Pátrání po pozůstatku plastidu v buňce Rhabdomonas sp.

Abstract

Kmen Euglenozoa je tvořen čtyřmi skupinami - Euglenoidea (krásnoočka), Kinetoplastea (bičivky), Symbiontida a Diplonemea. Fototrofní krásnoočka, která tvoří dobře podpořenou skupinu, se vyznačují přítomností zeleného plastidu vzniklého sekun- dární endosymbiózou se zelenou řasou příbuznou dnešnímu rodu Pyramimonas. Obecně přijímaná teorie pozdního nabytí plastidu (plastid-late hypothesis) tvrdí, že k této en- dosymbióze došlo po oddělení fototrofních krásnooček od zbytku skupiny Euglenozoa. Endosymbiotická událost je vždy spojena s tokem genů z endosymbionta do jádra hos- titele. I když dojde k úplné ztrátě endosymbionta lze předpokládat, že genom hostitele byl obohacen o geny endosymbiotického původu. Některé současné fylogenetické ana- lýzy odhalily v genomu trypanosom (Kinetoplastea: Trypanosomatida) geny potenciálně plastidového původu. Interpretují to tak, že plastid byl přítomen již u společného předka bičivek a krásnooček a následně došlo k jeho ztrátě u všech bičivek a některých krásno- oček, ke kterým patří i osmotrofní Rhabdomonas costata. Během analýzy transkriptomu R. costata bylo nalezeno 63 genů, u nichž je možné předpokládat, že pocházejí ze ze- lených (14 genů) nebo jiných (49 genů) řas. Při konstrukci fylogenetických stromů byl jeden gen s vysokou podporou sesterský zeleným a...

Phylum Euglenozoa contsists of four groups - Euglenoidea, Kinetoplastea, Symbiontida and Diplonemea. Phototrophic euglenids, which constitute a clade, possess green plastid acquired via secondary endosymbiosis from green alga related to recent genus Pyramimonas. According to generally accepted plastid-late hypothesis, the endo- symbiosis took place after split between phototrophic euglenids and all other euglenozo- ans. Endosymbiotic event is always associated with gene transfer from endosymbiont to nuclei of host. Even if the endosymbiont is completely lost we should be able to observe enrichment of the host genome with the genes derived from endosymbiont. Some recent phylogenetic analyses uncovered genes related to green algae in trypanosomas (Kineto- plastea: Trypanosomatida). Based on this observation, authors postulated a hypothesis that the plastid was present already in common ancestor of kinetoplastids and euglenids and was lost in kinetoplastids and some euglenids including osmotrophic Rhabdomonas costata. During analysis of transcriptome of R. costata we found 63 genes, which could originated from green (24 genes) or other (49 genes) algae. In phylogenetic trees only one was robustly related to green and four were robustly related to other algae. Since the number of genes related to...