Stanovení sekvenčních variací mtDNA v české populaci pro využití ve forenzní genetice.

Abstract

Ve forenzním výzkumu i praxi se běžně setkáváme s analýzou jaderné DNA. V některých případech je ovšem dostupná pouze DNA mitochondriální. MtDNA se nachází v buňkách člověka, na rozdíl od jaderné DNA, v průměru v 500 kopiích. Je dědičná pouze po maternální linii, takže se zachovává po generace nezměněná, až na specifické nekódující úseky, kde se často vyskytují mutace. Určení specifického haplotypu pomáhá kriminalistům k identifikaci neznámého vzorku, kde maternální příbuzní mohou poskytnout referenční vzorky pro porovnání. MtDNA je také oproti jaderné DNA velmi odolná vůči vnějším vlivům, čehož se ve forenzní genetice velmi často využívá v případech, kdy je zkoumaného materiálu velmi málo či je degradovaný. Abychom mohli s určitou pravděpodobností vyloučit nebo potvrdit shodu dvou vzorků nebo zařadit podezřelého či pohřešovaného do specifické populace, z které hledaná osoba pochází, potřebujeme dostatečně velké srovnání. Tím jsou pro nás právě populační databáze mitochondriální DNA, na kterých studujeme frekvence výskytu různých haplotypů v jednotlivých populacích. V této práci se zabývám historií DNA sekvenování v oblasti forenzního zkoumání, mitochondriální DNA analýzou a také srovnáním dat dostupných v populačních databázích ve světě i v České republice. Práci jsem dále doplnila analýzou dvou...

In forensic research and practice is used an analysis of nuclear DNA commonly. However, in some cases we can use only mitochondrial DNA. The mtDNA is maternally inherited and it is located in the each cell approximately in 500 copies. Barring mutation in special noncoding segments, the mtDNA sequence of siblings and all maternal relatives is identical. This unique haplotyp can be helpful in forensic cases, such as analyzing the remains of a missing person, where known maternal relatives can provide reference samples for direct comparison to the questioned mtDNA type. MtDNA is also very resistant to the external influences, so in the cases where the amount of extracted DNA is very small or degraded it is more likely that a DNA typing result can be obtained by typing mtDNA than by typing polymorphic markers found in nuclear DNA. If we want to have a certain probability to exclude or confirm the match of two samples, classify suspect or missing person into a population, we need some enough wide comparison by the population databases. Then we can study the frequencies of different haplotypes in particular population. The aim of this thesis is summery of history of DNA analysis, mtDNA sequencing and comparison of data available in published databases in the world and mainly in the Czech Republic. There is also...