Polymorfismus heterodimerů TLR2/TLR1 a TLR2/TLR6 u inbredních linií myši domácí odvozených z přirozených populací

Abstract

Na rozdíl od klasických laboratorních inbredních linií myši domácí, které vykazují nepřirozenou genetickou variabilitu, linie odvozené z jedinců odchycených ve volné přírodě představují vhodný model pro evolučně imunologický výzkum. Toll-like receptory (TLRs) patří mezi první složky imunity, které přicházejí do kontaktu s patogeny. Ačkoliv TLRs detekují konzervativní molekuly patogenů, ukazuje se, že jsou poměrně variabilní a tato variabilita má vztah k různým chorobám. Ve své práci jsem popsala variabilitu Tlr1, 2 a 6 u 24 inbredních linií pocházejících ze dvou poddruhů myši domácí (Mus m. musculus a M. m. domesticus). Tyto TLRs vykazují mezi liniemi různou míru polymorfismu. V Tlr1 jsem našla polymorfismus rovnoměrně rozložený v rámci celé exodomény. Tlr6 je poměrně konzervativní (nižší počet záměn lokalizovaných daleko od vazebného místa, málo změn ve fyzikálně-chemických vlastnostech aminokyselin). U Tlr2 se naopak ve vazebném místě a kolem něj nachází několik nekonzervativních substitucí, přičemž oba poddruhy se v těchto místech vzájemně liší. Alely M. m. domesticus a M. m. musculus jsou, až na 2 výjimky (TLR1 PWD, TLR2 STAIL), jasně fylogeneticky odděleny. Linie i poddruhy se prokazatelně liší v produkci IL-1β, IL-12 a NO po stimulaci makrofágů ligandy TLR1, 2 a 6. Tento trend je však patrně výsledkem...

Contrary to the classical mouse inbred strains with unnatural genetic variability, wild-derived strains offer a more suitable model for evolutionary immunology. Toll-like receptors (TLRs) belong to initial detectors of invading pathogens. Although TLRs recognise conserved structures they were shown to be polymorphic. This polymorphism is associated with various diseases. In my thesis, I describe variability of Tlr1, 2 and 6 in 24 inbred strains derived from two subspecies of house mouse (Mus m. musculus and M. m. domesticus). These Tlrs exhibit different levels in variability among the strains. In Tlr1 the polymorphic sites are spread along the whole exodomain. Tlr6 is quite conserved (a lower amount of substitutions located far from the binding region and with minor modifications in the amino acid residue properties). Tlr2, on the contrary, contains some substitutions with substantial alternations of residue properties that are located within or nearby the binding region and the subspecies differ at these sites. All alleles of M. m. domesticus and M. m. musculus, except for Tlr1 PWD, Tlr2 STAIL, are phylogenetically separated. The strains and the subspecies vary in the production of IL-1β, IL-12 a NO after stimulation by TLR1, 2 and 6 ligands. This trend is, however, presumably influenced by the effect of...