Show simple item record

Sekundarni metabolismus a jeho regulace u bakterie Streptomyces ambofaciens: studium kryptickych biosyntetickych genovych shluku
dc.creatorBobková, Šárka
dc.date.accessioned2021-05-20T12:11:17Z
dc.date.available2021-05-20T12:11:17Z
dc.date.issued2015
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/68596
dc.description.abstractI. ABSTRACT v češtině Předložená práce se zabýva sekundárním metabolismem a jeho regulací u bakterií Streptomyces ambofaciens a Streptomyces lividans se zaměřením na nové biosyntetické dráhy. Během sekvenace chromozomů bakterií a nižších hub se ukázalo, že počet clusterů pro biosyntézu sekundárních metabolitů v genomu těchto bakterií je mnohem větší než bylo známo sekundárních metabolitů produkovaných těmito mikroorganizmy. Genové shluky jejichž produkty nebyly známy se začaly nazývat kryptické. Další výzkumy ukázaly, že alespoň některé z těchto kryptických genových shluků jsou za určitých podmínek exprimovány a kódují biosyntézu průmyslově využitelných sekundárních metabolitů (Gottelt et al., 2010; Gross et al., 2007; Pang et al., 2004). Kryptické klustery jsou proto považovány za jeden z možných "rezervoárů" nových bioaktivních látek. Inspirována těmito výsledky jsem se v předložené práci zabývala studiem kryptických biosyntetických klusterů sekundárních metabolitů u bakterie S. ambofaciens, jež je průmyslově využívána jako producent antibiotika spiramycinu. V druhé části práce jsem studovala regulaci produkce sekundárních metabolitů a zejména možnost delece či nadpordukce globálních regulátorů (Rep a DasR), která by vedla k aktivaci genů z kryptických biosyntetických klusterů. Třečí část práce se týká...cs_CZ
dc.description.abstractI. ABSTRACT in English The presented work is focused on secondary metabolism and its regulation in Streptomyces ambofaciens and Streptomyces lividans with special interest in new biosynthetic pathways. The sequencing of bacterial and fungal genomes revealed that the number of their secondary metabolite biosynthetic gene clusters greatly exceeds the number of produced secondary metabolites. Further studies showed that at least some of the newly discovered clusters, called cryptic since no product had been associated to them, were expressed in certain conditions and that they directed the biosynthesis of exploitable secondary metabolites (Gottelt et al., 2010; Gross et al., 2007; Pang et al., 2004). Therefore, these cryptic clusters have been considered as one of the promising reservoirs of new bioactive molecules. Using different approaches I studied the cryptic secondary metabolite biosynthetic gene clusters of Streptomyces ambofaciens, a strain exploited industrially for the production of the antibiotic spiramycin. In the second part of this work, I was interested in the regulation of secondary metabolite biosynthesis and in manipulating genes encoding regulatory proteins (Rep and DasR) in order to activate the expression of cryptic clusters. The third part of this work studied the effect of the...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleSecondary metabolism and its regulation in Streptomyces ambofaciens: the study of cryptic secondary metabolite biosynthetic gene clustersen_US
dc.typerigorózní prácecs_CZ
dcterms.created2015
dcterms.dateAccepted2015-01-22
dc.description.departmentKatedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Genetics and Microbiologyen_US
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId160265
dc.title.translatedSekundarni metabolismus a jeho regulace u bakterie Streptomyces ambofaciens: studium kryptickych biosyntetickych genovych shlukucs_CZ
dc.identifier.aleph001923887
thesis.degree.nameRNDr.
thesis.degree.levelrigorózní řízenícs_CZ
thesis.degree.disciplineMicrobiologyen_US
thesis.degree.disciplineMikrobiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
uk.thesis.typerigorózní prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Genetics and Microbiologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csMikrobiologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enMicrobiologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csUznánocs_CZ
thesis.grade.enRecognizeden_US
uk.abstract.csI. ABSTRACT v češtině Předložená práce se zabýva sekundárním metabolismem a jeho regulací u bakterií Streptomyces ambofaciens a Streptomyces lividans se zaměřením na nové biosyntetické dráhy. Během sekvenace chromozomů bakterií a nižších hub se ukázalo, že počet clusterů pro biosyntézu sekundárních metabolitů v genomu těchto bakterií je mnohem větší než bylo známo sekundárních metabolitů produkovaných těmito mikroorganizmy. Genové shluky jejichž produkty nebyly známy se začaly nazývat kryptické. Další výzkumy ukázaly, že alespoň některé z těchto kryptických genových shluků jsou za určitých podmínek exprimovány a kódují biosyntézu průmyslově využitelných sekundárních metabolitů (Gottelt et al., 2010; Gross et al., 2007; Pang et al., 2004). Kryptické klustery jsou proto považovány za jeden z možných "rezervoárů" nových bioaktivních látek. Inspirována těmito výsledky jsem se v předložené práci zabývala studiem kryptických biosyntetických klusterů sekundárních metabolitů u bakterie S. ambofaciens, jež je průmyslově využívána jako producent antibiotika spiramycinu. V druhé části práce jsem studovala regulaci produkce sekundárních metabolitů a zejména možnost delece či nadpordukce globálních regulátorů (Rep a DasR), která by vedla k aktivaci genů z kryptických biosyntetických klusterů. Třečí část práce se týká...cs_CZ
uk.abstract.enI. ABSTRACT in English The presented work is focused on secondary metabolism and its regulation in Streptomyces ambofaciens and Streptomyces lividans with special interest in new biosynthetic pathways. The sequencing of bacterial and fungal genomes revealed that the number of their secondary metabolite biosynthetic gene clusters greatly exceeds the number of produced secondary metabolites. Further studies showed that at least some of the newly discovered clusters, called cryptic since no product had been associated to them, were expressed in certain conditions and that they directed the biosynthesis of exploitable secondary metabolites (Gottelt et al., 2010; Gross et al., 2007; Pang et al., 2004). Therefore, these cryptic clusters have been considered as one of the promising reservoirs of new bioactive molecules. Using different approaches I studied the cryptic secondary metabolite biosynthetic gene clusters of Streptomyces ambofaciens, a strain exploited industrially for the production of the antibiotic spiramycin. In the second part of this work, I was interested in the regulation of secondary metabolite biosynthesis and in manipulating genes encoding regulatory proteins (Rep and DasR) in order to activate the expression of cryptic clusters. The third part of this work studied the effect of the...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
thesis.grade.codeU
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusU
dc.identifier.lisID990019238870106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV