Zobrazit minimální záznam

The kinetic analysis of the enzyme reaction catalyzed by the globine coupled histidine kinase
dc.contributor.advisorMartínková, Markéta
dc.creatorFojtíková, Veronika
dc.date.accessioned2017-05-26T15:48:49Z
dc.date.available2017-05-26T15:48:49Z
dc.date.issued2014
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/63889
dc.description.abstractDvousložkové signální systémy, které se vyskytují především u bakterií, na základě signálu z okolí ovlivňují mnohé buněčné procesy. Typický dvousložkový signální systém je tvořen histidinkinasou a proteinem regulujícím odpověď (RR proteinem). Histidinkinasa obsahuje senzorovou doménu, která zachytí signál a katalytické jádro, na němž dochází prostřednictvím γ-fosfátového zbytku z hydrolyzovaného ATP k fosforylaci konzervovaného histidinu. Po takovéto aktivaci je fosfátová skupina z histidinkinasy přenesena na konzervovaný aspartátový zbytek RR proteinu. Tím je RR protein aktivován a je schopen vykonat svou funkci (obvykle se jedná o transkripční nebo enzymovou aktivitu), čímž reguluje mnohé buněčné procesy. Senzorová doména histidinkinasy je uzpůsobená pro vazbu konkrétní molekuly. Předkládaná diplomová práce se zabývá studiem unikátní histidinkinasy, jejíž senzorová doména obsahuje globinovou strukturu s vázanou molekulou hemu a jejím příslušným RR proteinem. Konkrétně se jedná o histidinkinasu s globinovou strukturou senzorové domény, izolovanou z Anaeromyxobacter sp., kmen Fw 109-5 (AfGcHK). Hlavním úkolem této diplomové práce bylo studium fosforylačních mechanismů AfGcHK a RR proteinu, vysvětlení jejich mechanismu působení a následné stanovení kinetických parametrů autofosforylační reakce...cs_CZ
dc.description.abstractTwo-component signal systems serve as basic stimulus-response coupling mechanism to allow organisms (predominantly bacteria) to sense and respond to changes in many environmental conditions. The prototypical system consists of two proteins, namely a histidine kinase, containing a sensor domain and catalytic kinase core, and a response regulator protein (RR protein). Extracellular stimuli are sensed by a histidine kinase sensor domain. Then ATP is bound to the catalytic kinase core and the γ-phosphoryl group is transferred to the conserved histidine residue. This phosphoryl group is subsequently transferred to a conserved aspartate residue within the RR protein. Phosphotransfer to the RR protein results in activation of a downstream effector domain that elicits the specific response (usually it is transcription activity, but a few RR proteins function as enzymes). The histidine kinase sensor domain is designed for specific ligand interactions. This master thesis focused on the unique histidine kinase containing a sensor domain with a globine structure, which coordinates a heme molecule, namely globin-coupled histidine kinase from Anaeromyxobacter sp. Fw 109-5 (AfGcHK) and its appropriate RR protein. The aim of this thesis was to study and characterize the phosphorylation activity of AfGcHK and RR...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectdvousložkové signální systémycs_CZ
dc.subjecthistidinkinasacs_CZ
dc.subjectRR proteincs_CZ
dc.subjectPhos-tagcs_CZ
dc.subjectnízkomolekulární donory fosfátucs_CZ
dc.subjectAfGcHKcs_CZ
dc.subjecttwo component signal systemsen_US
dc.subjecthistidine kinaseen_US
dc.subjectRR proteinen_US
dc.subjectPhos-tagen_US
dc.subjectlow molecular phosphodonorsen_US
dc.subjectAfGcHKen_US
dc.titleUrčení kinetických parametrů pro enzymovou reakci katalyzovanou histidinkinasou s globinovou strukturou senzorové doménycs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2014
dcterms.dateAccepted2014-06-02
dc.description.departmentDepartment of Biochemistryen_US
dc.description.departmentKatedra biochemiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId129083
dc.title.translatedThe kinetic analysis of the enzyme reaction catalyzed by the globine coupled histidine kinaseen_US
dc.contributor.refereeVaněk, Ondřej
dc.identifier.aleph001782076
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineKlinická a toxikologická analýzacs_CZ
thesis.degree.disciplineClinical and Toxicological Analysisen_US
thesis.degree.programKlinická a toxikologická analýzacs_CZ
thesis.degree.programClinical and Toxicological Analysisen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra biochemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Biochemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csKlinická a toxikologická analýzacs_CZ
uk.degree-discipline.enClinical and Toxicological Analysisen_US
uk.degree-program.csKlinická a toxikologická analýzacs_CZ
uk.degree-program.enClinical and Toxicological Analysisen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csDvousložkové signální systémy, které se vyskytují především u bakterií, na základě signálu z okolí ovlivňují mnohé buněčné procesy. Typický dvousložkový signální systém je tvořen histidinkinasou a proteinem regulujícím odpověď (RR proteinem). Histidinkinasa obsahuje senzorovou doménu, která zachytí signál a katalytické jádro, na němž dochází prostřednictvím γ-fosfátového zbytku z hydrolyzovaného ATP k fosforylaci konzervovaného histidinu. Po takovéto aktivaci je fosfátová skupina z histidinkinasy přenesena na konzervovaný aspartátový zbytek RR proteinu. Tím je RR protein aktivován a je schopen vykonat svou funkci (obvykle se jedná o transkripční nebo enzymovou aktivitu), čímž reguluje mnohé buněčné procesy. Senzorová doména histidinkinasy je uzpůsobená pro vazbu konkrétní molekuly. Předkládaná diplomová práce se zabývá studiem unikátní histidinkinasy, jejíž senzorová doména obsahuje globinovou strukturu s vázanou molekulou hemu a jejím příslušným RR proteinem. Konkrétně se jedná o histidinkinasu s globinovou strukturou senzorové domény, izolovanou z Anaeromyxobacter sp., kmen Fw 109-5 (AfGcHK). Hlavním úkolem této diplomové práce bylo studium fosforylačních mechanismů AfGcHK a RR proteinu, vysvětlení jejich mechanismu působení a následné stanovení kinetických parametrů autofosforylační reakce...cs_CZ
uk.abstract.enTwo-component signal systems serve as basic stimulus-response coupling mechanism to allow organisms (predominantly bacteria) to sense and respond to changes in many environmental conditions. The prototypical system consists of two proteins, namely a histidine kinase, containing a sensor domain and catalytic kinase core, and a response regulator protein (RR protein). Extracellular stimuli are sensed by a histidine kinase sensor domain. Then ATP is bound to the catalytic kinase core and the γ-phosphoryl group is transferred to the conserved histidine residue. This phosphoryl group is subsequently transferred to a conserved aspartate residue within the RR protein. Phosphotransfer to the RR protein results in activation of a downstream effector domain that elicits the specific response (usually it is transcription activity, but a few RR proteins function as enzymes). The histidine kinase sensor domain is designed for specific ligand interactions. This master thesis focused on the unique histidine kinase containing a sensor domain with a globine structure, which coordinates a heme molecule, namely globin-coupled histidine kinase from Anaeromyxobacter sp. Fw 109-5 (AfGcHK) and its appropriate RR protein. The aim of this thesis was to study and characterize the phosphorylation activity of AfGcHK and RR...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra biochemiecs_CZ
dc.identifier.lisID990017820760106986


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Tento záznam se objevuje v následujících sbírkách

Zobrazit minimální záznam


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV