Morfologická a molekulární charakterizace anaerobních zástupců rodu Andalucia (Excavata: Jakobida)

Abstract

Eukaryotické organizmy jsou dnes řazeny do zhruba třiceti skupin, existuje ale i řada organizmů, u kterých si nejsme jisti, kam je na eukaryotickém stromu umístit. Tato práce se zabývá druhově malou, ale evolučně významnou protistní skupinou jakobidů patřící do říše Excavata. Společně se skupinami Heterolobosea, Euglenozoa a Tsukubamonadida tvoří skupinu Discoba, patřící do eukaryotické superskupiny Excavata. Zástupci jakobidů jsou důležití především svým složitým mitochondriálním genomem. Ten svoji strukturou připomíná původní α-proteobakteriální genom samostatně žijícího předka mitochondrie. Někteří zástupci jakobidů mají však mitochondriální genom zjednodušen, zástupci jakobidů jsou tak potencionálním kandidátem pro modelovou skupinu pro studium evoluce mitochondrie. Zatím je však znám pouze malý počet jakobidů a pro detailnější studium evolučních otázek je potřeba znát fylogenezi dané skupiny. Tato práce se soustředí na rozšíření znalostí druhové bohatosti rodu Andalucia. Celkem bylo do kultury převedeno 20 nových kmenů rodu Andalucia, u kterých se povedlo určit sekvence SSU rDNA, a také se z těchto kmenů podařilo získat morfologická data. Díky provedené fylogenetické analýze můžeme prohlásit, že druh Andalucia incarcerata se rozpadá na tři linie. Morfologicky jsou sice tyto linie jen velmi...

Eukaryotic organisms are divided into about 30 groups today, yet there still reamain many groups whose classification in the eukaryotic tree we are not sure about. This study focused on jacobids, a evolutionary important protist group from the Excavata taxa. Together with Heterolobosea, Euglenozoa and Tsukubamonadida, jacobids constitue a Discoba subgroup of Excavata taxa. Jacobids are significant mainly for their mitochondrial genome, which structurally resembles the original α-proteobacterial genome of the free-living ancestor of mitochondria. Some jacobids have their mitochondrial genome simplified, making them potential candidates for a model group used to study the mitochondrial evolution. However, too few members of jacobid group have been identified so far and the exact phylogeny of the group must be thoroughly understood for the detailed study of mitochondria evolution. This study focuses on broadening the taxonomic coverage of the jacobid excavate protists Andalucia. Twenty new strains of Andalucia have been established into stable culture, their morphology was assessed and SSU rDNA sequenced. Based on the phylogenetic analysis, Andalucia incarcarata species divides into three morphologically almost indistinguishable lines representing three species. Further, this study characterized a...