Show simple item record

Studium membránových transportních proteinů z rodiny Nramp/MntH a jejich funkce pomocí biofyzikálních metod
dc.contributor.advisorChaloupka, Roman
dc.creatorŇuňuková, Věra
dc.date.accessioned2021-03-23T21:16:51Z
dc.date.available2021-03-23T21:16:51Z
dc.date.issued2010
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/31602
dc.description.abstractSyntetické peptidy odpovídající svojí sekvencí transmembránovým segmentům TMS1, TMS3 a TMS6 sekundárně aktivního transportního proteinu MntH z bakterie Escherichia coli byly použity jako model pro studium struktury, interakce s modelovými membránami, vzájemné interakce TM segmentů a jejich funkce. Sekundární struktura byla pomocí spektroskopie cirkulárního dichroismu určována v různých prostředích. Studované peptidy interagovaly s lipidovou membránou a získávaly v tomto prostředí helikální konformaci. Elektrofyziologické experimenty dokázaly, že samostatné TMS jsou schopny za určitých podmínek tvořit iontové kanály v modelových biologických membránách. Elektrofyziologické vlastnosti těchto slabě kationtově selektivních kanálů jsou silně závislé na pH okolního prostředí. Mangan, jako fyziologický substrát MntH, zvýšil vodivost kanálů tvořených TMS1 a TMS6 a ovlivnil přechod mezi zavřeným a otevřeným stavem kanálu. Byl pozorován vliv manganu na konformaci všech studovaných peptidů. V případě TMS3 byla přítomnost Mn2+ pro tvorbu iontových kanálů dokonce nezbytná. Bylo dokázáno, že kanál tvořený funkčně důležitým TMS může do určité míry zachovat funkční vlastnosti celého proteinu. Tyto výsledky mohou přispět k porozumění vztahu mezi strukturou a funkcí na molekulární úrovni. I přesto však zůstává nejasné, do...cs_CZ
dc.description.abstractThree synthetic peptides corresponding to transmembrane segments TMS1, TMS3 and TMS6 of secondary-active transporter MntH from Escherichia coli were used as a suitable alternative model enabling to study TMS structure, TMS interaction with membranes, TMS mutual interaction and also function of MntH. The secondary structure of the peptides was estimated in different environments using circular dichroism spectroscopy. These peptides interacted with and adopted helical conformation in lipid membranes. Electrophysiological experiments demonstrated that individual TMS were able under certain conditions to form ion channels in model biological membranes. Electrophysiological properties of these weakly cation-selective ion channels were strongly dependent on surrounding pH. Manganese ion, as a physiological substrate of MntH, enhanced the conductivity of TMS1 and TMS6 channels, influenced the transition between closed and open states and affected the conformation of all studied peptides. For TMS3 Mn2+ was crucial for formation of ion channels. It was shown that a single functionally important TMS can retain some of the functional properties of the full-length protein. These findings can contribute to understanding of structure-function relationship at the molecular level. However, it remains unclear to what extent...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.titleBiophysical studies of membrane transport proteins from Nramp/MntH family and their functionen_US
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2010
dcterms.dateAccepted2010-09-21
dc.description.departmentInstitute of Physics of Charles Universityen_US
dc.description.departmentFyzikální ústav UKcs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Mathematics and Physicsen_US
dc.description.facultyMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.identifier.repId44243
dc.title.translatedStudium membránových transportních proteinů z rodiny Nramp/MntH a jejich funkce pomocí biofyzikálních metodcs_CZ
dc.contributor.refereeKrůšek, Jan
dc.contributor.refereeKubala, Martin
dc.identifier.aleph001386476
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiophysics, Chemical and Macromolecular Physicsen_US
thesis.degree.disciplineBiofyzika, chemická a makromolekulární fyzikacs_CZ
thesis.degree.programPhysicsen_US
thesis.degree.programFyzikacs_CZ
uk.thesis.typedizertační prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csMatematicko-fyzikální fakulta::Fyzikální ústav UKcs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Mathematics and Physics::Institute of Physics of Charles Universityen_US
uk.faculty-name.csMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Mathematics and Physicsen_US
uk.faculty-abbr.csMFFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiofyzika, chemická a makromolekulární fyzikacs_CZ
uk.degree-discipline.enBiophysics, Chemical and Macromolecular Physicsen_US
uk.degree-program.csFyzikacs_CZ
uk.degree-program.enPhysicsen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.csSyntetické peptidy odpovídající svojí sekvencí transmembránovým segmentům TMS1, TMS3 a TMS6 sekundárně aktivního transportního proteinu MntH z bakterie Escherichia coli byly použity jako model pro studium struktury, interakce s modelovými membránami, vzájemné interakce TM segmentů a jejich funkce. Sekundární struktura byla pomocí spektroskopie cirkulárního dichroismu určována v různých prostředích. Studované peptidy interagovaly s lipidovou membránou a získávaly v tomto prostředí helikální konformaci. Elektrofyziologické experimenty dokázaly, že samostatné TMS jsou schopny za určitých podmínek tvořit iontové kanály v modelových biologických membránách. Elektrofyziologické vlastnosti těchto slabě kationtově selektivních kanálů jsou silně závislé na pH okolního prostředí. Mangan, jako fyziologický substrát MntH, zvýšil vodivost kanálů tvořených TMS1 a TMS6 a ovlivnil přechod mezi zavřeným a otevřeným stavem kanálu. Byl pozorován vliv manganu na konformaci všech studovaných peptidů. V případě TMS3 byla přítomnost Mn2+ pro tvorbu iontových kanálů dokonce nezbytná. Bylo dokázáno, že kanál tvořený funkčně důležitým TMS může do určité míry zachovat funkční vlastnosti celého proteinu. Tyto výsledky mohou přispět k porozumění vztahu mezi strukturou a funkcí na molekulární úrovni. I přesto však zůstává nejasné, do...cs_CZ
uk.abstract.enThree synthetic peptides corresponding to transmembrane segments TMS1, TMS3 and TMS6 of secondary-active transporter MntH from Escherichia coli were used as a suitable alternative model enabling to study TMS structure, TMS interaction with membranes, TMS mutual interaction and also function of MntH. The secondary structure of the peptides was estimated in different environments using circular dichroism spectroscopy. These peptides interacted with and adopted helical conformation in lipid membranes. Electrophysiological experiments demonstrated that individual TMS were able under certain conditions to form ion channels in model biological membranes. Electrophysiological properties of these weakly cation-selective ion channels were strongly dependent on surrounding pH. Manganese ion, as a physiological substrate of MntH, enhanced the conductivity of TMS1 and TMS6 channels, influenced the transition between closed and open states and affected the conformation of all studied peptides. For TMS3 Mn2+ was crucial for formation of ion channels. It was shown that a single functionally important TMS can retain some of the functional properties of the full-length protein. These findings can contribute to understanding of structure-function relationship at the molecular level. However, it remains unclear to what extent...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakulta, Fyzikální ústav UKcs_CZ
thesis.grade.codeP
dc.contributor.consultantUrbánková, Eva
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO
dc.identifier.lisID990013864760106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV