Show simple item record

The role of untranslated mRNA regions in Giardia intestinalis.
dc.contributor.advisorDoležal, Pavel
dc.creatorNajdrová, Vladimíra
dc.date.accessioned2017-05-16T01:52:54Z
dc.date.available2017-05-16T01:52:54Z
dc.date.issued2013
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/54360
dc.description.abstractGiardia intestinalis je anaerobní jednobuněčný patogen, původce nemoci známé jako giardióza. Doposud máme pouze omezené informace o regulaci genové exprese u tohoto organismu, výjimkou jsou informace o pravděpodobném přepínání exprese povrchových antigenů. V předkládané práci jsme se zaměřili na možnou úlohu 3' nepřekládaných oblastí (3'UTR) mRNA, které zprostředkovávají stabilitu i lokalizaci mRNA transkriptů. K sledování a objasnění úloh 3' UTR využíváme RNA vazebné proteiny rodiny PUF, které se podílejí na kontrole transkriptů jejich represí, aktivací nebo degradací. Tyto výhradně eukaryotické proteiny jsou vysoce konzervované. Každý z proteinů obsahuje v C-koncové oblasti konzervativní doménu, která specificky váže 3'UTR v mRNA. Podařilo se nám identifikovat pět různých PUF proteinů v genomu G. intestinalis (GiPUF), prokázat jejich přirozenou expresi v trofozoitech G. intestinalis a lokalizovat všech pět GiPUF proteinů v cytoplasmě. GiPUF 2, GiPUF3 a GiPUF5 navíc vykazují afinitu k povrchu ER. V proteinových sekvencích jsme identifikovali C-koncovou vazebnou doménu u všech GiPUF proteinů. Nejvíce konzervovaný GiPUF4 obsahuje 8 vazebných míst, navíc téměř identických s vazebnými místy lidského PUF proteinu PUM1, kvasinkového PUF3p, FBF1 C. elegans, PUM D. melanogaster a PUF1 P. falciparum, což...cs_CZ
dc.description.abstractGiardia intestinalis is an anaerobic protozoan pathogen, agent of the disease known as giardiasis. The regulation of gene expression during giardia cell- and life-cycle has been poorly studied so far, with the exception of variable surface proteins, which constitute the immunoprotective coat of the cell. In this diploma thesis, we focus on the possible role of the 3' untranslated region (3'UTR) of mRNA that mediate stability and localization of mRNA transcripts. We use RNA binding proteins of PUF family, which control the function of the target transcripts by their repression, activation or sequestration, to monitor and verify the role of 3'UTRs. These only eukaryotic proteins are highly evolutionarily conserved. Each of them contain highly conserved C-terminal domain, which specificly binds to 3'UTR of mRNAs. We have identified five different PUF proteins in the genome of G. intestinalis (GiPUF), cinfirmed their expression in G. intestinalis trophozoites and located all five proteins in the cytoplasm. GiPUF2, GiPUF3 and GiPUF5 show an additional affinity to the surface of the endoplasmic reticulum. We have identified the C-terminal binding domain in protein sequences of all GiPUF. The most conserved GiPUF4 contain eight binding sites, nearly identical to the binding site of human Pum1 protein,...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subject3'UTRcs_CZ
dc.subjectRNA vazebné proteincs_CZ
dc.subjectlocalizace proteinůcs_CZ
dc.subject3'UTRen_US
dc.subjectRNA binding proteinsen_US
dc.subjectprotein localizationen_US
dc.titleÚloha nepřekládaných oblastí mRNA v Giardia intestinalis.cs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2013
dcterms.dateAccepted2013-09-17
dc.description.departmentDepartment of Parasitologyen_US
dc.description.departmentKatedra parazitologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId117311
dc.title.translatedThe role of untranslated mRNA regions in Giardia intestinalis.en_US
dc.contributor.refereeZubáčová, Zuzana
dc.identifier.aleph001625739
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineParasitologyen_US
thesis.degree.disciplineParazitologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra parazitologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Parasitologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csParazitologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enParasitologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVelmi dobřecs_CZ
thesis.grade.enVery gooden_US
uk.abstract.csGiardia intestinalis je anaerobní jednobuněčný patogen, původce nemoci známé jako giardióza. Doposud máme pouze omezené informace o regulaci genové exprese u tohoto organismu, výjimkou jsou informace o pravděpodobném přepínání exprese povrchových antigenů. V předkládané práci jsme se zaměřili na možnou úlohu 3' nepřekládaných oblastí (3'UTR) mRNA, které zprostředkovávají stabilitu i lokalizaci mRNA transkriptů. K sledování a objasnění úloh 3' UTR využíváme RNA vazebné proteiny rodiny PUF, které se podílejí na kontrole transkriptů jejich represí, aktivací nebo degradací. Tyto výhradně eukaryotické proteiny jsou vysoce konzervované. Každý z proteinů obsahuje v C-koncové oblasti konzervativní doménu, která specificky váže 3'UTR v mRNA. Podařilo se nám identifikovat pět různých PUF proteinů v genomu G. intestinalis (GiPUF), prokázat jejich přirozenou expresi v trofozoitech G. intestinalis a lokalizovat všech pět GiPUF proteinů v cytoplasmě. GiPUF 2, GiPUF3 a GiPUF5 navíc vykazují afinitu k povrchu ER. V proteinových sekvencích jsme identifikovali C-koncovou vazebnou doménu u všech GiPUF proteinů. Nejvíce konzervovaný GiPUF4 obsahuje 8 vazebných míst, navíc téměř identických s vazebnými místy lidského PUF proteinu PUM1, kvasinkového PUF3p, FBF1 C. elegans, PUM D. melanogaster a PUF1 P. falciparum, což...cs_CZ
uk.abstract.enGiardia intestinalis is an anaerobic protozoan pathogen, agent of the disease known as giardiasis. The regulation of gene expression during giardia cell- and life-cycle has been poorly studied so far, with the exception of variable surface proteins, which constitute the immunoprotective coat of the cell. In this diploma thesis, we focus on the possible role of the 3' untranslated region (3'UTR) of mRNA that mediate stability and localization of mRNA transcripts. We use RNA binding proteins of PUF family, which control the function of the target transcripts by their repression, activation or sequestration, to monitor and verify the role of 3'UTRs. These only eukaryotic proteins are highly evolutionarily conserved. Each of them contain highly conserved C-terminal domain, which specificly binds to 3'UTR of mRNAs. We have identified five different PUF proteins in the genome of G. intestinalis (GiPUF), cinfirmed their expression in G. intestinalis trophozoites and located all five proteins in the cytoplasm. GiPUF2, GiPUF3 and GiPUF5 show an additional affinity to the surface of the endoplasmic reticulum. We have identified the C-terminal binding domain in protein sequences of all GiPUF. The most conserved GiPUF4 contain eight binding sites, nearly identical to the binding site of human Pum1 protein,...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra parazitologiecs_CZ
dc.identifier.lisID990016257390106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV