Show simple item record

Genetic diversity of two freshwater molluscs - Anisus vorticulus and Aplexa hypnorum - in central Europe
dc.contributor.advisorČerný, Martin
dc.creatorBuďová, Jana
dc.date.accessioned2017-05-16T01:50:44Z
dc.date.available2017-05-16T01:50:44Z
dc.date.issued2013
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/54350
dc.description.abstractPředmětem mé práce bylo shrnutí genetické variability sladkovodních plžů periodických tůní. Modelovými druhy byla ubývající levotočka bažinná (Aplexa hypnorum) a kriticky ohrožený svinutec tenký (Anisus vorticulus). Genetická variabilita byla zkoumána pomocí dvou mitochondriálních a dvo jaderných markerů. Rozložení genetické variability na genu COI u levotočky bažinné odpovídá různým povodím. Ostatní genetické markery (16S, ITS) však tento trend nepotvrdily. Příčiny tohoto nesouladu mezi různými markery jsou diskutovány několika různými způsoby zahrnujícími možné historické scénáře vývoje populací levotočky, ale i možné chyby laboratorních metod. V této studii byla zaznamenána obecně malá úspěšnost amplifikace, jejím nejpravděpodobnějším důvodem je inhibiční vliv mukusu plžů na amplifikaci DNA. Dalším problémem, který při této práci nastal, bylo získání sekvence parazita (motolice) místo genu svinutce, i za použití primerů specifických pro plže. Kromě genetické a související metodické části má tato práce i třetí část zabývající se vyhodnocením environmentálních faktorů periodických tůní v přítomnosti a nepřítomnosti studovaných druhů a čtvrtou část zabývající se fylogenetickou analýzou evropských a amerických linií levotoček. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)cs_CZ
dc.description.abstractThe aim of my study was to sum up the data about genetic variability of freshwater gastropods living in temporary ponds. My model species were moss bladder snail (Aplexa hypnorum) and the critically endangered ramshorn snail (Anisus vorticulus). Genetic variability was investigated by two mtDNA and two nuclear markers. The differences in genetic variation at the COI gene follow the pattern of different catchments. However, these findings do not agree with the patterns derived from genetic markers ITS1 and 16S. The reasons for the differences between the different markers are discussed in several ways involving few possible historical scenarios, but also possible errors of laboratory methods. In this study, there was only little success in amplification and the most likely reason is the inhibitory effect of snail mucus on DNA amplification. Another problem that occurred when this work was to obtain the sequence of the parasite (fluke) instead Anisus gene using gastropod specific primers. In addition to genetic and related methodological part of this work is the third part concerning the evaluation of environmental factors periodic pools in the presence and absence of the species studied. The fourth part sis focused on the phylogenetical analyses of the european and american Aplexa linneages. Powered by TCPDF...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectPeriodické tůněcs_CZ
dc.subjectGenetická variabilitacs_CZ
dc.subjectCOIcs_CZ
dc.subject16Scs_CZ
dc.subjectITS-1cs_CZ
dc.subjectITS-2cs_CZ
dc.subjectAplexa hypnorumcs_CZ
dc.subjectAplexa elongatacs_CZ
dc.subjectAnisus vorticuluscs_CZ
dc.subjectenvironmentální faktorycs_CZ
dc.subjectfylogenetická analýzacs_CZ
dc.subjectTemporary pondsen_US
dc.subjectgenetic vaiabilityen_US
dc.subjectCOIen_US
dc.subject16Sen_US
dc.subjectITS-1en_US
dc.subjectITS-2en_US
dc.subjectAplexa hypnorumen_US
dc.subjectAplexa elongataen_US
dc.subjectAnisus vorticulusen_US
dc.subjectenviromental factorsen_US
dc.subjectphylogenetical analysesen_US
dc.titleGenetická diverzita vodních plžů Aplexa hypnorum a Anisus vorticulus v rámci střední Evropycs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2013
dcterms.dateAccepted2013-09-17
dc.description.departmentDepartment of Ecologyen_US
dc.description.departmentKatedra ekologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId118975
dc.title.translatedGenetic diversity of two freshwater molluscs - Anisus vorticulus and Aplexa hypnorum - in central Europeen_US
dc.contributor.refereeŠtefka, Jan
dc.identifier.aleph001626466
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineEcologyen_US
thesis.degree.disciplineEkologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra ekologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Ecologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csEkologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enEcologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csDobřecs_CZ
thesis.grade.enGooden_US
uk.abstract.csPředmětem mé práce bylo shrnutí genetické variability sladkovodních plžů periodických tůní. Modelovými druhy byla ubývající levotočka bažinná (Aplexa hypnorum) a kriticky ohrožený svinutec tenký (Anisus vorticulus). Genetická variabilita byla zkoumána pomocí dvou mitochondriálních a dvo jaderných markerů. Rozložení genetické variability na genu COI u levotočky bažinné odpovídá různým povodím. Ostatní genetické markery (16S, ITS) však tento trend nepotvrdily. Příčiny tohoto nesouladu mezi různými markery jsou diskutovány několika různými způsoby zahrnujícími možné historické scénáře vývoje populací levotočky, ale i možné chyby laboratorních metod. V této studii byla zaznamenána obecně malá úspěšnost amplifikace, jejím nejpravděpodobnějším důvodem je inhibiční vliv mukusu plžů na amplifikaci DNA. Dalším problémem, který při této práci nastal, bylo získání sekvence parazita (motolice) místo genu svinutce, i za použití primerů specifických pro plže. Kromě genetické a související metodické části má tato práce i třetí část zabývající se vyhodnocením environmentálních faktorů periodických tůní v přítomnosti a nepřítomnosti studovaných druhů a čtvrtou část zabývající se fylogenetickou analýzou evropských a amerických linií levotoček. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)cs_CZ
uk.abstract.enThe aim of my study was to sum up the data about genetic variability of freshwater gastropods living in temporary ponds. My model species were moss bladder snail (Aplexa hypnorum) and the critically endangered ramshorn snail (Anisus vorticulus). Genetic variability was investigated by two mtDNA and two nuclear markers. The differences in genetic variation at the COI gene follow the pattern of different catchments. However, these findings do not agree with the patterns derived from genetic markers ITS1 and 16S. The reasons for the differences between the different markers are discussed in several ways involving few possible historical scenarios, but also possible errors of laboratory methods. In this study, there was only little success in amplification and the most likely reason is the inhibitory effect of snail mucus on DNA amplification. Another problem that occurred when this work was to obtain the sequence of the parasite (fluke) instead Anisus gene using gastropod specific primers. In addition to genetic and related methodological part of this work is the third part concerning the evaluation of environmental factors periodic pools in the presence and absence of the species studied. The fourth part sis focused on the phylogenetical analyses of the european and american Aplexa linneages. Powered by TCPDF...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra ekologiecs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV