Show simple item record

Genetic factors responsible for hereditary breast and ovarian cancer development Large rearrangements in BRCA1 and BRCA2 genes
dc.contributor.advisorPohlreich, Petr
dc.creatorTichá, Ivana
dc.date.accessioned2018-09-18T07:52:38Z
dc.date.available2018-09-18T07:52:38Z
dc.date.issued2010
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/34921
dc.description.abstractSouhrn Úvod: Vývoj dědičného karcinomu prsu/ovaria podmiňují zárodečné mutace řady genů. V této studii byly analyzovány rozsáhlé přestavby genů BRCA1/2 a dále jsme se zaměřili na úlohu genů CHEK2 a TP53 v tumorogenezi. Metody: U 586 vysoce rizikových pacientů s karcinomem prsu/ovaria, u kterých nebyly standardní analýzou prokázány mutace v genech BRCA1/2, byly přestavby analyzovány pomocí MLPA, long range PCR a sekvenování; dlouhé delece přesahující hranice genu byly lokalizovány pomocí oligonukleotidové aCGH specifické pro lidský chromosom 17. MLPA analýza byla rovněž použita k detekci dvou často se vyskytujících mutací genu CHEK2 (c.1100delC a delece 5395 bp). K analýze kódující oblasti genu TP53 bylo použito sekvenování. Výsledky: Detekovali jsme 9 různých přestaveb genu BRCA1 u 16 pacientů. Pět z nich (delece exonů 1-17, 5-10, 13-19, 18-22 a 21-24) nebylo dosud popsáno. Delece exonů 1-17, 5-14 a 21-22 byly detekovány opakovaně a představují populačně specifické (founder) mutace. Dlouhé delece a přestavby představovaly 12,1% (16/132) všech detekovaných patogenních mutací genu BRCA1. V genu BRCA2 žádná rozsáhlá přestavba nalezena nebyla. Výskyt patogenních mutací v dalších testovaných genech byl nižší; 2 mutace byly detekovány v genu TP53 a 9 v genu CHEK2. Závěr: Přestavby představují v naší populaci...cs_CZ
dc.description.abstract2. Summary Background: A greatly increased risk for development of hereditary breast cancer is associated with germline mutations in several susceptibility genes. In this study we analyzed large genomic rearrangements (LGRs) in BRCA1/2 genes and we also focused on the role of CHEK2 and TP53 in tumorigenesis. Methods: A series of 586 high risk patients with breast/ovarian cancer that had previously been tested negatively for small mutations in BRCA1/2 was screened for LGRs by MLPA, LR-PCR and sequencing. Chromosome 17-specific aCGH was used to locate deletion breakpoints in regions flanking the BRCA1 gene. MLPA-analysis was also used to detect two frequently occurring mutations in CHEK2 (c.1100delC and a deletion of 5395 bp). The coding region of the TP53 gene was analyzed by sequencing. Results: We identified 9 different LGRs in the BRCA1 gene in 16 patients. Five alterations (deletion of exons 1-17, 5-10, 13-19, 18-22 and 21-24) were novel. Deletions of exons 1-17, 5-14 and 21-22 were identified repeatedly, and represented population specific (founder) mutations. LGRs accounted for 12.1% (16/132) of all detected pathogenic BRCA1 mutations. No LGRs were found in the BRCA2 gene. Pathogenic mutations in other tested genes were less frequent; 2 were detected in TP53 and 9 in CHEK2. Conclusions: In our...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, 1. lékařská fakultacs_CZ
dc.titleGenetické faktory odpovědné za vývoj dědičného karcinomu prsu a ovaria Rozsáhlé přestavby v genech BRCA1 a BRCa2cs_CZ
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2010
dcterms.dateAccepted2010-12-08
dc.description.departmentInstitute of Biochemistry and Experimental Oncology First Faculty of Medicine Charles University inen_US
dc.description.departmentÚstav biochemie a experimentální onkologie 1. LF UK v Prazecs_CZ
dc.description.facultyFirst Faculty of Medicineen_US
dc.description.faculty1. lékařská fakultacs_CZ
dc.identifier.repId104652
dc.title.translatedGenetic factors responsible for hereditary breast and ovarian cancer development Large rearrangements in BRCA1 and BRCA2 genesen_US
dc.contributor.refereeSouček, Pavel
