Show simple item record

Pulse proteolysis in evaluation of conformational stability of cytochromes b5
dc.contributor.advisorMartínek, Václav
dc.creatorMaroušková, Růžena
dc.date.accessioned2017-05-27T05:52:20Z
dc.date.available2017-05-27T05:52:20Z
dc.date.issued2014
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/68205
dc.description.abstractMonooxygenasový systém se smíšenou funkcí hraje velkou roli při metabolismu cizorodých látek. Hlavní součástí tohoto systému je cytochrom P450, díky němuž jsou látky přicházející do našeho těla převáděny na polárnější produkty. Cytochrom b5 (cyt b5) je schopen modulovat funkci cytochromu P450, mechanismus této modulace však dosud nebyl zcela objasněn. Předpokládá se, že by to mohlo být zprostředkováno buď přenosem elektronů z cyt b5, nebo i allosterickou modulací cytochromu P450 vyvolanou interakcí s cyt b5. Cílem práce bylo nalézt a připravit vhodný analog cyt b5, který by nebyl schopen přenosu elektronů, ale přitom by byl strukturně velmi blízký nativnímu cyt b5. V práci byla pro sledování konformační stability cyt b5 a jeho analogů využívána metoda pulzní proteolýzy. Tato metoda využívá štěpení proteinu proteasou v prostředí denaturačního činidla. Pro solubilní proteiny bývá jako denaturant využívána močovina a jako proteasa thermolysin. Pro membránové proteiny se jako denaturant používá spíše SDS a v tomto prostředí se jako proteasa využívá subtilisin. Cílem diplomové práce bylo pomocí této metody porovnat konformační stabilitu nativního lidského cyt b5 obsahujícím v aktivním centru hem s apo-cyt b5 a cyt b5 rekonstituovaným s MnIII protoporfyrinem IX (MnIII PPIX), CrIII protoporfyrinem IX...cs_CZ
dc.description.abstractMixed-function oxidases play a major role in the metabolism of xenobiotics. The main component of this system is the cytochrome P450, it oxidizes substrates coming into our body to more polar products. Another component of mixed-function system - the cytochrome b5 (cyt b5) is able to modulate the function of cytochrome P450, the mechanism of this modulation is yet unknown. However, it is believed that it could be mediated via transfer of electron or allosteric modulation of cytochrome P450 caused by interaction with cyt b5. The aim of this thesis was to find and prepare analogs of cyt b5, which are unable to transfer electrons to cytochrome P450 and simultaneously are structurally very similar to native cyt b5. The conformational stability of cyt b5 and its analogs was monitored using pulse proteolysis. This method employs proteases to cleave the evaluated protein at varying concentration of a denaturant. For soluble proteins, urea is typically used as denaturant in combination with thermolysin as protease. While for membrane proteins, sodium dodecyl sulfate (SDS) is usually used as denaturant together with subtilisin as protease. The aim of this thesis was to use these methods to compare a conformational stability of the native human cyt b5 with apo-cyt b5 and analogs of the cyt b5 reconstituted...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectpulzní proteolýzacs_CZ
dc.subjectelektroforézacs_CZ
dc.subjecthemoprotienycs_CZ
dc.subjectpulse proteolysisen_US
dc.subjectelectrophoresisen_US
dc.subjecthemoprotiensen_US
dc.titleOvěření potenciálu pulzní proteolýzy pro studium konformační stability cytochromů b5cs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2014
dcterms.dateAccepted2014-05-26
dc.description.departmentDepartment of Biochemistryen_US
dc.description.departmentKatedra biochemiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId94363
dc.title.translatedPulse proteolysis in evaluation of conformational stability of cytochromes b5en_US
dc.contributor.refereeHudeček, Jiří
dc.identifier.aleph001781995
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiochemiecs_CZ
thesis.degree.disciplineBiochemistryen_US
thesis.degree.programBiochemiecs_CZ
thesis.degree.programBiochemistryen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra biochemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Biochemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-discipline.enBiochemistryen_US
uk.degree-program.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-program.enBiochemistryen_US
thesis.grade.csVelmi dobřecs_CZ
thesis.grade.enVery gooden_US
uk.abstract.csMonooxygenasový systém se smíšenou funkcí hraje velkou roli při metabolismu cizorodých látek. Hlavní součástí tohoto systému je cytochrom P450, díky němuž jsou látky přicházející do našeho těla převáděny na polárnější produkty. Cytochrom b5 (cyt b5) je schopen modulovat funkci cytochromu P450, mechanismus této modulace však dosud nebyl zcela objasněn. Předpokládá se, že by to mohlo být zprostředkováno buď přenosem elektronů z cyt b5, nebo i allosterickou modulací cytochromu P450 vyvolanou interakcí s cyt b5. Cílem práce bylo nalézt a připravit vhodný analog cyt b5, který by nebyl schopen přenosu elektronů, ale přitom by byl strukturně velmi blízký nativnímu cyt b5. V práci byla pro sledování konformační stability cyt b5 a jeho analogů využívána metoda pulzní proteolýzy. Tato metoda využívá štěpení proteinu proteasou v prostředí denaturačního činidla. Pro solubilní proteiny bývá jako denaturant využívána močovina a jako proteasa thermolysin. Pro membránové proteiny se jako denaturant používá spíše SDS a v tomto prostředí se jako proteasa využívá subtilisin. Cílem diplomové práce bylo pomocí této metody porovnat konformační stabilitu nativního lidského cyt b5 obsahujícím v aktivním centru hem s apo-cyt b5 a cyt b5 rekonstituovaným s MnIII protoporfyrinem IX (MnIII PPIX), CrIII protoporfyrinem IX...cs_CZ
uk.abstract.enMixed-function oxidases play a major role in the metabolism of xenobiotics. The main component of this system is the cytochrome P450, it oxidizes substrates coming into our body to more polar products. Another component of mixed-function system - the cytochrome b5 (cyt b5) is able to modulate the function of cytochrome P450, the mechanism of this modulation is yet unknown. However, it is believed that it could be mediated via transfer of electron or allosteric modulation of cytochrome P450 caused by interaction with cyt b5. The aim of this thesis was to find and prepare analogs of cyt b5, which are unable to transfer electrons to cytochrome P450 and simultaneously are structurally very similar to native cyt b5. The conformational stability of cyt b5 and its analogs was monitored using pulse proteolysis. This method employs proteases to cleave the evaluated protein at varying concentration of a denaturant. For soluble proteins, urea is typically used as denaturant in combination with thermolysin as protease. While for membrane proteins, sodium dodecyl sulfate (SDS) is usually used as denaturant together with subtilisin as protease. The aim of this thesis was to use these methods to compare a conformational stability of the native human cyt b5 with apo-cyt b5 and analogs of the cyt b5 reconstituted...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra biochemiecs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV