Využití environmentálního sekvenování pro studium diverzity eukaryot
The use of environmental sequencing in the studies on eukaryotic diversity
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/62481Identifikátory
SIS: 143131
Kolekce
- Kvalifikační práce [19062]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Škaloud, Pavel
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Biologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra parazitologie
Datum obhajoby
10. 6. 2014
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
Diversita eukaryot, environmentální DNA, sekvenace, rRNA, fylogenetikaKlíčová slova (anglicky)
Diversity of eukaryotes, environmental DNA, sequencing, rRNA, phylogeneticsBakalářská práce se zaměřuje na metodu environmentálního sekvenování a její využití při zkoumání diverzity eukaryotických mikrobů. Popisuje samotnou metodu, její mechanismus, možnosti použití i problémy s ní spojené. V práci je popsán současný pohled na fylogenetiku hlavních eukaryotických linií. Není opomenuta ani bližší charakteristika těchto linií. Pozornost je věnována zejména nově objeveným skupinám. Práce řeší příbuzenské vztahy uvnitř těchto skupin, shrnuje poznatky o jejich ekologii, potravních zdrojích a morfologii. Samostatná kapitola je věnována výskytu protistních skupin v extrémních podmínkách prostředí. Klíčová slova: Diverzita eukaryot, environmentální DNA, sekvenace, rRNA, fylogenetika.
The bachelor's thesis focuses on environmental sequencing method and its usage in examining the diversity of microbial eukaryotic organisms. It describes the method, its mechanism, application and the problems associated with it. The work describes the current view of the phylogeny of the major eukaryotic lineages with their closer characteristics. Particular attention is paid to newly discovered groups. The work addresses the relationships inside these groups, summarizes findings of their ecology, food resources, and morphology. A separate chapter is devoted to the occurrence of the protist groups in extreme environmental conditions. Key words: Diversity of eukaryotes, environmental DNA, sequencing, rRNA, phylogenetics.