dc.contributor.refereeStiborová, Marie
dc.identifier.aleph001287966
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.discipline-cs_CZ
thesis.degree.discipline-en_US
thesis.degree.programBiochemistry and Pathobiochemistryen_US
thesis.degree.programBiochemie a patobiochemiecs_CZ
uk.thesis.typedizertační prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-cs1. lékařská fakulta::Ústav biochemie a experimentální onkologie 1. LF UK v Prazecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFirst Faculty of Medicine::Institute of Biochemistry and Experimental Oncology First Faculty of Medicine Charles University inen_US
uk.faculty-name.cs1. lékařská fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFirst Faculty of Medicineen_US
uk.faculty-abbr.cs1.LFcs_CZ
uk.degree-discipline.cs-cs_CZ
uk.degree-discipline.en-en_US
uk.degree-program.csBiochemie a patobiochemiecs_CZ
uk.degree-program.enBiochemistry and Pathobiochemistryen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.csSouhrn Úvod: Vývoj dědičného karcinomu prsu/ovaria podmiňují zárodečné mutace řady genů. V této studii byly analyzovány rozsáhlé přestavby genů BRCA1/2 a dále jsme se zaměřili na úlohu genů CHEK2 a TP53 v tumorogenezi. Metody: U 586 vysoce rizikových pacientů s karcinomem prsu/ovaria, u kterých nebyly standardní analýzou prokázány mutace v genech BRCA1/2, byly přestavby analyzovány pomocí MLPA, long range PCR a sekvenování; dlouhé delece přesahující hranice genu byly lokalizovány pomocí oligonukleotidové aCGH specifické pro lidský chromosom 17. MLPA analýza byla rovněž použita k detekci dvou často se vyskytujících mutací genu CHEK2 (c.1100delC a delece 5395 bp). K analýze kódující oblasti genu TP53 bylo použito sekvenování. Výsledky: Detekovali jsme 9 různých přestaveb genu BRCA1 u 16 pacientů. Pět z nich (delece exonů 1-17, 5-10, 13-19, 18-22 a 21-24) nebylo dosud popsáno. Delece exonů 1-17, 5-14 a 21-22 byly detekovány opakovaně a představují populačně specifické (founder) mutace. Dlouhé delece a přestavby představovaly 12,1% (16/132) všech detekovaných patogenních mutací genu BRCA1. V genu BRCA2 žádná rozsáhlá přestavba nalezena nebyla. Výskyt patogenních mutací v dalších testovaných genech byl nižší; 2 mutace byly detekovány v genu TP53 a 9 v genu CHEK2. Závěr: Přestavby představují v naší populaci...cs_CZ
uk.abstract.en2. Summary Background: A greatly increased risk for development of hereditary breast cancer is associated with germline mutations in several susceptibility genes. In this study we analyzed large genomic rearrangements (LGRs) in BRCA1/2 genes and we also focused on the role of CHEK2 and TP53 in tumorigenesis. Methods: A series of 586 high risk patients with breast/ovarian cancer that had previously been tested negatively for small mutations in BRCA1/2 was screened for LGRs by MLPA, LR-PCR and sequencing. Chromosome 17-specific aCGH was used to locate deletion breakpoints in regions flanking the BRCA1 gene. MLPA-analysis was also used to detect two frequently occurring mutations in CHEK2 (c.1100delC and a deletion of 5395 bp). The coding region of the TP53 gene was analyzed by sequencing. Results: We identified 9 different LGRs in the BRCA1 gene in 16 patients. Five alterations (deletion of exons 1-17, 5-10, 13-19, 18-22 and 21-24) were novel. Deletions of exons 1-17, 5-14 and 21-22 were identified repeatedly, and represented population specific (founder) mutations. LGRs accounted for 12.1% (16/132) of all detected pathogenic BRCA1 mutations. No LGRs were found in the BRCA2 gene. Pathogenic mutations in other tested genes were less frequent; 2 were detected in TP53 and 9 in CHEK2. Conclusions: In our...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, 1. lékařská fakulta, Ústav biochemie a experimentální onkologie 1. LF UK v Prazecs_CZ
thesis.grade.codeP


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV