EF-Tu Protein Domains:Functions and Thermostability

Abstract

Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta Katedra genetiky a mikrobiologie Elongační faktor EF-Tu Funkce a termostabilita domén Disertační práce Hana Šanderová Specializace: Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie Školitel: Prof. MUDr. Jiří Jonák, DrSc. Oddělění genové exprese, Ústav molekulární genetiky AV ČR Praha 2008 Souhrn disertační práce Bakteriální elongační faktor Tu (EF-Tu) je již po desetiletí podrobně studován pro svou klíčovou roli v proteosyntéze. Je to modelová multifunkční GTP-bílkovina. Tato bílkovina je též v centru zájmu, protože představuje vhodný cíl pro nová antibiotika. Kromě toho jsou bílkoviny EF-Tu díky vysoké homologii ve struktuře a funkci vhodné pro studium evolučních vztahů mezi organismy a pro zkoumání strukturních vlastností, které podmiňují adaptační mechanismy k různým životním podmínkám. Všechny známé bílkoviny EF-Tu jsou složeny ze tří domén, a proto jsou vhodnými modelovými bílkovinami pro zkoumání architektury uspořádní domén v bílkovinách. Jedním z hlavních výzkumných projektů na Oddělení genové exprese v Ústavu molekulární genetiky AV ČR, kde jsem vypracovala svou disertační práci, bylo studium primární struktury, regulace transkripce a regulace funkcí bakteriálního elongačního faktoru Tu z Gram pozitivní termofilní bakterie Bacillus...

Charles University in Prague Faculty of Science Department of Genetics and Microbiology EF-Tu PROTEIN DOMAINS Functions and Thermostability PhD thesis Hana Šanderová Specialization: Molecular and Cellular Biology, Genetics and Virology Supervisor: Prof. MUDr. Jiří Jonák, DrSc. Department of Gene Expression, Institute of Molecular Genetics AS CR Prague 2008 Summary of PhD Thesis The bacterial elongation factor Tu (EF-Tu) has been extensively studied for decades as it plays a key role in protein biosynthesis. It is a model, multifunctional GTP-protein. This protein is also in the centre of interest as a possible target for new antibiotics. Moreover, the high homology in structure and function makes EF-Tu proteins suitable for the studies of evolutionary relationships between organisms and for elucidation of the structural features of adaptation to various living conditions. Furthermore, since all known EF-Tu proteins are composed of three distinct domains, they can also serve as suitable models for the understanding of domain organization in proteins. One of the main research projects of the Department of Gene Expression at the Institute of Molecular Genetics AS CR, where I did my PhD studies, was the study of the primary structure, transcription regulation and functions of bacterial elongation factors Tu...