Show simple item record

Alpha-1-antitrypsin deficiency analysis using real-time PCR
dc.contributor.advisorBeránek, Martin
dc.creatorBlažková, Petra
dc.date.accessioned2017-05-27T19:07:10Z
dc.date.available2017-05-27T19:07:10Z
dc.date.issued2014
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/72378
dc.description.abstractUniverzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Autor: Bc. Petra Blažková Školitel: Doc. PharmDr. Martin Beránek Ph.D. Název diplomové práce: Vyšetření deficitu v alfa-1-antitrypsinovém genu pomocí real-time PCR Diplomová práce se zaměřuje na validaci metody PCR v reálném čase (real-time PCR) pro vyšetření mutací Z a S v genu SERPINA1, který se nachází na dlouhém raménku 14. chromozómu (14q32.13) a obsahuje pokyny pro přípravu proteinu zvaného alfa-1- antitrypsin (A1AT). A1AT je inhibitor serinových proteáz a chrání tkáně před degradací neutrofilní elastázou. Nedostatek, který je nejčastěji způsoben právě těmito mutacemi, může způsobit onemocnění plic a jater u dětí a dospělých. Metoda real-time PCR se po úspěšné validaci aplikovala na soubor 46 klinických vzorků DNA získaných z krve a 30 vzorků DNA z buněk bukální sliznice. Izolace DNA byla provedena extrakcí kitem QIAamp® DNA Mini Kit od firmy QIAGEN. Ke genotypizaci jsem použila sadu primerů a hybridizačních sond dle Snydera (2006). Analýza teploty tání probíhala v termocykléru LightCycler 1.2. Výsledky vzorků DNA získaných z krve byly následně porovnány s výsledky získanými akreditovanou metodou založenou na principu PCR/RFLP. Obě metody dávaly 100% shodné výsledky. V těchto vzorcích byla zjištěna...cs_CZ
dc.description.abstractCharles University in Prague Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Bc. Petra Blažková Supervisor: Doc. PharmDr. Martin Beránek Ph.D. Title of diploma thesis: Alpha-1-antitrypsin deficiency analysis using real-time PCR This diploma thesis focuses on the validation of the method PCR in real-time (real-time PCR) to investigate the Z and S mutations in the gene SERPINA1, located at the long arm of chromosome 14 (14q32.13) and provides instructions for making a protein named alpha-1- antitrypsin (A1AT). A1AT is a serine protease inhibitor that protects tissues from degradation by neutrophil elastase. Deficiency, which is most commonly caused by these mutations, can cause children and adult's liver and lung disease. A method of real-time PCR was applied after successful validation to a set of 46 clinical samples of DNA extracted from blood samples and 30 samples of the DNA from cells of the buccal mucosa. DNA isolation was performed by kit extraction QIAamp ® DNA Mini Kit by QIAGEN. I used a set of primers and hybridization probes according to Snyder (2006) for genotyping. Melting curve analysis was carried out in the thermocycler LightCycler 1.2. Results of DNA samples obtained from blood were compared with the results obtained through an accredited method...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.subjectAlfa-1-antitrypsincs_CZ
dc.subjectdefektcs_CZ
dc.subjectDNAcs_CZ
dc.subjectPCRcs_CZ
dc.subjectreal-timecs_CZ
dc.subjectAlpha-1-antitrypsinen_US
dc.subjectdeficiencyen_US
dc.subjectDNAen_US
dc.subjectPCRen_US
dc.subjectreal-timeen_US
dc.titleVyšetření deficitu v alfa-1-antitrypsinovém genu pomocí real-time PCRcs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2014
dcterms.dateAccepted2014-06-04
dc.description.departmentDepartment of Biochemical Sciencesen_US
dc.description.departmentKatedra biochemických vědcs_CZ
dc.description.facultyFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
dc.identifier.repId128103
dc.title.translatedAlpha-1-antitrypsin deficiency analysis using real-time PCRen_US
dc.contributor.refereeŠimůnek, Tomáš
dc.identifier.aleph001780852
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineOdborný pracovník v laboratorních metodáchcs_CZ
thesis.degree.disciplineSpecialist in Laboratory Methodsen_US
thesis.degree.programZdravotnická bioanalytikacs_CZ
thesis.degree.programHealthcare bioanalyticsen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csFarmaceutická fakulta v Hradci Králové::Katedra biochemických vědcs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Pharmacy in Hradec Králové::Department of Biochemical Sciencesen_US
uk.faculty-name.csFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
uk.faculty-abbr.csFaFcs_CZ
uk.degree-discipline.csOdborný pracovník v laboratorních metodáchcs_CZ
uk.degree-discipline.enSpecialist in Laboratory Methodsen_US
uk.degree-program.csZdravotnická bioanalytikacs_CZ
uk.degree-program.enHealthcare bioanalyticsen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csUniverzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Autor: Bc. Petra Blažková Školitel: Doc. PharmDr. Martin Beránek Ph.D. Název diplomové práce: Vyšetření deficitu v alfa-1-antitrypsinovém genu pomocí real-time PCR Diplomová práce se zaměřuje na validaci metody PCR v reálném čase (real-time PCR) pro vyšetření mutací Z a S v genu SERPINA1, který se nachází na dlouhém raménku 14. chromozómu (14q32.13) a obsahuje pokyny pro přípravu proteinu zvaného alfa-1- antitrypsin (A1AT). A1AT je inhibitor serinových proteáz a chrání tkáně před degradací neutrofilní elastázou. Nedostatek, který je nejčastěji způsoben právě těmito mutacemi, může způsobit onemocnění plic a jater u dětí a dospělých. Metoda real-time PCR se po úspěšné validaci aplikovala na soubor 46 klinických vzorků DNA získaných z krve a 30 vzorků DNA z buněk bukální sliznice. Izolace DNA byla provedena extrakcí kitem QIAamp® DNA Mini Kit od firmy QIAGEN. Ke genotypizaci jsem použila sadu primerů a hybridizačních sond dle Snydera (2006). Analýza teploty tání probíhala v termocykléru LightCycler 1.2. Výsledky vzorků DNA získaných z krve byly následně porovnány s výsledky získanými akreditovanou metodou založenou na principu PCR/RFLP. Obě metody dávaly 100% shodné výsledky. V těchto vzorcích byla zjištěna...cs_CZ
uk.abstract.enCharles University in Prague Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Bc. Petra Blažková Supervisor: Doc. PharmDr. Martin Beránek Ph.D. Title of diploma thesis: Alpha-1-antitrypsin deficiency analysis using real-time PCR This diploma thesis focuses on the validation of the method PCR in real-time (real-time PCR) to investigate the Z and S mutations in the gene SERPINA1, located at the long arm of chromosome 14 (14q32.13) and provides instructions for making a protein named alpha-1- antitrypsin (A1AT). A1AT is a serine protease inhibitor that protects tissues from degradation by neutrophil elastase. Deficiency, which is most commonly caused by these mutations, can cause children and adult's liver and lung disease. A method of real-time PCR was applied after successful validation to a set of 46 clinical samples of DNA extracted from blood samples and 30 samples of the DNA from cells of the buccal mucosa. DNA isolation was performed by kit extraction QIAamp ® DNA Mini Kit by QIAGEN. I used a set of primers and hybridization probes according to Snyder (2006) for genotyping. Melting curve analysis was carried out in the thermocycler LightCycler 1.2. Results of DNA samples obtained from blood were compared with the results obtained through an accredited method...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placeHradec Královécs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra biochemických vědcs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV