Studium proteomu dentinu lidských zubů

Abstract

Analýza proteomu dentinu v lidských zubech dospělých jedinců byla provedena za účelem optimalizace analýzy proteinů zubního dentinu metodou dvourozměrné gelové elektroforézy (2-DE). Zuby moudrosti byly očištěny, rozdrceny a extrahovány v guanidinovém a EDTA pufru. Extrahované proteiny byly separovány 2-DE, naštípány trypsinem na peptidy a následně bylo ve vzorcích pomocí nLC MS/MS identifikováno celkem 7 proteinů. Využití IPG stripů s různou škálou oblasti pH gradientu a následné srovnání 2 DE gelů bohužel nepřineslo významné nové informace, neboť byly identifikovány především keratiny, kolageny a sérový albumin.

Proteome analysis of dentin in human teeth adult subjects was conducted to optimize the two dimensional gel electrophoresis (2-DE) analysis of proteins from the dental tissue. The third molar teeth were cleaned, crushed and extracted in guanidine and EDTA buffer. Extracted proteins were separated by 2-DE, digested with trypsin to peptides and subsequently analyzed using nLC MS/MS. Totally, 7 unique proteins were identified in the samples. The use of IPG strips with different range of the pH gradient and the subsequent comparison of 2 DE gels unfortunately did not bring important new information, because common keratin, collagen and serum albumin proteins were identified.