Zobrazit minimální záznam

Vliv rozpouštědla na iontové párovaní a fotoionizaci ve vodě
dc.contributor.advisorJungwirth, Pavel
dc.creatorPluhařová, Eva
dc.date.accessioned2019-05-03T21:18:26Z
dc.date.available2019-05-03T21:18:26Z
dc.date.issued2014
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/63413
dc.description.abstractTitle: Solvent effects on ion pairing and photoionization in water Author: Mgr. et Ing. Eva Pluhařová Department: Physical and Macromoleculer Chemistry Advisor: Prof. Pavel Jungwirth, DSc., IOCB AS CR, v.v.i. Advisor's e-mail address: pavel.jungwirth@uochb.cas.cz Abstract: Various methods of theoretical chemistry, namely classical molecular dynamics simulations with empirical force fields, ab initio molecular dynamics, enhanced sampling methods, and ab initio calculations were used to provide new insight into ion pairing and photoionization in aqueous solutions. Systems mod- eling aqueous solutions of decreasing size were investigated by computational methods of increasing level of sophistication. In a classical molecular dynamics study of concentrated lithium salt solutions, the electronic continuum correction to account for polarization provided qualita- tive improvement over the conventional non-polarizable force fields and enabled molecular interpretation of neutron scattering measurements. The same model- ing approach was also successful in predicting the affinity of halide ions to the solution/oil interface. By combining ab initio molecular dynamics and potential of mean force cal- culations, we designed a reliable computational protocol for calculating the free energy profile for an ion pair...en_US
dc.description.abstractNázev práce: Vliv rozpouštědla na iontové párování a fotoionizaci ve vodě Autor: Mgr. et Ing. Eva Pluhařová Katedra: Fyzikální a makromolekulární chemie Vedoucí doktorské práce: Prof. Pavel Jungwirth, DSc., ÚOCHB AV ČR, v.v.i. E-mail vedoucího: pavel.jungwirth@uochb.cas.cz Abstrakt: Různé metody teoretické chemie, konkrétně klasická molekulová dy- namika s empirickými silovými poli, ab initio molekulová dynamika, metody rozšířeného vzorkování a ab initio výpočty, byly použity k hlubšímu pochopení iontového párování a fotoionizace ve vodných roztocích. Zmenšující se modelové systémy byly zkoumány výpočetními metodami rostoucí přesnosti a náročnosti. Při studiu koncentrovaných roztoků lithných solí klasickou molekulovou dy- namikou vedla oprava zahrnující elektronické kontinuun ke kvalitativnímu zlepšení oproti konvenčním nepolarizovatelným silovým polím, a tak umožnila interpretaci měření pomocí rozptylu neutronů. Stejný přístup byl také úspěšný pro předpověď afinity halidů k rozhraní voda/olej. Kombinací ab initio molekulové dynamiky a výpočtů potenciálu střední síly byl navržen spolehlivý postup pro výpočet profilu volné energie pro disociaci iontového páru. Poté byly odhadnuty rozdíly v síle...cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectiontové párovánícs_CZ
dc.subjectDNAcs_CZ
dc.subjectfotoionizacecs_CZ
dc.subjectmolekulová dynamikacs_CZ
dc.subjectab initio výpočtycs_CZ
dc.subjectsolvatacecs_CZ
dc.subjection pairingen_US
dc.subjectDNAen_US
dc.subjectphotoionizationen_US
dc.subjectmolecular dynamicsen_US
dc.subjectab initio calculationsen_US
dc.subjectsolvationen_US
dc.titleSolvent effects on ion pairing and photoionization in wateren_US
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2014
dcterms.dateAccepted2014-09-16
dc.description.departmentDepartment of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
dc.description.departmentKatedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId96502
dc.title.translatedVliv rozpouštědla na iontové párovaní a fotoionizaci ve voděcs_CZ
dc.contributor.refereeNachtigall, Petr
dc.contributor.refereeLaage, Damien
dc.identifier.aleph001862542
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.discipline-cs_CZ
thesis.degree.discipline-en_US
thesis.degree.programModelování chemických vlastností nano- a biostrukturcs_CZ
thesis.degree.programModeling of Chemical Properties of Nano- and Biostructuresen_US
uk.thesis.typedizertační prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.cs-cs_CZ
uk.degree-discipline.en-en_US
uk.degree-program.csModelování chemických vlastností nano- a biostrukturcs_CZ
uk.degree-program.enModeling of Chemical Properties of Nano- and Biostructuresen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.csNázev práce: Vliv rozpouštědla na iontové párování a fotoionizaci ve vodě Autor: Mgr. et Ing. Eva Pluhařová Katedra: Fyzikální a makromolekulární chemie Vedoucí doktorské práce: Prof. Pavel Jungwirth, DSc., ÚOCHB AV ČR, v.v.i. E-mail vedoucího: pavel.jungwirth@uochb.cas.cz Abstrakt: Různé metody teoretické chemie, konkrétně klasická molekulová dy- namika s empirickými silovými poli, ab initio molekulová dynamika, metody rozšířeného vzorkování a ab initio výpočty, byly použity k hlubšímu pochopení iontového párování a fotoionizace ve vodných roztocích. Zmenšující se modelové systémy byly zkoumány výpočetními metodami rostoucí přesnosti a náročnosti. Při studiu koncentrovaných roztoků lithných solí klasickou molekulovou dy- namikou vedla oprava zahrnující elektronické kontinuun ke kvalitativnímu zlepšení oproti konvenčním nepolarizovatelným silovým polím, a tak umožnila interpretaci měření pomocí rozptylu neutronů. Stejný přístup byl také úspěšný pro předpověď afinity halidů k rozhraní voda/olej. Kombinací ab initio molekulové dynamiky a výpočtů potenciálu střední síly byl navržen spolehlivý postup pro výpočet profilu volné energie pro disociaci iontového páru. Poté byly odhadnuty rozdíly v síle...cs_CZ
uk.abstract.enTitle: Solvent effects on ion pairing and photoionization in water Author: Mgr. et Ing. Eva Pluhařová Department: Physical and Macromoleculer Chemistry Advisor: Prof. Pavel Jungwirth, DSc., IOCB AS CR, v.v.i. Advisor's e-mail address: pavel.jungwirth@uochb.cas.cz Abstract: Various methods of theoretical chemistry, namely classical molecular dynamics simulations with empirical force fields, ab initio molecular dynamics, enhanced sampling methods, and ab initio calculations were used to provide new insight into ion pairing and photoionization in aqueous solutions. Systems mod- eling aqueous solutions of decreasing size were investigated by computational methods of increasing level of sophistication. In a classical molecular dynamics study of concentrated lithium salt solutions, the electronic continuum correction to account for polarization provided qualita- tive improvement over the conventional non-polarizable force fields and enabled molecular interpretation of neutron scattering measurements. The same model- ing approach was also successful in predicting the affinity of halide ions to the solution/oil interface. By combining ab initio molecular dynamics and potential of mean force cal- culations, we designed a reliable computational protocol for calculating the free energy profile for an ion pair...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
thesis.grade.codeP
dc.identifier.lisID990018625420106986


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Tento záznam se objevuje v následujících sbírkách

Zobrazit minimální záznam


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV