volně žijící améby Naegleria gruberi. Bioinformatická analýza potvrzuje jeho zařazení mezi eukaryotické feritiny. Protein byl lokalizován v mitochondriích N. gruberi pomocí protilátek vytvořených v laboratorním potkanovi. Nativní exprimovaný rekombinantní protein bez mitochondriální presekvence byl použit pro in vitro pokusy. Podařilo se nám prokázat pomocí růstových experimentů, že je exprese feritinu závislá na koncentraci iontů železa v médiu; nicméně přímo prokázat schopnost vazby iontů železa in vitro se nám nepodařilo. Funkce feritinu N. gruberi je tedy pravděpodobně spjatá s metabolismem železa. Vedlejší experimenty se zabývaly dalším proteinem patřícím do rodiny feritinů - Dps proteinem u Acanthamoeba castellanii. I přes úspěšné vytvoření protilátek jsme nedokázali tento protein detekovat v celkovém lyzátu ani ve frakcích acanthamoeb, a to ani po navození stresových podmínek.cs_CZ
dc.description.abstractFerritins are complex protein structures for iron storage and detoxification. They are typically found in the cytoplasm of the cell; however, they were also identified in mitochondria and chloroplasts. They are distributed among all living organisms but uncommon in non-photosynthetic protists. Surprisingly, a ferritin gene was found in the genome of free-living amoeba Naegleria gruberi. Bioinformatic analysis confirms that it belongs to a group of eukaryotic ferritins. Upon creating antibodies in a laboratory rat, we localized the protein in mitochondria of N. gruberi. The native recombinant protein without the mitochondrial presequence was used for further in vitro experiments. Using growth experiments, we established that the expression of ferritin is dependent on a concentration of iron in cultivation media; however, we were not able to directly prove its ability to bind iron in vitro. We concluded that the function of the ferritin of N. gruberi is most likely related to metabolism of iron. Side experiments were focused on a different protein from the ferritin family - Dps protein in Acanthamoeba castellanii. Despite of a successful creation of antibodies, we were not able to detect the expression of protein neither in total cell lysates nor in subcellular fractions of acanthamoebas under...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleMetabolismus železa u amébcs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2015
dcterms.dateAccepted2015-09-17
dc.description.departmentDepartment of Parasitologyen_US
dc.description.departmentKatedra parazitologiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId143810
dc.title.translatedMetabolism of iron in amoebasen_US
dc.contributor.refereePyrih, Jan
dc.identifier.aleph002029116
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineParazitologiecs_CZ
thesis.degree.disciplineParasitologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra parazitologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Parasitologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csParazitologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enParasitologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVelmi dobřecs_CZ
thesis.grade.enVery gooden_US
uk.abstract.csFeritiny jsou proteiny s komplexní strukturou důležité pro skladování a detoxifikaci iontů železa. Typicky jsou lokalizovány v cytoplazmě buněk; nicméně byly identifikovány i v mitochondriích a chloroplastech. Feritiny jsou rozšířeny napříč organismy, ale nejsou běžné u nefotosyntetizujících protist. Z tohoto důvodu je překvapivá přítomnost genu pro feritin v genomu volně žijící améby Naegleria gruberi. Bioinformatická analýza potvrzuje jeho zařazení mezi eukaryotické feritiny. Protein byl lokalizován v mitochondriích N. gruberi pomocí protilátek vytvořených v laboratorním potkanovi. Nativní exprimovaný rekombinantní protein bez mitochondriální presekvence byl použit pro in vitro pokusy. Podařilo se nám prokázat pomocí růstových experimentů, že je exprese feritinu závislá na koncentraci iontů železa v médiu; nicméně přímo prokázat schopnost vazby iontů železa in vitro se nám nepodařilo. Funkce feritinu N. gruberi je tedy pravděpodobně spjatá s metabolismem železa. Vedlejší experimenty se zabývaly dalším proteinem patřícím do rodiny feritinů - Dps proteinem u Acanthamoeba castellanii. I přes úspěšné vytvoření protilátek jsme nedokázali tento protein detekovat v celkovém lyzátu ani ve frakcích acanthamoeb, a to ani po navození stresových podmínek.cs_CZ
uk.abstract.enFerritins are complex protein structures for iron storage and detoxification. They are typically found in the cytoplasm of the cell; however, they were also identified in mitochondria and chloroplasts. They are distributed among all living organisms but uncommon in non-photosynthetic protists. Surprisingly, a ferritin gene was found in the genome of free-living amoeba Naegleria gruberi. Bioinformatic analysis confirms that it belongs to a group of eukaryotic ferritins. Upon creating antibodies in a laboratory rat, we localized the protein in mitochondria of N. gruberi. The native recombinant protein without the mitochondrial presequence was used for further in vitro experiments. Using growth experiments, we established that the expression of ferritin is dependent on a concentration of iron in cultivation media; however, we were not able to directly prove its ability to bind iron in vitro. We concluded that the function of the ferritin of N. gruberi is most likely related to metabolism of iron. Side experiments were focused on a different protein from the ferritin family - Dps protein in Acanthamoeba castellanii. Despite of a successful creation of antibodies, we were not able to detect the expression of protein neither in total cell lysates nor in subcellular fractions of acanthamoebas under...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra parazitologiecs_CZ
dc.identifier.lisID990020291160106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV