Show simple item record

Proteomická a bioinformatická charakterizace N-terminálních sekvencí proteinů modifikovaných po importu do hydrogenosomu Trichomonas vaginalis.
dc.contributor.advisorMan, Petr
dc.creatorZákoucká, Eva
dc.date.accessioned2017-05-27T05:55:13Z
dc.date.available2017-05-27T05:55:13Z
dc.date.issued2014
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/68220
dc.description.abstractTrichomonas vaginalis je lidským anaerobním patogenem způsobujícím trichomoniasu, jednu z nejrozšířenějších nevirových pohlavně přenosných nemocí. Toto onemocnění postihující muže i ženy je v současnosti běžně léčeno metronidazolem, avšak jsou známy případy, kdy vznikla rezistence vůči tomuto léčivu. Jelikož je Trichomas vaginalis eukaryotní organismus, je paleta cílů terapeutického zásahu proti tomuto patogenu bez ohrožení hostitele omezená. Během evoluce se Trichomas vaginalis přizpůsobila anaerobnímu prostředí vznikem alternativního anaerobního metabolismu, kdy se mitochondrie přeměnily na organely s výrazně omezenou enzmatickou výbavou. Jelikož je jedním z konečných produktů energetického metabolismu v těchto organelách molekulární vodík, nazývají se tyto organely hzdrogenosomy. Hydrogenosomy nemají vlastní genetickou informaci, všechny proteiny v nich přítomné jsou kódované v jádře, syntetizované na volných ribosomech v cytosolu a poté transportovány do hydrogenosomů pomocí N-koncových presekvencí. Peptidasa rozeznávající a odštěpující tyto presekvence, hydrogenosomální procesující peptidasa, je pro hydrogenosomy unikátní a představuje jeden z mála potencionálních terapeutických cílů pro léčbu trichomoniasy. Cílem této práce bylo určení substrátové specifity hydrogenosomální procesující...cs_CZ
dc.description.abstractTrichomonas vaginalis is a human pathogen causing trichomoniasis, one of the most common non-viral sexually transmitted diseases in both men and women. Trichomoniasis is currently treated with metronidazole, but the pathogen is known to develop resistance against this drug. However as the pathogen is eukaryotic, the targets for the pathogen elimination without seriously affecting the host are limited. Throughout the evolution Trichomonas vaginalis adapted to anaerobic environments by developing an alternative metabolism resulting in a reduced form of mitochondria named hydrogenosome. Hydrogenosomes lack genetic information, therefore all its proteins are nucleus-encoded and need to be transported inside the hydrogenosome using a targeting N-terminal presequence. The peptidase recognizing and cleaving those presequences at the entrance of the organelle, the hydrogenosomal processing peptidase (HPP), is unique for hydrogenosomes and therefore represents a potential drug target against the pathogen. In this work the HPP's substrate specificity towards the targeting presequences was investigated. To do so a proteomic analysis of the proteome of Trichomonas vaginalis hydrogenosomes was performed using a novel optimized protocol for N-terminal peptide sequencing. N-terminal peptides were captured using a...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjecthydrogenosomycs_CZ
dc.subjectmodifikace proteinůcs_CZ
dc.subjecthmotnostní spektrometriecs_CZ
dc.subjectsekvenování N-terminálních peptidůcs_CZ
dc.subjecthydrogenosomesen_US
dc.subjectprotein modificationen_US
dc.subjectmass spectrometryen_US
dc.subjectN-terminal sequencingen_US
dc.titleProteomická a bioinformatická charakterizace N-terminálních sekvencí proteinů modifikovaných po importu do hydrogenosomu Trichomonas vaginalis.en_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2014
dcterms.dateAccepted2014-05-26
dc.description.departmentDepartment of Biochemistryen_US
dc.description.departmentKatedra biochemiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId116299
dc.title.translatedProteomická a bioinformatická charakterizace N-terminálních sekvencí proteinů modifikovaných po importu do hydrogenosomu Trichomonas vaginalis.cs_CZ
dc.contributor.refereeŠulc, Miroslav
dc.identifier.aleph001782000
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiochemiecs_CZ
thesis.degree.disciplineBiochemistryen_US
thesis.degree.programBiochemiecs_CZ
thesis.degree.programBiochemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-discipline.enBiochemistryen_US
uk.degree-program.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-program.enBiochemistryen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csTrichomonas vaginalis je lidským anaerobním patogenem způsobujícím trichomoniasu, jednu z nejrozšířenějších nevirových pohlavně přenosných nemocí. Toto onemocnění postihující muže i ženy je v současnosti běžně léčeno metronidazolem, avšak jsou známy případy, kdy vznikla rezistence vůči tomuto léčivu. Jelikož je Trichomas vaginalis eukaryotní organismus, je paleta cílů terapeutického zásahu proti tomuto patogenu bez ohrožení hostitele omezená. Během evoluce se Trichomas vaginalis přizpůsobila anaerobnímu prostředí vznikem alternativního anaerobního metabolismu, kdy se mitochondrie přeměnily na organely s výrazně omezenou enzmatickou výbavou. Jelikož je jedním z konečných produktů energetického metabolismu v těchto organelách molekulární vodík, nazývají se tyto organely hzdrogenosomy. Hydrogenosomy nemají vlastní genetickou informaci, všechny proteiny v nich přítomné jsou kódované v jádře, syntetizované na volných ribosomech v cytosolu a poté transportovány do hydrogenosomů pomocí N-koncových presekvencí. Peptidasa rozeznávající a odštěpující tyto presekvence, hydrogenosomální procesující peptidasa, je pro hydrogenosomy unikátní a představuje jeden z mála potencionálních terapeutických cílů pro léčbu trichomoniasy. Cílem této práce bylo určení substrátové specifity hydrogenosomální procesující...cs_CZ
uk.abstract.enTrichomonas vaginalis is a human pathogen causing trichomoniasis, one of the most common non-viral sexually transmitted diseases in both men and women. Trichomoniasis is currently treated with metronidazole, but the pathogen is known to develop resistance against this drug. However as the pathogen is eukaryotic, the targets for the pathogen elimination without seriously affecting the host are limited. Throughout the evolution Trichomonas vaginalis adapted to anaerobic environments by developing an alternative metabolism resulting in a reduced form of mitochondria named hydrogenosome. Hydrogenosomes lack genetic information, therefore all its proteins are nucleus-encoded and need to be transported inside the hydrogenosome using a targeting N-terminal presequence. The peptidase recognizing and cleaving those presequences at the entrance of the organelle, the hydrogenosomal processing peptidase (HPP), is unique for hydrogenosomes and therefore represents a potential drug target against the pathogen. In this work the HPP's substrate specificity towards the targeting presequences was investigated. To do so a proteomic analysis of the proteome of Trichomonas vaginalis hydrogenosomes was performed using a novel optimized protocol for N-terminal peptide sequencing. N-terminal peptides were captured using a...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra biochemiecs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 3-5, 116 36 Praha; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV