Show simple item record

Účinky exprese dlouhé dvouvláknové RNA v savčích buňkách
dc.contributor.advisorSvoboda, Petr
dc.creatorNejepínská, Jana
dc.date.accessioned2019-05-03T20:30:45Z
dc.date.available2019-05-03T20:30:45Z
dc.date.issued2013
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/3610
dc.description.abstractDouble stranded RNA (dsRNA) is a foreign molecule that arises in the cell either as a by-product of viral replication or it is produced by the intramolecular or intermolecular pairing of complementary RNAs, often originating from repetitive sequences. In mammals, dsRNA can enter one of three pathways: the sequence-specific RNA silencing, the sequence-independent interferon (IFN) response, or editing by adenosine deaminases. The main focus of my PhD project was to comprehensively analyze the effects of the expressed dsRNA in mammals in the context of the whole organism. To follow this aim, we generated a construct expressing dsRNA in a form of an mRNA containing a long perfect hairpin structure. Transgenic mice ubiquitously expressing dsRNA were viable and, in contrast to the previous studies, the IFN response was not activated. In somatic cells, dsRNA was poorly processed into small interfering RNAs, did not cause transcriptional silencing in trans, and underwent low adenosine deamination without the nuclear retention. Consistent results were obtained in human cells transiently transfected with a dsRNA-expressing plasmid. On the other hand, dsRNA expression caused robust RNA interference (RNAi) in oocytes. Thus, we show for the first time that expressed dsRNA, in contrast to many other forms of...en_US
dc.description.abstractDvouvláknová RNA je cizorodá molekula, která se objevuje v buňce buď jako produkt replikace viru nebo vzniká párováním komplementárních RNA, a to v rámci jedné molekuly nebo mezi dvěma molekulami. Komplementární RNA často pocházejí z repetitivních sekvencí. U savců může dvouvláknová RNA vstupovat do jedné ze tří drah: sekvenčně specifického umlčování RNA (RNA silencing), sekvenčně nezávislé interferonové (IFN) odpovědi nebo editace pomocí adenosin deamináz. Hlavním zaměřením mého PhD projektu bylo detailně zanalyzovat efekty dvouvláknové RNA produkované v savčích buňkách, a to v rámci celého organismu. Za tímto účelem jsme vytvořili konstrukt exprimující dvouvláknovou RNA ve formě mRNA, obsahující dlouhou a perfektně párující vlásenkovitou strukturu. Transgenní myši, vytvářející dvouvláknovou RNA ve všech buňkách, byly životaschopné a, na rozdíl od výsledků dosavadních studií, neměly aktivovanou IFN odpověď. V somatických buňkách byla dvouvláknová RNA jen málo štěpena na krátké interferující RNA (siRNA), nezpůsobovala transkripční umlčování v trans a docházelo k mírné deaminaci adenosinu bez zadržování editované RNA v jádře. Shodné výsledky jsme získali v savčích buňkách, které byly tranzientně transfekovány plazmidem exprimujícím dvouvláknovou RNA. Naproti tomu ve vajíčcích způsobovala...cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleThe effects of long double-stranded RNA expression in mammalian cells.en_US
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2013
dcterms.dateAccepted2013-06-27
dc.description.departmentDepartment of Cell Biologyen_US
dc.description.departmentKatedra buněčné biologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId85315
dc.title.translatedÚčinky exprese dlouhé dvouvláknové RNA v savčích buňkáchcs_CZ
dc.contributor.refereePetr, Jaroslav
dc.contributor.refereeŠtefl, Richard
dc.identifier.aleph001632934
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.discipline-cs_CZ
thesis.degree.discipline-en_US
thesis.degree.programVývojová a buněčná biologiecs_CZ
thesis.degree.programDevelopmental and Cell Biologyen_US
uk.thesis.typedizertační prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra buněčné biologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Cell Biologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.cs-cs_CZ
uk.degree-discipline.en-en_US
uk.degree-program.csVývojová a buněčná biologiecs_CZ
uk.degree-program.enDevelopmental and Cell Biologyen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.csDvouvláknová RNA je cizorodá molekula, která se objevuje v buňce buď jako produkt replikace viru nebo vzniká párováním komplementárních RNA, a to v rámci jedné molekuly nebo mezi dvěma molekulami. Komplementární RNA často pocházejí z repetitivních sekvencí. U savců může dvouvláknová RNA vstupovat do jedné ze tří drah: sekvenčně specifického umlčování RNA (RNA silencing), sekvenčně nezávislé interferonové (IFN) odpovědi nebo editace pomocí adenosin deamináz. Hlavním zaměřením mého PhD projektu bylo detailně zanalyzovat efekty dvouvláknové RNA produkované v savčích buňkách, a to v rámci celého organismu. Za tímto účelem jsme vytvořili konstrukt exprimující dvouvláknovou RNA ve formě mRNA, obsahující dlouhou a perfektně párující vlásenkovitou strukturu. Transgenní myši, vytvářející dvouvláknovou RNA ve všech buňkách, byly životaschopné a, na rozdíl od výsledků dosavadních studií, neměly aktivovanou IFN odpověď. V somatických buňkách byla dvouvláknová RNA jen málo štěpena na krátké interferující RNA (siRNA), nezpůsobovala transkripční umlčování v trans a docházelo k mírné deaminaci adenosinu bez zadržování editované RNA v jádře. Shodné výsledky jsme získali v savčích buňkách, které byly tranzientně transfekovány plazmidem exprimujícím dvouvláknovou RNA. Naproti tomu ve vajíčcích způsobovala...cs_CZ
uk.abstract.enDouble stranded RNA (dsRNA) is a foreign molecule that arises in the cell either as a by-product of viral replication or it is produced by the intramolecular or intermolecular pairing of complementary RNAs, often originating from repetitive sequences. In mammals, dsRNA can enter one of three pathways: the sequence-specific RNA silencing, the sequence-independent interferon (IFN) response, or editing by adenosine deaminases. The main focus of my PhD project was to comprehensively analyze the effects of the expressed dsRNA in mammals in the context of the whole organism. To follow this aim, we generated a construct expressing dsRNA in a form of an mRNA containing a long perfect hairpin structure. Transgenic mice ubiquitously expressing dsRNA were viable and, in contrast to the previous studies, the IFN response was not activated. In somatic cells, dsRNA was poorly processed into small interfering RNAs, did not cause transcriptional silencing in trans, and underwent low adenosine deamination without the nuclear retention. Consistent results were obtained in human cells transiently transfected with a dsRNA-expressing plasmid. On the other hand, dsRNA expression caused robust RNA interference (RNAi) in oocytes. Thus, we show for the first time that expressed dsRNA, in contrast to many other forms of...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra buněčné biologiecs_CZ
thesis.grade.codeP
dc.identifier.lisID990016329340106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV