α-N-Acetylgalactosaminidase as a tools in the synthesis of complex oligosaccharide immune stimulators

Abstract

1 Charles University in Prague Faculty of Science Department of Biochemistry α-N-Acetylgalactosaminidase as a tools in the synthesis of complex oligosaccharide immune stimulators Summary of Ph. D. Thesis Mgr. Hynek Mrázek Supervisor: Prof. RNDr. Karel Bezouška, Dsc. Prague 2011 2 Introduction Glycoproteins Glycoproteins consist of proteins to which carbohydrate are covalently linked. The distinction between proteoglycans and glycoproteins residues is in the level and types of carbohydrate modification. Carbohydrates are linked to the protein component through either O-glycosidic or N-glycosidic bonds. The N-glycosidic linkage is through the amide group of asparagine. The O- glycosidic linkage is to the hydroxyl of serine, threonine or hydroxylysine. The predominant carbohydrate attachment in glycoproteins of mammalian cells is via N-glycosidic linkage. The site of carbohydrate attachment to N- linked glycoproteins is found within a consensus sequence of amino acids, N-X- S(T), where X is any amino acid except proline. While the N-glycosylation is governed by the above rules, no exact rules were found for glycosylation of O- type. This process is the step-wise addition of the sugar residues directly onto the polypeptide chain. Biosynthesis of glycoproteins occurs via protein glycosylation (the addition of...

1 Univerzita Karlova Přírodovědecká Fakulta Katedra Biochemie Použití α-N-acetylgalaktosaminidasy jako nástroje vhodného pro syntézu komplexních oligosacharidových stimulátorů imunitního systému Autoreferát dizertační práce Mgr. Hynek Mrázek Školitel: Prof. RNDr. Karel Bezouška, Dsc. Praha 2011 2 Úvod Glykoproteiny jsou proteiny obsahující kovalentně vázané sacharidové struktury. Sacharidy můžou být připojeny k proteinovému řetězci dvojím způsobem: O-glykosidickou nebo N-glykosidickou vazbou. N-glykosidicky spojené sacharidy jsou vázany k aminokyselině asparaginu, zatím co O-glykosidicky vázané sacharidy jsou spojeny k aminokyselinám serinu nebo threoninu. V glykoproteinech vyšších obratlovců se převážně vyskytují N-glykosidicky vázané sacharidové struktury. V případě N-glykosylace je sacharidový řetězec přenesen na aminokyselinu asparagin, který se nachází v aminokyselinové sekvenci N-X-ST, kde X může být jakákoliv aminokyselina kromě prolinu. Zatímco syntéza N-glykoproteinů se řídí určitými pravidly, u syntézy O-glykoproteinů nebyla žádná taková pravidla pro zatím nalezena. Proteinové glykosylace, která je nejčastější posttranslační modifikací, se účastní velké množství enzymů a enzymových komplexů. Celý proces glykosylace probíhá v endoplazmatickém retikulu a Golgiho aparátu. Glykosidasy hydrolasy Podle...