Show simple item record

Genetic apparatus of biologically active compounds producers in soil bacterial communities
dc.contributor.advisorŠimůnek, Tomáš
dc.creatorŠanderová, Petra
dc.date.accessioned2021-01-13T18:06:24Z
dc.date.available2021-01-13T18:06:24Z
dc.date.issued2015
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/64035
dc.description.abstractCharles University in Prague Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Petra Šanderová Supervisor: Doc. PharmDr. Tomáš Šimůnek, Ph. D, specialist: Ing. Jan Kopecký Title of diploma thesis: Genetic apparatus of biologically active compounds producers in soil bacterial communities The thesis aims in selecting one possible marker indicating the presence of antibiotic biosynthetic pathways in studied strains. My specific task was to identify and describe certain genes in a collection of actinomycete strains isolated from different soils. As the most suitable were chosen genes homologous to gene lmrC originating from biosynthetic pathway of a lincosamid antibiotic lincomycin because of their relatively high incidence in antibiotic gene clusters. The employed methods were polymerase chain reaction, electrophoresis, restriction fragment length polymorphism and Southern blot. The results are presented as a collection of strains carrying lmrC gene homologues. The context in which each of the identified genes occurs in the respective genome was estimated by comparison with known sequences of the respective genes using a phylogram.en_US
dc.description.abstractUniverzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidát: Petra Šanderová Školitel: Doc. PharmDr. Tomáš Šimůnek, Ph. D, specialista: Ing. Jan Kopecký Název diplomové práce: Genová výbava producentů biologicky aktivních látek v půdních bakteriálních společenstvech Tato diplomová práce je součástí projektu detekce a izolace vybraných genů sekundárního metabolismu jako markerů přítomnosti biosyntetických drah podobných antibiotik. Mým úkolem bylo objevit a popsat určené geny ve sbírce kmenů aktinomycet izolovaných z rozdílných půd. Jako vhodné byly vybrány geny homologní ke genu lmrC pocházejícímu z biosyntetické dráhy linkosamidového antibiotika linkomycinu, protože jejich přítomnost v genových klastrech je poměrně častá. Využila jsem k tomu metody polymerázové řetězcové reakce, elektroforézy, štípání restrikčními enzymy a Southern blot. Výsledkem je kolekce kmenů nesoucích homology genu lmrC. Porovnáním s fylogramem známých sekvencí jsme se pokusili odhadnout, v jaké souvislosti se v genomu každý nalezený gen vyskytuje.cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.titleGenová výbava producentů biologicky aktivních látek v půdních bakteriálních společenstvechcs_CZ
dc.typerigorózní prácecs_CZ
dcterms.created2015
dcterms.dateAccepted2015-06-16
dc.description.departmentDepartment of Biochemical Sciencesen_US
dc.description.departmentKatedra biochemických vědcs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
dc.description.facultyFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.identifier.repId163746
dc.title.translatedGenetic apparatus of biologically active compounds producers in soil bacterial communitiesen_US
dc.contributor.refereeKyselková, Martina
dc.identifier.aleph002006864
thesis.degree.namePharmDr.
thesis.degree.levelrigorózní řízenícs_CZ
thesis.degree.disciplineFarmaciecs_CZ
thesis.degree.disciplinePharmacyen_US
thesis.degree.programPharmacyen_US
thesis.degree.programFarmaciecs_CZ
uk.thesis.typerigorózní prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csFarmaceutická fakulta v Hradci Králové::Katedra biochemických vědcs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Pharmacy in Hradec Králové::Department of Biochemical Sciencesen_US
uk.faculty-name.csFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
uk.faculty-abbr.csFaFcs_CZ
uk.degree-discipline.csFarmaciecs_CZ
uk.degree-discipline.enPharmacyen_US
uk.degree-program.csFarmaciecs_CZ
uk.degree-program.enPharmacyen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.csUniverzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidát: Petra Šanderová Školitel: Doc. PharmDr. Tomáš Šimůnek, Ph. D, specialista: Ing. Jan Kopecký Název diplomové práce: Genová výbava producentů biologicky aktivních látek v půdních bakteriálních společenstvech Tato diplomová práce je součástí projektu detekce a izolace vybraných genů sekundárního metabolismu jako markerů přítomnosti biosyntetických drah podobných antibiotik. Mým úkolem bylo objevit a popsat určené geny ve sbírce kmenů aktinomycet izolovaných z rozdílných půd. Jako vhodné byly vybrány geny homologní ke genu lmrC pocházejícímu z biosyntetické dráhy linkosamidového antibiotika linkomycinu, protože jejich přítomnost v genových klastrech je poměrně častá. Využila jsem k tomu metody polymerázové řetězcové reakce, elektroforézy, štípání restrikčními enzymy a Southern blot. Výsledkem je kolekce kmenů nesoucích homology genu lmrC. Porovnáním s fylogramem známých sekvencí jsme se pokusili odhadnout, v jaké souvislosti se v genomu každý nalezený gen vyskytuje.cs_CZ
uk.abstract.enCharles University in Prague Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Petra Šanderová Supervisor: Doc. PharmDr. Tomáš Šimůnek, Ph. D, specialist: Ing. Jan Kopecký Title of diploma thesis: Genetic apparatus of biologically active compounds producers in soil bacterial communities The thesis aims in selecting one possible marker indicating the presence of antibiotic biosynthetic pathways in studied strains. My specific task was to identify and describe certain genes in a collection of actinomycete strains isolated from different soils. As the most suitable were chosen genes homologous to gene lmrC originating from biosynthetic pathway of a lincosamid antibiotic lincomycin because of their relatively high incidence in antibiotic gene clusters. The employed methods were polymerase chain reaction, electrophoresis, restriction fragment length polymorphism and Southern blot. The results are presented as a collection of strains carrying lmrC gene homologues. The context in which each of the identified genes occurs in the respective genome was estimated by comparison with known sequences of the respective genes using a phylogram.en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra biochemických vědcs_CZ
thesis.grade.codeP
uk.publication-placeHradec Královécs_CZ
uk.thesis.defenceStatusU


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV