Show simple item record

Membrane proteome of euglenid plastid
dc.contributor.advisorHampl, Vladimír
dc.creatorVanclová, Anna
dc.date.accessioned2021-03-23T23:43:19Z
dc.date.available2021-03-23T23:43:19Z
dc.date.issued2014
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/68019
dc.description.abstractEuglenophyta jsou monofyletická podskupina euglenidů vymezená přítomností zeleného, třemi membránami obaleného plastidu nabytého sekundární endosymbiózou s chlorophytní řasou. Mechanismus, jímž jsou do těchto plastidů transportovány jaderně-kódované proteiny, je dosud velmi málo probádán. Bylo zjištěno, že k vnější membráně putují proteiny ve váčcích postupujících z ER přes Golgi, neví se však, na jakém principu tyto rozeznávají cílovou membránu a splývají s ní. Translokační systém vnitřních dvou membrán je zcela neznámý, na základě srovnání s ostatními plastidy se nabízí možnost přítomnosti homologů komplexů TOC a TIC. V rámci této práce byla analyzována sekvenční data z proteomu izolovaných membrán plastidu modelového organismu Euglena gracilis a transkriptomu E. gracilis a jejího vzdáleného příbuzného, Eutreptiella gymnastica. Bylo zkoumáno, zda se v nich nacházejí proteiny potenciálně zapojené do transportu a homology proteinů transportních systémů známých z plastidů jiných organismů (TOC/TIC, "ERAD-like" transport, SNARE). Veškeré naše výsledky jsou však negativní. Je těžké určit, zda toto zjištění naznačuje možnou nepřítomnost komplexů TOC a TIC v plastidu euglenidů, či spíše nedostatečnost použitých dat. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)cs_CZ
dc.description.abstractEuglenophyta are monophyletic group of euglenids defined by presence of green, three membrane- bound plastid which has been aquired via secondary endosymbiosis with chlorophyte alga. Mechanism of transport of nuclear-encoded proteins into this plastid is not yet completely understood. It was observed that the proteins are transported to the outermost plastid membrane in vesicles passing through ER and Golgi, but the mechanism of their recognition and fusion with the target membrane remains unclear. Translocation system of inner two membranes is still completely unknown, regarding the situation in other plastids, it has been proposed that homologues of TOC and TIC complexes are present. In this work we analyzed sequence data from proteome of isolated plastid membranes of model organism Euglena gracilis and transcriptome of E. gracilis and its distant relative Eutreptiella gymnastica. We studied whether they contain proteins potentially involved in transport and homologues of proteins of transport systems known from plastids in other organisms (TOC/TIC, ERAD-like transport, SNARE). However, all our results are negative. It is hard to determine whether these findings indicate the possible absence of TOC and TIC complexes in euglenid plastid, or rather the insufficiency of our data. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectEuglenidacs_CZ
dc.subjectplastidcs_CZ
dc.subjectmembránycs_CZ
dc.subjectproteomcs_CZ
dc.subjectpurifikace plastidůcs_CZ
dc.subjectEuglenidaen_US
dc.subjectplastiden_US
dc.subjectmembraneen_US
dc.subjectproteomeen_US
dc.subjectplastid purificationen_US
dc.titleMembránový proteom plastidu euglenidůcs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2014
dcterms.dateAccepted2014-09-11
dc.description.departmentDepartment of Parasitologyen_US
dc.description.departmentKatedra parazitologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId130781
dc.title.translatedMembrane proteome of euglenid plastiden_US
dc.contributor.refereeFüssy, Zoltán
dc.identifier.aleph001855773
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineParasitologyen_US
thesis.degree.disciplineParazitologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra parazitologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Parasitologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csParazitologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enParasitologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csEuglenophyta jsou monofyletická podskupina euglenidů vymezená přítomností zeleného, třemi membránami obaleného plastidu nabytého sekundární endosymbiózou s chlorophytní řasou. Mechanismus, jímž jsou do těchto plastidů transportovány jaderně-kódované proteiny, je dosud velmi málo probádán. Bylo zjištěno, že k vnější membráně putují proteiny ve váčcích postupujících z ER přes Golgi, neví se však, na jakém principu tyto rozeznávají cílovou membránu a splývají s ní. Translokační systém vnitřních dvou membrán je zcela neznámý, na základě srovnání s ostatními plastidy se nabízí možnost přítomnosti homologů komplexů TOC a TIC. V rámci této práce byla analyzována sekvenční data z proteomu izolovaných membrán plastidu modelového organismu Euglena gracilis a transkriptomu E. gracilis a jejího vzdáleného příbuzného, Eutreptiella gymnastica. Bylo zkoumáno, zda se v nich nacházejí proteiny potenciálně zapojené do transportu a homology proteinů transportních systémů známých z plastidů jiných organismů (TOC/TIC, "ERAD-like" transport, SNARE). Veškeré naše výsledky jsou však negativní. Je těžké určit, zda toto zjištění naznačuje možnou nepřítomnost komplexů TOC a TIC v plastidu euglenidů, či spíše nedostatečnost použitých dat. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)cs_CZ
uk.abstract.enEuglenophyta are monophyletic group of euglenids defined by presence of green, three membrane- bound plastid which has been aquired via secondary endosymbiosis with chlorophyte alga. Mechanism of transport of nuclear-encoded proteins into this plastid is not yet completely understood. It was observed that the proteins are transported to the outermost plastid membrane in vesicles passing through ER and Golgi, but the mechanism of their recognition and fusion with the target membrane remains unclear. Translocation system of inner two membranes is still completely unknown, regarding the situation in other plastids, it has been proposed that homologues of TOC and TIC complexes are present. In this work we analyzed sequence data from proteome of isolated plastid membranes of model organism Euglena gracilis and transcriptome of E. gracilis and its distant relative Eutreptiella gymnastica. We studied whether they contain proteins potentially involved in transport and homologues of proteins of transport systems known from plastids in other organisms (TOC/TIC, ERAD-like transport, SNARE). However, all our results are negative. It is hard to determine whether these findings indicate the possible absence of TOC and TIC complexes in euglenid plastid, or rather the insufficiency of our data. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra parazitologiecs_CZ
thesis.grade.code1
dc.contributor.consultantŠuťák, Róbert
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV