Show simple item record

Study of intermolecular interactions by isothermal titration calorimetry
Studium mezimolekulových interakcí pomocí isotermální titrační kalorimetrie
dc.contributor.advisorObšil, Tomáš
dc.creatorPšenáková, Katarína
dc.date.accessioned2017-05-16T17:56:06Z
dc.date.available2017-05-16T17:56:06Z
dc.date.issued2013
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/57905
dc.description.abstractKalorimetrické metódy sa využívajú na štúdium mechanizmov regulácie a riadenia biologických procesov na molekulárnej úrovni. Izotermálna titračná kalorimetria sa používa na sledovanie tepelnej výmeny pri molekulových interakciách v prostredí s konštantnou teplotou, využívaná je najmä pre jej priamy prístup merania termodynamických parametrov spojených s formáciou komplexov. Štandardne sa metódou ITC skúmajú biochemické interakcie, ako sú interakcie typu proteín - proteín, proteín - ligand alebo enzým - substrát. Cieľom tejto práce bolo (I) osvojiť si prácu s nano izotermálnym titračným kalorimetrom, (II) pripraviť DNA- väzbovú doménu ľudského transkripčného faktoru FOXO4 (FOXO4-DBD) a (III) preskúmať termodynamické aspekty interakcie medzi FOXO4-DBD a dvojvláknovej molekuly DNA (dsDNA) obsahujúcej špecifický väzbový motív. Proteín FOXO4 je jedným zo štyroch zástupcov "O" podskupiny forkhead transkripčných faktorov FOXO, ktoré hrajú významnú rolu v mnohých bunkových procesoch, vrátane onkogenézy, alebo ochrany pred stresom a starnutím. Forkhead doména sa viaže na sekvenciu DNA obsahujúcu väzbový motív 5'-(A/C)AA(C/T)A-3' so stechiometriou 1:1. Výsledky tejto práce potvrdili, že DNA-väzbová doména FOXO4 viaže študovanú dsDNA s disociačnou konštantou KD = 3,58 · 10−7 mol·dm−3 . Okrem väzbovej afinity...cs_CZ
dc.description.abstractCalorimetric methods are used to studying the mechanism of regulation and control of biological processes at the molecular level. Isothermal titration calorimetry (ITC) is used for monitoring the heat exchange of molecular interactions in an environment with constant temperature. This method is also preferred because of its ability of direct measurement of thermodynamic parameters associated with complex formation. ITC measures mostly the energetics of biochemical reactions or molecular interactions protein-protein, protein-ligand, or enzyme-substrate. Main goals of this bachelor thesis were: (I) to acquire working skills with nano isothermal titration calorimeter; (II) to prepare the DNA-binding domain of human transcription factor FOXO4 (FOXO4-DBD); and (III) to study thermodynamic aspects of the interaction between FOXO4-DBD and the double-stranded DNA containing specific binding motif. FOXO4 protein is one of the four members of a "O" subgroup of forkhead transcription factors FOX, which play an important role in many cellular processes including stress resistance, age control and oncogenesis. Forkhead DNA- binding domain recognizes sequences containing the core motif 5'-(A/C)AA(C/T)A-3' with the binding stoichiometry 1:1. Results of this bachelor thesis show that FOXO4-DBD binds the...en_US
dc.languageSlovenčinacs_CZ
dc.language.isosk_SK
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectinterakcecs_CZ
dc.subjectITCcs_CZ
dc.subjectenthalpiecs_CZ
dc.subjectkalorimetriecs_CZ
dc.subjectinteraction,ITCen_US
dc.subjectenthalpyen_US
dc.subjectcalorimetryen_US
dc.titleŠtúdium medzimolekulových interakcií pomocou izotermálnej titračnej kalorimetriesk_SK
dc.typebakalářská prácecs_CZ
dcterms.created2013
dcterms.dateAccepted2013-09-18
dc.description.departmentDepartment of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
dc.description.departmentKatedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId129513
dc.title.translatedStudy of intermolecular interactions by isothermal titration calorimetryen_US
dc.title.translatedStudium mezimolekulových interakcí pomocí isotermální titrační kalorimetriecs_CZ
dc.contributor.refereeAlblová, Miroslava
dc.identifier.aleph001625663
thesis.degree.nameBc.
thesis.degree.levelbakalářskécs_CZ
thesis.degree.disciplineChemistry in Natural Sciencesen_US
thesis.degree.disciplineChemie v přírodních vědáchcs_CZ
thesis.degree.programChemiecs_CZ
thesis.degree.programChemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csChemie v přírodních vědáchcs_CZ
uk.degree-discipline.enChemistry in Natural Sciencesen_US
uk.degree-program.csChemiecs_CZ
uk.degree-program.enChemistryen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csKalorimetrické metódy sa využívajú na štúdium mechanizmov regulácie a riadenia biologických procesov na molekulárnej úrovni. Izotermálna titračná kalorimetria sa používa na sledovanie tepelnej výmeny pri molekulových interakciách v prostredí s konštantnou teplotou, využívaná je najmä pre jej priamy prístup merania termodynamických parametrov spojených s formáciou komplexov. Štandardne sa metódou ITC skúmajú biochemické interakcie, ako sú interakcie typu proteín - proteín, proteín - ligand alebo enzým - substrát. Cieľom tejto práce bolo (I) osvojiť si prácu s nano izotermálnym titračným kalorimetrom, (II) pripraviť DNA- väzbovú doménu ľudského transkripčného faktoru FOXO4 (FOXO4-DBD) a (III) preskúmať termodynamické aspekty interakcie medzi FOXO4-DBD a dvojvláknovej molekuly DNA (dsDNA) obsahujúcej špecifický väzbový motív. Proteín FOXO4 je jedným zo štyroch zástupcov "O" podskupiny forkhead transkripčných faktorov FOXO, ktoré hrajú významnú rolu v mnohých bunkových procesoch, vrátane onkogenézy, alebo ochrany pred stresom a starnutím. Forkhead doména sa viaže na sekvenciu DNA obsahujúcu väzbový motív 5'-(A/C)AA(C/T)A-3' so stechiometriou 1:1. Výsledky tejto práce potvrdili, že DNA-väzbová doména FOXO4 viaže študovanú dsDNA s disociačnou konštantou KD = 3,58 · 10−7 mol·dm−3 . Okrem väzbovej afinity...cs_CZ
uk.abstract.enCalorimetric methods are used to studying the mechanism of regulation and control of biological processes at the molecular level. Isothermal titration calorimetry (ITC) is used for monitoring the heat exchange of molecular interactions in an environment with constant temperature. This method is also preferred because of its ability of direct measurement of thermodynamic parameters associated with complex formation. ITC measures mostly the energetics of biochemical reactions or molecular interactions protein-protein, protein-ligand, or enzyme-substrate. Main goals of this bachelor thesis were: (I) to acquire working skills with nano isothermal titration calorimeter; (II) to prepare the DNA-binding domain of human transcription factor FOXO4 (FOXO4-DBD); and (III) to study thermodynamic aspects of the interaction between FOXO4-DBD and the double-stranded DNA containing specific binding motif. FOXO4 protein is one of the four members of a "O" subgroup of forkhead transcription factors FOX, which play an important role in many cellular processes including stress resistance, age control and oncogenesis. Forkhead DNA- binding domain recognizes sequences containing the core motif 5'-(A/C)AA(C/T)A-3' with the binding stoichiometry 1:1. Results of this bachelor thesis show that FOXO4-DBD binds the...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 3-5, 116 36 Praha; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV