Show simple item record

Paralelní implementace multireferenčních coupled cluster metod a výpočet na velkých systémech
dc.contributor.advisorPittner, Jiří
dc.creatorBrabec, Jiří
dc.date.accessioned2019-05-03T15:32:41Z
dc.date.available2019-05-03T15:32:41Z
dc.date.issued2012
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/45526
dc.description.abstractFirstly, we have developed a Tensor Contraction Engine-based implementation of the BW-MRCCSD approach. The scalability tests have been performed across thousand of cores. We have further developed a novel two-level parallel algorithm for Hilbert-space MRCC methods which uses the processor groups. In this approach, references are distributed among processor groups (reference-level parallelism) and tasks of each reference are distributed inside of a given processor group (task-level parallelism). We have shown that our implementation scales across 24000 cores. The usability of our code was demonstrated on larger systems (dodecane, polycarbenes and naphthyne isomers). Finally, we present novel universal state- selective (USS) corrections to the state-specific MRCC methods. The USS-corrected MRCC results were compared with the full configuration interaction (FCI) results.en_US
dc.description.abstractPráce je rozdělena do několika částí. Nejdříve jsme implementovali paralelní kód BW- MRCCSD metody, který je založený na automaticky generovaném jednoreferenčním CC kódu z Tensor Contraction Engine (TCE). Následně jsme navrhli nové schéma nezávislé dvouúrovňové paralelizace, na jejímž základě jsme implementovali BW-MRCCSD a Mk-MRCCSD metody. Nový algoritmus využívá tzv. procesorových skupin, které mohou vykonávat části úloh navzájem nezávisle. V první úrovni paralelizace je řešení pro jednotlivé reference rozděleno mezi procesorové skupiny (reference-level parallelism), v druhé úrovni jsou pak úlohy dané reference distribuovány mezi procesy v odpovídající procesorové skupině (task-level parallelism). Testy škálování byly provedeny až na 24000 jádrech pro beta-karoten. Další část je věnována paralelním MRCC výpočtům, kde je zároveň demostrována využitelnost nové implementace na větších a chemicky zajímavých systémech. Poslední část práce se zabývá nově navrženou universal state-selective (USS) korekcí ke stavově specifickým MRCC metodám, její implementací a aplikací. Vlastnosti této korekce jsou ukázány na několika příkladech disociačních křivek a porovnány s FCI.cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectparalelní multireferenční coupled cluster kvantová chemiecs_CZ
dc.subjectparallel multireference coupled cluster quantum chemistry large scaleen_US
dc.titleParallel Implementation of Multireference Coupled Clusters Methods and Calculations on Large Systemsen_US
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2012
dcterms.dateAccepted2012-08-31
dc.description.departmentDepartment of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
dc.description.departmentKatedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId92406
dc.title.translatedParalelní implementace multireferenčních coupled cluster metod a výpočet na velkých systémechcs_CZ
dc.contributor.refereeFišer, Jiří
dc.contributor.refereePitoňák, Michal
dc.identifier.aleph001605090
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.discipline-cs_CZ
thesis.degree.discipline-en_US
thesis.degree.programFyzikální chemiecs_CZ
thesis.degree.programPhysical Chemistryen_US
uk.thesis.typedizertační prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Physical and Macromolecular Chemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.cs-cs_CZ
uk.degree-discipline.en-en_US
uk.degree-program.csFyzikální chemiecs_CZ
uk.degree-program.enPhysical Chemistryen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.csPráce je rozdělena do několika částí. Nejdříve jsme implementovali paralelní kód BW- MRCCSD metody, který je založený na automaticky generovaném jednoreferenčním CC kódu z Tensor Contraction Engine (TCE). Následně jsme navrhli nové schéma nezávislé dvouúrovňové paralelizace, na jejímž základě jsme implementovali BW-MRCCSD a Mk-MRCCSD metody. Nový algoritmus využívá tzv. procesorových skupin, které mohou vykonávat části úloh navzájem nezávisle. V první úrovni paralelizace je řešení pro jednotlivé reference rozděleno mezi procesorové skupiny (reference-level parallelism), v druhé úrovni jsou pak úlohy dané reference distribuovány mezi procesy v odpovídající procesorové skupině (task-level parallelism). Testy škálování byly provedeny až na 24000 jádrech pro beta-karoten. Další část je věnována paralelním MRCC výpočtům, kde je zároveň demostrována využitelnost nové implementace na větších a chemicky zajímavých systémech. Poslední část práce se zabývá nově navrženou universal state-selective (USS) korekcí ke stavově specifickým MRCC metodám, její implementací a aplikací. Vlastnosti této korekce jsou ukázány na několika příkladech disociačních křivek a porovnány s FCI.cs_CZ
uk.abstract.enFirstly, we have developed a Tensor Contraction Engine-based implementation of the BW-MRCCSD approach. The scalability tests have been performed across thousand of cores. We have further developed a novel two-level parallel algorithm for Hilbert-space MRCC methods which uses the processor groups. In this approach, references are distributed among processor groups (reference-level parallelism) and tasks of each reference are distributed inside of a given processor group (task-level parallelism). We have shown that our implementation scales across 24000 cores. The usability of our code was demonstrated on larger systems (dodecane, polycarbenes and naphthyne isomers). Finally, we present novel universal state- selective (USS) corrections to the state-specific MRCC methods. The USS-corrected MRCC results were compared with the full configuration interaction (FCI) results.en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra fyzikální a makromol. chemiecs_CZ
thesis.grade.codeP
dc.identifier.lisID990016050900106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2025 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV