dc.contributor.advisor | Plášek, Jaromír | |
dc.creator | Dostál, Marek | |
dc.date.accessioned | 2021-03-25T23:17:58Z | |
dc.date.available | 2021-03-25T23:17:58Z | |
dc.date.issued | 2013 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11956/60987 | |
dc.description.abstract | Název práce: Zobrazování fluorescenčně značených mitochondrií metodou Biplane FPALM Autor: Bc. Marek Dostál Ústav: Fyzikální ústav UK Vedoucí práce: prof. RNDr. Jaromír Plášek, CSc. Konzultanti: RNDr. Petr Ježek, DrSc. Mgr. Hana Engstová, Ph.D. Abstrakt: V této práci jsme hledali a nalezli vhodné PCFP markery pro vizualizaci vnitřní a vnější membrány mitochondrií na unikátním prototypu biplane FPALM mikroskopu. Podíleli jsme se na odlaďování měřicího softwaru za účelem 3D vizualizace mitochondriálních sítí a určení jejich parametrů. K tomuto účelu jsme vyvinuli dvě metody. Jedna je použitelná při určování parametrů vnějších membrán a druhá při určování parametrů vnitřních membrán. Na menším statistickém souboru dat se nám podařilo potvrdit závislost kvality mitochondriální sítě na podmínkách kultivace buněk. Ve stresových podmínkách, jakými je např. hypoxie, se kvalita mitochondriální sítě mění oproti kultivaci za normálních podmínek. Klíčová slova: mitochondrie, Biplane FPALM, GFP, 3D vizualizace. | cs_CZ |
dc.description.abstract | Title: Imaging of fluorescently labelled mitochondria using Biplane FPALM microscopy Author: Bc. Marek Dostál Department: Fyzikální ústav UK Supervisor: prof. RNDr. Jaromír Plášek, CSc. Consultants: RNDr. Petr Ježek, DrSc. Mgr. Hana Engstová, Ph.D. Abstract: In this thesis the results are presented of a search for suitable PCFP markers for a visualization inner and outer mitochondrial membranes by unique biplane FPALM microscope. We participated in debugging the measuring software for the purpose of 3D vizualization mitochondrial nets and determine their parameters. For this purpose were developed two methods. The first one can be applied to determine the parametrs of outer membranes and the second one is applicable to determine parametrs of inner membranes. On smaller statistical file we managed to confirm dependence quality of mitochondrial net on the cell culture conditions. Under stress conditions e.g. hypoxia the quality of mitochondrial net is changed. Keywords: mitochondria, Biplane FPALM, GFP, 3D visualization. | en_US |
dc.language | Čeština | cs_CZ |
dc.language.iso | cs_CZ | |
dc.publisher | Univerzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakulta | cs_CZ |
dc.subject | mitochondria | en_US |
dc.subject | fluorescent proteins | en_US |
dc.subject | microscopy | en_US |
dc.subject | superresolution | en_US |
dc.subject | FPALM | en_US |
dc.subject | mitochondrie fluorescenční proteiny | cs_CZ |
dc.subject | mikroskopie | cs_CZ |
dc.subject | superrozlišení | cs_CZ |
dc.subject | FPALM | cs_CZ |
dc.title | Zobrazování fluorescenčně značených mitochondrií metodou Biplane_FPALM | cs_CZ |
dc.type | diplomová práce | cs_CZ |
dcterms.created | 2013 | |
dcterms.dateAccepted | 2013-05-27 | |
dc.description.department | Fyzikální ústav UK | cs_CZ |
dc.description.department | Institute of Physics of Charles University | en_US |
dc.description.faculty | Matematicko-fyzikální fakulta | cs_CZ |
dc.description.faculty | Faculty of Mathematics and Physics | en_US |
dc.identifier.repId | 116658 | |
dc.title.translated | Imaging of fluorescently labelled mitochondria using Biplane_FPALM microscopy | en_US |
dc.contributor.referee | Valenta, Jan | |
dc.identifier.aleph | 001591495 | |
thesis.degree.name | Mgr. | |
thesis.degree.level | navazující magisterské | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Biophysics and Chemical Physics | en_US |
thesis.degree.discipline | Biofyzika a chemická fyzika | cs_CZ |
thesis.degree.program | Fyzika | cs_CZ |
thesis.degree.program | Physics | en_US |
uk.thesis.type | diplomová práce | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-cs | Matematicko-fyzikální fakulta::Fyzikální ústav UK | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-en | Faculty of Mathematics and Physics::Institute of Physics of Charles University | en_US |
uk.faculty-name.cs | Matematicko-fyzikální fakulta | cs_CZ |
uk.faculty-name.en | Faculty of Mathematics and Physics | en_US |
uk.faculty-abbr.cs | MFF | cs_CZ |
uk.degree-discipline.cs | Biofyzika a chemická fyzika | cs_CZ |
uk.degree-discipline.en | Biophysics and Chemical Physics | en_US |
uk.degree-program.cs | Fyzika | cs_CZ |
uk.degree-program.en | Physics | en_US |
thesis.grade.cs | Výborně | cs_CZ |
thesis.grade.en | Excellent | en_US |
uk.abstract.cs | Název práce: Zobrazování fluorescenčně značených mitochondrií metodou Biplane FPALM Autor: Bc. Marek Dostál Ústav: Fyzikální ústav UK Vedoucí práce: prof. RNDr. Jaromír Plášek, CSc. Konzultanti: RNDr. Petr Ježek, DrSc. Mgr. Hana Engstová, Ph.D. Abstrakt: V této práci jsme hledali a nalezli vhodné PCFP markery pro vizualizaci vnitřní a vnější membrány mitochondrií na unikátním prototypu biplane FPALM mikroskopu. Podíleli jsme se na odlaďování měřicího softwaru za účelem 3D vizualizace mitochondriálních sítí a určení jejich parametrů. K tomuto účelu jsme vyvinuli dvě metody. Jedna je použitelná při určování parametrů vnějších membrán a druhá při určování parametrů vnitřních membrán. Na menším statistickém souboru dat se nám podařilo potvrdit závislost kvality mitochondriální sítě na podmínkách kultivace buněk. Ve stresových podmínkách, jakými je např. hypoxie, se kvalita mitochondriální sítě mění oproti kultivaci za normálních podmínek. Klíčová slova: mitochondrie, Biplane FPALM, GFP, 3D vizualizace. | cs_CZ |
uk.abstract.en | Title: Imaging of fluorescently labelled mitochondria using Biplane FPALM microscopy Author: Bc. Marek Dostál Department: Fyzikální ústav UK Supervisor: prof. RNDr. Jaromír Plášek, CSc. Consultants: RNDr. Petr Ježek, DrSc. Mgr. Hana Engstová, Ph.D. Abstract: In this thesis the results are presented of a search for suitable PCFP markers for a visualization inner and outer mitochondrial membranes by unique biplane FPALM microscope. We participated in debugging the measuring software for the purpose of 3D vizualization mitochondrial nets and determine their parameters. For this purpose were developed two methods. The first one can be applied to determine the parametrs of outer membranes and the second one is applicable to determine parametrs of inner membranes. On smaller statistical file we managed to confirm dependence quality of mitochondrial net on the cell culture conditions. Under stress conditions e.g. hypoxia the quality of mitochondrial net is changed. Keywords: mitochondria, Biplane FPALM, GFP, 3D visualization. | en_US |
uk.file-availability | V | |
uk.grantor | Univerzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakulta, Fyzikální ústav UK | cs_CZ |
thesis.grade.code | 1 | |
dc.contributor.consultant | Ježek, Petr | |
uk.publication-place | Praha | cs_CZ |
uk.thesis.defenceStatus | O | |
dc.identifier.lisID | 990015914950106986 | |