Show simple item record

Enzyme kinetics and regulation of shikimate dehydrogenase from parsley roots.
dc.contributor.advisorHýsková, Veronika
dc.creatorŠmeringaiová, Ingrida
dc.date.accessioned2021-03-26T10:52:28Z
dc.date.available2021-03-26T10:52:28Z
dc.date.issued2014
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/68183
dc.description.abstractŠikimátová dráha spolu s navazující fenylpropanoidní drahou v rostlinách poskytuje vedle aromatických aminokyselin také celou řadu sekundárních metabolitů. Významným enzymem je šikimátdehydrogenasa, která je v rostlinách součástí bifunkčního proteinu 3- dehydrochinátdehydratasy/šikimátdehydrogenasy (DHD/SDH; EC 4.2.1.10 a EC 1.1.1.25). Ačkoliv regulace šikimátové dráhy je poměrně komplexní záležitostí, o regulaci rostlinné SDH je k dispozici informací velice málo. Cílem tohoto projektu bylo proto najít vhodný rostlinný zdroj o vysoké aktivitě SDH a zjistit, zda a jakým způsobem je SDH regulována látkami fenylpropanoidního metabolismu, především jednoduchými polyfenoly. Enzymový preparát SDH o výsledné specifické aktivitě 470 mol.min-1 .mg-1 byl připraven 3-krokovou purifikací z kořene petržele (Petroselinum crispum). Detekcí aktivity tohoto enzymu v gelu po nativní elektroforéze a po isoelektrické fokusaci byla zjištěna jedna isoforma. Relativní molekulová hmotnost SDH kořene petržele byla pomocí gelové chromatografie stanovena 60 000 a pomocí červené nativní elektroforézy 63 000. Isoelektrický bod odpovídal hodnotě 4,5. Optimální pH reakce katalyzované SDH bylo zjištěno v rozmezí pH 9,5 - 10,0. Pomocí studie počátečních rychlostí dvousubstrátové reakce byly stanoveny kinetické parametry (Km,...cs_CZ
dc.description.abstractIn plants the shikimate pathway followed by the phenylpropanoid pathway leads to the formation of not only aromatic amino acids but also a plenty of secondary metabolites. The crucial enzyme shikimate dehydrogenase is there a part of bi-functional protein 3-dehydroquinate dehy- dratase/shikimate dehydrogenase (DHD/SDH; EC 4.2.1.10 and EC 1.1.1.25). Whereas the regulation of the shikimic pathway is complex, little is known about the feedback regulation of plant SDH. The aim of this project was to find plant source with high SDH activity and to find out, if and in which way this SDH is regulated by compounds of phenylpropanoid metabolism, specifically by simple polyphenols. SDH from parsley root (Petroselinum crispum) has been prepared by 3-step purification to final specific activity 470 mol.min-1 .mg-1 . The enzyme exhibited one band after both isoelectric focusing and red native electrophoresis using detection of the activity. Relative molecular mass of native enzyme was determined by gel chromatography (Mr 60 000) and red native electrophoresis (Mr 63 000). Isoelectric point pI 4.5 was established by isoelectric focusing. Optimal pH for the reaction catalyzed by SDH was determined in rage pH 9.5 - 10.0. The kinetic parameters (Km, Vmax) of SDH for substrate shikimate, and coenzyme NADP+ were...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleCharakterizace a regulace šikimátdehydrogenasy z kořene petržele.cs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2014
dcterms.dateAccepted2014-05-26
dc.description.departmentKatedra biochemiecs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Biochemistryen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId128840
dc.title.translatedEnzyme kinetics and regulation of shikimate dehydrogenase from parsley roots.en_US
dc.contributor.refereeKalendová, Alžběta
dc.identifier.aleph001781990
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiochemistryen_US
thesis.degree.disciplineBiochemiecs_CZ
thesis.degree.programBiochemiecs_CZ
thesis.degree.programBiochemistryen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra biochemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Biochemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-discipline.enBiochemistryen_US
uk.degree-program.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-program.enBiochemistryen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csŠikimátová dráha spolu s navazující fenylpropanoidní drahou v rostlinách poskytuje vedle aromatických aminokyselin také celou řadu sekundárních metabolitů. Významným enzymem je šikimátdehydrogenasa, která je v rostlinách součástí bifunkčního proteinu 3- dehydrochinátdehydratasy/šikimátdehydrogenasy (DHD/SDH; EC 4.2.1.10 a EC 1.1.1.25). Ačkoliv regulace šikimátové dráhy je poměrně komplexní záležitostí, o regulaci rostlinné SDH je k dispozici informací velice málo. Cílem tohoto projektu bylo proto najít vhodný rostlinný zdroj o vysoké aktivitě SDH a zjistit, zda a jakým způsobem je SDH regulována látkami fenylpropanoidního metabolismu, především jednoduchými polyfenoly. Enzymový preparát SDH o výsledné specifické aktivitě 470 mol.min-1 .mg-1 byl připraven 3-krokovou purifikací z kořene petržele (Petroselinum crispum). Detekcí aktivity tohoto enzymu v gelu po nativní elektroforéze a po isoelektrické fokusaci byla zjištěna jedna isoforma. Relativní molekulová hmotnost SDH kořene petržele byla pomocí gelové chromatografie stanovena 60 000 a pomocí červené nativní elektroforézy 63 000. Isoelektrický bod odpovídal hodnotě 4,5. Optimální pH reakce katalyzované SDH bylo zjištěno v rozmezí pH 9,5 - 10,0. Pomocí studie počátečních rychlostí dvousubstrátové reakce byly stanoveny kinetické parametry (Km,...cs_CZ
uk.abstract.enIn plants the shikimate pathway followed by the phenylpropanoid pathway leads to the formation of not only aromatic amino acids but also a plenty of secondary metabolites. The crucial enzyme shikimate dehydrogenase is there a part of bi-functional protein 3-dehydroquinate dehy- dratase/shikimate dehydrogenase (DHD/SDH; EC 4.2.1.10 and EC 1.1.1.25). Whereas the regulation of the shikimic pathway is complex, little is known about the feedback regulation of plant SDH. The aim of this project was to find plant source with high SDH activity and to find out, if and in which way this SDH is regulated by compounds of phenylpropanoid metabolism, specifically by simple polyphenols. SDH from parsley root (Petroselinum crispum) has been prepared by 3-step purification to final specific activity 470 mol.min-1 .mg-1 . The enzyme exhibited one band after both isoelectric focusing and red native electrophoresis using detection of the activity. Relative molecular mass of native enzyme was determined by gel chromatography (Mr 60 000) and red native electrophoresis (Mr 63 000). Isoelectric point pI 4.5 was established by isoelectric focusing. Optimal pH for the reaction catalyzed by SDH was determined in rage pH 9.5 - 10.0. The kinetic parameters (Km, Vmax) of SDH for substrate shikimate, and coenzyme NADP+ were...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra biochemiecs_CZ
thesis.grade.code1
dc.contributor.consultantRyšlavá, Helena
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO
dc.identifier.lisID990017819900106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV