Show simple item record

Studium kinetiky štěpení polyproteinu Gag z viru HIV-1 virovou proteinasou
dc.contributor.advisorIngr, Marek
dc.creatorKrištofičová, Ivica
dc.date.accessioned2017-05-15T18:36:35Z
dc.date.available2017-05-15T18:36:35Z
dc.date.issued2013
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/52868
dc.description.abstractPolyprotein Gag je prekurzorem strukturních proteinů viru HIV-1 nezbytných pro správné složení, pučení a zrání virové částice v průběhu životního cyklu viru HIV-1. Proces zrání do stádia infekčního virionu je závislý na štěpení polyproteinu Gag a GagPol virovou proteinasou na devíti přesně určených místech. Narušení tohoto štěpení je jedním z hlavních terapeutických cílů v léčbě nákazy HIV. Virus HIV-1 si však vytváří rezistenci k inhibitorům proteinasy vznikem mutací jak v proteinase samotné, tak v jejím substrátu. Štěpení Gagu HIV-1 proteinasou je proces s přesně daným pořadím a rychlostí jednotlivých kroků. Předchozí biochemické studie stanovily kinetické parametry těchto procesů s pomocí oligopeptidů reprezentujících přirozeně se vyskytující štěpicí místa. Tato práce popisuje štěpení samotného polyproteinu Gag, který je přirozeným substrátem HIV-1 proteinasy. Za tímto účelem byl rekombinantně připraven kompletní polyprotein Gag v bakteriálním expresním systému. Bylo provedeno jeho štěpení HIV-1 proteinasou a produkty tohoto štěpení byly analyzovány pomocí SDS-PAGE a Western blotu. Dále byla porovnána substrátová specifita proteinasy divokého typu a mutované varianty HIV-1 proteinasy vůči kompletnímu divokému typu Gag polyproteinu. Byly pozorovány podstatné rozdíly mezi rychlostmi jednotlivých kroků...cs_CZ
dc.description.abstractGag polyprotein is the precursor of HIV-1 structural proteins, required for correct assembly, budding and maturation of viral particle within HIV-1 life cycle. The process of maturation into an infectious virion is dependent on Gag and GagPol cleavage at nine predefined sites by HIV-1 proteinase. Its disruption is one of the main targets of HIV treatment. HIV-1, however, develops resistance to the proteinase inhibitors by creating mutations in both the proteinase and the substrate. The Gag processing by HIV-1 proteinase is a highly sequential process, that happens in specific order and rate. Previous biochemical studies determined the kinetic data of these processes using oligopeptides representing naturally occuring cleavage sites. This thesis describes the cleavage of the Gag polyprotein itself, which is the natural substrate of HIV-1 proteinase. For this purpose, the full-length Gag polyprotein was recombinantly prepared in bacterial expression system. The cleavage was carried out and its products were analyzed via SDS-PAGE and Western blotting. The substrate specificity of the wild-type and mutant HIV-1 proteinase with respect to the full-length wild-type Gag polyprotein was compared. Substantial differences were observed between the rates of individual steps of cleavage by the wild-type and mutant...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectHIVcs_CZ
dc.subjectGagcs_CZ
dc.subjectkinetikacs_CZ
dc.subjectproteinasacs_CZ
dc.subjectinhibitorcs_CZ
dc.subjectrezistence vůči léčivucs_CZ
dc.subjectHIVen_US
dc.subjectGagen_US
dc.subjectkineticsen_US
dc.subjectproteinaseen_US
dc.subjectinhibitoren_US
dc.subjectdrug resistanceen_US
dc.titleStudy of the cleavage kinetics of Gag polyprotein from HIV-1 virus by the viral proteinaseen_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2013
dcterms.dateAccepted2013-05-27
dc.description.departmentDepartment of Biochemistryen_US
dc.description.departmentKatedra biochemiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId117030
dc.title.translatedStudium kinetiky štěpení polyproteinu Gag z viru HIV-1 virovou proteinasoucs_CZ
dc.contributor.refereeMartínek, Václav
dc.identifier.aleph001604022
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiochemistryen_US
thesis.degree.disciplineBiochemiecs_CZ
thesis.degree.programBiochemiecs_CZ
thesis.degree.programBiochemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-discipline.enBiochemistryen_US
uk.degree-program.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-program.enBiochemistryen_US
thesis.grade.csVelmi dobřecs_CZ
thesis.grade.enVery gooden_US
uk.abstract.csPolyprotein Gag je prekurzorem strukturních proteinů viru HIV-1 nezbytných pro správné složení, pučení a zrání virové částice v průběhu životního cyklu viru HIV-1. Proces zrání do stádia infekčního virionu je závislý na štěpení polyproteinu Gag a GagPol virovou proteinasou na devíti přesně určených místech. Narušení tohoto štěpení je jedním z hlavních terapeutických cílů v léčbě nákazy HIV. Virus HIV-1 si však vytváří rezistenci k inhibitorům proteinasy vznikem mutací jak v proteinase samotné, tak v jejím substrátu. Štěpení Gagu HIV-1 proteinasou je proces s přesně daným pořadím a rychlostí jednotlivých kroků. Předchozí biochemické studie stanovily kinetické parametry těchto procesů s pomocí oligopeptidů reprezentujících přirozeně se vyskytující štěpicí místa. Tato práce popisuje štěpení samotného polyproteinu Gag, který je přirozeným substrátem HIV-1 proteinasy. Za tímto účelem byl rekombinantně připraven kompletní polyprotein Gag v bakteriálním expresním systému. Bylo provedeno jeho štěpení HIV-1 proteinasou a produkty tohoto štěpení byly analyzovány pomocí SDS-PAGE a Western blotu. Dále byla porovnána substrátová specifita proteinasy divokého typu a mutované varianty HIV-1 proteinasy vůči kompletnímu divokému typu Gag polyproteinu. Byly pozorovány podstatné rozdíly mezi rychlostmi jednotlivých kroků...cs_CZ
uk.abstract.enGag polyprotein is the precursor of HIV-1 structural proteins, required for correct assembly, budding and maturation of viral particle within HIV-1 life cycle. The process of maturation into an infectious virion is dependent on Gag and GagPol cleavage at nine predefined sites by HIV-1 proteinase. Its disruption is one of the main targets of HIV treatment. HIV-1, however, develops resistance to the proteinase inhibitors by creating mutations in both the proteinase and the substrate. The Gag processing by HIV-1 proteinase is a highly sequential process, that happens in specific order and rate. Previous biochemical studies determined the kinetic data of these processes using oligopeptides representing naturally occuring cleavage sites. This thesis describes the cleavage of the Gag polyprotein itself, which is the natural substrate of HIV-1 proteinase. For this purpose, the full-length Gag polyprotein was recombinantly prepared in bacterial expression system. The cleavage was carried out and its products were analyzed via SDS-PAGE and Western blotting. The substrate specificity of the wild-type and mutant HIV-1 proteinase with respect to the full-length wild-type Gag polyprotein was compared. Substantial differences were observed between the rates of individual steps of cleavage by the wild-type and mutant...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra biochemiecs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 3-5, 116 36 Praha; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV