dc.contributor.advisor | Kavan, Daniel | |
dc.creator | Jurnečka, David | |
dc.date.accessioned | 2021-03-24T21:50:11Z | |
dc.date.available | 2021-03-24T21:50:11Z | |
dc.date.issued | 2015 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11956/62657 | |
dc.description.abstract | : Filamentózní hemaglutinin (FHA) je adhesivní proteinová molekula, která je uvolňována gram-negativní bakterií Bordetella pertusis, způsobující infekční onemocnění zvané černý kašel (pertuse). C-koncový segment FHA hraje klíčovou roli v interakci mezi bakterií a hostitelskými buňkami, nicméně jeho struktura zůstává zatím neznámá. V této práci byla identifikována C-koncová aminokyselina FHA jako alanin v pozici 2304, zatímco C-koncová aminokyselina degradačního produktu FHA (FHA*) byla v pozici 2228. Spektroskopie cirkulárního dichroismu (CD) a nukleární magnetická resonance (NMR) ukázaly, že C-koncový fragment FHA (FHA 1995-2228) má alfa-šroubovicový charakter a netvoří definovanou terciární strukturu. Navíc, potlačení transkripce malé regulační RNA párující se k5' konci fhaB transkriptu vede k dvojnásobnému zvýšení produkce FHA. Ze získaných dat vyplývá, že C- koncový segment FHA má vlastnosti nestrukturovaných proteinů a produkce FHA je negativně regulována pomocí malé RNA. Klíčová slova: Bordetella pertussis, filamentózní hemaglutinin, malá RNA | cs_CZ |
dc.description.abstract | : Filamentous hemagglutinin (FHA) is adhesive protein molecule that is secreted by Gram- negative bacterium Bordetella pertusis, the causative agent of whooping cough (pertussis). The C-terminal segment of FHA plays a crucial role in host-pathogen interaction, however, the structural features are still unknown. Here, we identified the C-terminal residue of FHA and processed form of FHA (FHA*) as alanine residues in position 2304 and 2228, respectively. Circular dichroism (CD) and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy demonstrated that the C-terminal segment of FHA(FHA 1995-2228) is characterized by alpha-helical contribution without any compact protein fold. Moreover, suppression of transcription of small regulatory RNA pairing to the 5'-end of fhaB transcript resulted in two- fold increase of FHA production. These data suggested that the C-terminal segment of FHA appear to be an unstructured protein and FHA secretion is negatively regulated by small regulatory RNA. (In Czech) Keywords: Bordetella pertussis, filamentous hemagglutinin, small RNA | en_US |
dc.language | Čeština | cs_CZ |
dc.language.iso | cs_CZ | |
dc.publisher | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.subject | Bordetella pertussis | en_US |
dc.subject | filamentous hemagglutinin | en_US |
dc.subject | small RNA | en_US |
dc.subject | Bordetella pertussis | cs_CZ |
dc.subject | filamentózní hemaglutinin | cs_CZ |
dc.subject | malá RNA | cs_CZ |
dc.title | Strukturní analýza filamentózního hemaglutininu (FhaB) z Bordetella pertussis | cs_CZ |
dc.type | diplomová práce | cs_CZ |
dcterms.created | 2015 | |
dcterms.dateAccepted | 2015-05-25 | |
dc.description.department | Department of Biochemistry | en_US |
dc.description.department | Katedra biochemie | cs_CZ |
dc.description.faculty | Faculty of Science | en_US |
dc.description.faculty | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.identifier.repId | 142131 | |
dc.title.translated | Structural analysis of filamentous hemagglutinin (FhaB) from Bordetella pertusis | en_US |
dc.contributor.referee | Man, Petr | |
dc.identifier.aleph | 002004452 | |
thesis.degree.name | Mgr. | |
thesis.degree.level | navazující magisterské | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Biochemie | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Biochemistry | en_US |
thesis.degree.program | Biochemistry | en_US |
thesis.degree.program | Biochemie | cs_CZ |
uk.thesis.type | diplomová práce | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-cs | Přírodovědecká fakulta::Katedra biochemie | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-en | Faculty of Science::Department of Biochemistry | en_US |
uk.faculty-name.cs | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
uk.faculty-name.en | Faculty of Science | en_US |
uk.faculty-abbr.cs | PřF | cs_CZ |
uk.degree-discipline.cs | Biochemie | cs_CZ |
uk.degree-discipline.en | Biochemistry | en_US |
uk.degree-program.cs | Biochemie | cs_CZ |
uk.degree-program.en | Biochemistry | en_US |
thesis.grade.cs | Velmi dobře | cs_CZ |
thesis.grade.en | Very good | en_US |
uk.abstract.cs | : Filamentózní hemaglutinin (FHA) je adhesivní proteinová molekula, která je uvolňována gram-negativní bakterií Bordetella pertusis, způsobující infekční onemocnění zvané černý kašel (pertuse). C-koncový segment FHA hraje klíčovou roli v interakci mezi bakterií a hostitelskými buňkami, nicméně jeho struktura zůstává zatím neznámá. V této práci byla identifikována C-koncová aminokyselina FHA jako alanin v pozici 2304, zatímco C-koncová aminokyselina degradačního produktu FHA (FHA*) byla v pozici 2228. Spektroskopie cirkulárního dichroismu (CD) a nukleární magnetická resonance (NMR) ukázaly, že C-koncový fragment FHA (FHA 1995-2228) má alfa-šroubovicový charakter a netvoří definovanou terciární strukturu. Navíc, potlačení transkripce malé regulační RNA párující se k5' konci fhaB transkriptu vede k dvojnásobnému zvýšení produkce FHA. Ze získaných dat vyplývá, že C- koncový segment FHA má vlastnosti nestrukturovaných proteinů a produkce FHA je negativně regulována pomocí malé RNA. Klíčová slova: Bordetella pertussis, filamentózní hemaglutinin, malá RNA | cs_CZ |
uk.abstract.en | : Filamentous hemagglutinin (FHA) is adhesive protein molecule that is secreted by Gram- negative bacterium Bordetella pertusis, the causative agent of whooping cough (pertussis). The C-terminal segment of FHA plays a crucial role in host-pathogen interaction, however, the structural features are still unknown. Here, we identified the C-terminal residue of FHA and processed form of FHA (FHA*) as alanine residues in position 2304 and 2228, respectively. Circular dichroism (CD) and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy demonstrated that the C-terminal segment of FHA(FHA 1995-2228) is characterized by alpha-helical contribution without any compact protein fold. Moreover, suppression of transcription of small regulatory RNA pairing to the 5'-end of fhaB transcript resulted in two- fold increase of FHA production. These data suggested that the C-terminal segment of FHA appear to be an unstructured protein and FHA secretion is negatively regulated by small regulatory RNA. (In Czech) Keywords: Bordetella pertussis, filamentous hemagglutinin, small RNA | en_US |
uk.file-availability | V | |
uk.grantor | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra biochemie | cs_CZ |
thesis.grade.code | 2 | |
dc.contributor.consultant | Bumba, Ladislav | |
uk.publication-place | Praha | cs_CZ |
uk.thesis.defenceStatus | O | |
dc.identifier.lisID | 990020044520106986 | |