Show simple item record

Proteomická analýza leukemických buněčných linií po ozáření
dc.contributor.advisorŘezáčová, Martina
dc.creatorŠalovská, Barbora
dc.date.accessioned2018-11-23T13:46:44Z
dc.date.available2018-11-23T13:46:44Z
dc.date.issued2017
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/33324
dc.description.abstract(ENG) Title of the dissertation: Proteomic analysis of gamma-irradiated human leukemic cells In the presented doctoral thesis, we aimed to elucidate molecular mechanisms underlying radiosensitization of MOLT-4 cell line (T-ALL) by specific inhibition of kinases from the phosphatidylinositol-3 kinase-related kinases (PIKKs) family. We tested two highly potent inhibitors of ATR and ATM, VE-821 and KU55933, respectively, for their effects on proliferation, viability, and cell cycle of sham-irradiated and irradiated MOLT-4 cells. Both inhibitors proved to radiosensitize MOLT-4 cells and furthermore, 10 µM VE-821 was shown to act as a strong antiproliferative agent in sham-irradiated MOLT-4 cells. To further describe cellular mechanisms underlying the VE-821-mediated radiosensitization of MOLT-4 cells, we employed high-resolution mass spectrometry to identify and quantify changes in proteome and phosphoproteome of irradiated VE-821-treated cells. As the detection and quantification of phosphorylated peptides in complex biological samples is challenging due to their low stoichiometry, we first compiled and optimized protocol for their enrichment. The protocol was then applied to study changes in radiosensitized MOLT-4 cells. In concordance with our expectations, VE-821 did not cause any significant...en_US
dc.description.abstract(CZE) Název dizertační práce: Proteomická analýza leukemických buněčných linií po ozáření V této dizertační práci jsme se zaměřili na objasnění molekulárních mechanismů radiosensibilizace leukemické buněčné linie MOLT-4 specifickou inhibicí kináz z rodiny fosfatidylinositol-3-kináza příbuzných kináz (PIKKs). Byly testovány dva vysoce účinné a selektivní inhibitory VE-821 (inhibitor ATR) a KU55933 (inhibitor ATM), pro jejich účinky na proliferaci, viabilitu a buněčný cyklus neozářených a ozářených buněk MOLT4. Aplikace obou inhibitorů způsobila radiosensibilizaci MOLT-4 buněk a 10 µM VE-821 navíc působil jako silné antiproliferativní agens i v neozářených MOLT-4 buňkách. K dalšímu popisu mechanismů, které jsou zodpovědné za radiosensibilizaci MOLT-4 buněk VE-821 inhibitorem byly použity hmotnostně spektrometrické metody. Pomocí metod kvantitativní proteomiky jsme identifikovali a kvantifikovali změny v proteomu a fosfoproteomu (tj. změny na úrovni fosforylace proteinů) buněk, které byly způsobeny účinkem inhibitoru v ozářených buňkách. Protože detekce a kvantifikace fosforylovaných peptidů v komplexních vzorcích je komplikována mimo jiné jejich relativně nízkým zastoupením, zaměřili jsme se nejprve na výběr optimální metody pro jejich selektivní izolaci ze směsi s nemodifikovanými peptidy....cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Lékařská fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.titleProteomic Analysis of Gamma-Irradiated Human Leukemic Cellsen_US
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2017
dcterms.dateAccepted2017-04-04
dc.description.departmentÚstav lékařské biochemiecs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Medical Biochemistryen_US
dc.description.facultyLékařská fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Medicine in Hradec Královéen_US
dc.identifier.repId106355
dc.title.translatedProteomická analýza leukemických buněčných linií po ozářenícs_CZ
dc.contributor.refereeŠebela, Marek
dc.contributor.refereeEbhardt, H. Alexander
dc.identifier.aleph002134118
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.discipline-cs_CZ
thesis.degree.discipline-en_US
thesis.degree.programLékařská chemie a biochemiecs_CZ
thesis.degree.programMedical Chemistry and Biochemistryen_US
uk.faculty-name.csLékařská fakulta v Hradci Královécs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Medicine in Hradec Královéen_US
uk.faculty-abbr.csLFHKcs_CZ
uk.degree-discipline.cs-cs_CZ
uk.degree-discipline.en-en_US
uk.degree-program.csLékařská chemie a biochemiecs_CZ
uk.degree-program.enMedical Chemistry and Biochemistryen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.cs(CZE) Název dizertační práce: Proteomická analýza leukemických buněčných linií po ozáření V této dizertační práci jsme se zaměřili na objasnění molekulárních mechanismů radiosensibilizace leukemické buněčné linie MOLT-4 specifickou inhibicí kináz z rodiny fosfatidylinositol-3-kináza příbuzných kináz (PIKKs). Byly testovány dva vysoce účinné a selektivní inhibitory VE-821 (inhibitor ATR) a KU55933 (inhibitor ATM), pro jejich účinky na proliferaci, viabilitu a buněčný cyklus neozářených a ozářených buněk MOLT4. Aplikace obou inhibitorů způsobila radiosensibilizaci MOLT-4 buněk a 10 µM VE-821 navíc působil jako silné antiproliferativní agens i v neozářených MOLT-4 buňkách. K dalšímu popisu mechanismů, které jsou zodpovědné za radiosensibilizaci MOLT-4 buněk VE-821 inhibitorem byly použity hmotnostně spektrometrické metody. Pomocí metod kvantitativní proteomiky jsme identifikovali a kvantifikovali změny v proteomu a fosfoproteomu (tj. změny na úrovni fosforylace proteinů) buněk, které byly způsobeny účinkem inhibitoru v ozářených buňkách. Protože detekce a kvantifikace fosforylovaných peptidů v komplexních vzorcích je komplikována mimo jiné jejich relativně nízkým zastoupením, zaměřili jsme se nejprve na výběr optimální metody pro jejich selektivní izolaci ze směsi s nemodifikovanými peptidy....cs_CZ
uk.abstract.en(ENG) Title of the dissertation: Proteomic analysis of gamma-irradiated human leukemic cells In the presented doctoral thesis, we aimed to elucidate molecular mechanisms underlying radiosensitization of MOLT-4 cell line (T-ALL) by specific inhibition of kinases from the phosphatidylinositol-3 kinase-related kinases (PIKKs) family. We tested two highly potent inhibitors of ATR and ATM, VE-821 and KU55933, respectively, for their effects on proliferation, viability, and cell cycle of sham-irradiated and irradiated MOLT-4 cells. Both inhibitors proved to radiosensitize MOLT-4 cells and furthermore, 10 µM VE-821 was shown to act as a strong antiproliferative agent in sham-irradiated MOLT-4 cells. To further describe cellular mechanisms underlying the VE-821-mediated radiosensitization of MOLT-4 cells, we employed high-resolution mass spectrometry to identify and quantify changes in proteome and phosphoproteome of irradiated VE-821-treated cells. As the detection and quantification of phosphorylated peptides in complex biological samples is challenging due to their low stoichiometry, we first compiled and optimized protocol for their enrichment. The protocol was then applied to study changes in radiosensitized MOLT-4 cells. In concordance with our expectations, VE-821 did not cause any significant...en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication-placeHradec Královécs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Lékařská fakulta v Hradci Králové, Ústav lékařské biochemiecs_CZ
thesis.grade.codeP


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 3-5, 116 36 Praha; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV