Show simple item record

Biogeography and specificity of Asterochloris photobionts
dc.contributor.advisorŠkaloud, Pavel
dc.creatorŘídká, Tereza
dc.date.accessioned2017-05-07T09:32:57Z
dc.date.available2017-05-07T09:32:57Z
dc.date.issued2012
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/43514
dc.description.abstractTato práce se zabývá diverzitou a biogeografií fotobiontů rodu Asterochloris. Jelikož dosud nebyla publikována žádná studie, která by se biogeografií symbiotických organismů zabývala, je předkládaná práce první, která se pokouší zachytit biogeografickou distribuci a endemismus symbiontů. Získáním 121 sekvencí z dalších míst, než jen z Evropy a Ameriky, se diverzita v rámci rodu výrazně zvýšila. Fylogenetická analýza založená na kombinaci ITS rDNA a aktin sekvencí fotobiontů vyizolovaných ze stélek lišejníků rodu Cladonia a Stereocaulon objevila 28 různě podpořených linií. Osm z nich bylo nově objeveno. Na základě statistického testování fylogenetického signálu možných ekologických faktorů, které mohou ovlivňovat rozšíření fotobiontů, jsem vybrala tři proměnné, které ovlivňují složení jednotlivých linií rodu Asterochloris, a to dva různé typy biogeografických ekoregionů a typ substrátu. Celková biogeografie rodu Asterochloris vykazuje převážně kosmopolitní rozšíření s velmi nízkou mírou endemismu. Nově získaná data ukazují, že omezený výskyt jakékoliv linie fotobiontů není způsoben historickými nebo biologickými faktory, ale je způsoben spíše specifickými klimatickými podmínkami a jinými prvky na habitatu.cs_CZ
dc.description.abstractThis diploma thesis has focused on the diversity and biogeography of Asterochloris photobionts. Since no study so far has been published on the biogeography of symbiotic microorganisms, the presented thesis is the first attemp to trace the biogeographic distribution and endemism of symbionts. By gathering 121 Asterochloris sequences obtained from lichen thalli sampled outside Europe and America, the diversity within the genus increased dramatically. The phylogenetic analysis based on the concatenated alignment of ITS rDNA and actin sequences obtained from Cladonia and Stereocaulon photobionts revealed 28 differently supported clades. Of them, eight lineages were newly discovered. Three environmental factors explaining the best the distribution pattern of Asterochloris photobionts were selected according to the statistical tests of the phylogenetic signal: two different types of biogeographical ecoregions and the substrate type. In general, the genus Asterochloris is distributed cosmopolitally, with a very low rate of endemism. Newly obtained data indicate that the restricted distribution of any photobiont clade is not caused by either historic or biological factors, but more likely by specific climatic or habitat preferences.en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectbiogeografiecs_CZ
dc.subjectřasacs_CZ
dc.subjectAsterochloriscs_CZ
dc.subjectfotobiontcs_CZ
dc.subjectsymbiósacs_CZ
dc.subjectekologiecs_CZ
dc.subjectfylogenetický signálcs_CZ
dc.subjectbiogeographyen_US
dc.subjectalgaeen_US
dc.subjectAsterochlorisen_US
dc.subjectphotobionten_US
dc.subjectsymbiosisen_US
dc.subjectecologyen_US
dc.subjectphylogenetic signalen_US
dc.titleBiogeografie a specifita fotobiontů rodu Asterochloriscs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2012
dcterms.dateAccepted2012-05-28
dc.description.departmentDepartment of Botanyen_US
dc.description.departmentKatedra botanikycs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId79118
dc.title.translatedBiogeography and specificity of Asterochloris photobiontsen_US
dc.contributor.refereeVondrák, Jan
dc.identifier.aleph001480091
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBotanyen_US
thesis.degree.disciplineBotanikacs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra botanikycs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Botanyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBotanikacs_CZ
uk.degree-discipline.enBotanyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVelmi dobřecs_CZ
thesis.grade.enVery gooden_US
uk.abstract.csTato práce se zabývá diverzitou a biogeografií fotobiontů rodu Asterochloris. Jelikož dosud nebyla publikována žádná studie, která by se biogeografií symbiotických organismů zabývala, je předkládaná práce první, která se pokouší zachytit biogeografickou distribuci a endemismus symbiontů. Získáním 121 sekvencí z dalších míst, než jen z Evropy a Ameriky, se diverzita v rámci rodu výrazně zvýšila. Fylogenetická analýza založená na kombinaci ITS rDNA a aktin sekvencí fotobiontů vyizolovaných ze stélek lišejníků rodu Cladonia a Stereocaulon objevila 28 různě podpořených linií. Osm z nich bylo nově objeveno. Na základě statistického testování fylogenetického signálu možných ekologických faktorů, které mohou ovlivňovat rozšíření fotobiontů, jsem vybrala tři proměnné, které ovlivňují složení jednotlivých linií rodu Asterochloris, a to dva různé typy biogeografických ekoregionů a typ substrátu. Celková biogeografie rodu Asterochloris vykazuje převážně kosmopolitní rozšíření s velmi nízkou mírou endemismu. Nově získaná data ukazují, že omezený výskyt jakékoliv linie fotobiontů není způsoben historickými nebo biologickými faktory, ale je způsoben spíše specifickými klimatickými podmínkami a jinými prvky na habitatu.cs_CZ
uk.abstract.enThis diploma thesis has focused on the diversity and biogeography of Asterochloris photobionts. Since no study so far has been published on the biogeography of symbiotic microorganisms, the presented thesis is the first attemp to trace the biogeographic distribution and endemism of symbionts. By gathering 121 Asterochloris sequences obtained from lichen thalli sampled outside Europe and America, the diversity within the genus increased dramatically. The phylogenetic analysis based on the concatenated alignment of ITS rDNA and actin sequences obtained from Cladonia and Stereocaulon photobionts revealed 28 differently supported clades. Of them, eight lineages were newly discovered. Three environmental factors explaining the best the distribution pattern of Asterochloris photobionts were selected according to the statistical tests of the phylogenetic signal: two different types of biogeographical ecoregions and the substrate type. In general, the genus Asterochloris is distributed cosmopolitally, with a very low rate of endemism. Newly obtained data indicate that the restricted distribution of any photobiont clade is not caused by either historic or biological factors, but more likely by specific climatic or habitat preferences.en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra botanikycs_CZ
dc.identifier.lisID990014800910106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2025 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV