Detection, distribution, diversity and phylogeny of the crayfish plague pathogen Aphanomyces astaci (Oomycetes)

Abstract

Moje dizertační práce se zabývá různými aspekty výzkumu původce račího moru, Aphanomyces astaci (Oomycetes). Račí mor hubí celé populace původních evropských raků a je tak jedním ze zásadních problémů ochrany těchto živočichů, ohrožených i řadou dalších faktorů. Infekce je přenášena invazními druhy raků pocházejícími ze Severní Ameriky, kteří jsou vůči onemocnění mnohem odolnější a jsou zřejmě původními hostiteli A. astaci. Těžiště této práce spočívá v šesti studiích, z nichž čtyři byly již publikovány a u dvou probíhá recenzní řízení pro publikaci. Pojítkem kapitol uvedených v mé dizertační práci není jen samotný původce račího moru, ale také využití, vývoj a ověřování spolehlivosti molekulárních metod detekce A. astaci a jeho různých genotypů. Jádro práce je rozděleno do dvou částí. První z nich obsahuje čtyři studie, ve kterých se zabývám rozšířením A. astaci v populacích severoamerických raků v České republice (kapitola 1) a v Maďarsku (kapitola 2) a také faktory, které rozšíření parazita ovlivňují. Poznání rezervoárů nákazy totiž může přispět ke zlepšení ochrany původních raků. V uvedených zemích se vyskytují ve volné přírodě dva druhy severoamerických raků, rak pruhovaný (Orconectes limosus) a rak signální (Pacifastacus leniusculus). První dvě kapitoly ukazují, že míra nákazy u populací...

My Ph.D. thesis deals with various aspects of research of the crayfish plague pathogen, Aphanomyces astaci (Oomycetes). Crayfish plague decimates whole populations of European crayfish; therefore, it is one of the main problems for conservation of these species endangered from other reasons as well. The infection is transmitted by invasive North American crayfish, which are much less susceptible to the disease and are apparently original hosts of A. astaci. The core of this thesis consists of six studies. Four of them have been already published, the remaining two are manuscripts under review. The main linking motive among the presented studies is not only the crayfish plague pathogen itself, but also the use, development and verification of the reliability of molecular detection methods of A. astaci and its genotypes. This core of the thesis is further divided into two parts. The first one contains four studies that deal with the distribution of A. astaci in North American crayfish populations in the Czech Republic (Chapter 1) and Hungary (Chapter 2), and factors influencing this distribution. Two North American crayfish species can be found in the wild in these countries, the spiny-cheek crayfish (Orconectes limosus) and the signal crayfish (Pacifastacus leniusculus). The first two chapters show...