Show simple item record

The role of conserved residues in the S4/S4-S5 region of vanilloid TRP channels
dc.contributor.advisorVlachová, Viktorie
dc.creatorBoukalová, Štěpána
dc.date.accessioned2021-03-25T08:31:56Z
dc.date.available2021-03-25T08:31:56Z
dc.date.issued2010
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/30567
dc.description.abstractThe vanilloid transient receptor potential channel TRPV1 is a tetrameric six-transmembrane segment (S1-S6) channel that can be synergistically activated by various proalgesic agents such as capsaicin, protons, heat or highly depolarizing voltages. In TRPV1 channel, the charged residues in the S4 region and intracellular S4-S5 linker have been proposed to constitute a part of a voltage sensor that acts in concert with other stimuli to regulate channel activation. Molecular basis of this gating event are poorly understood. We mutated charged residues all along the S4 and the S4-S5 linker of TRPV1 and related vanilloid receptors to identify potential voltage-sensing residues. The functionality of most of the TRPV1 mutants was altered with respect to voltage, capsaicin, heat and/or their interactions. We identified two amino acid residues (R557 and D576) that could potentially constitute part of TRPV1 voltage sensor. The non-functional charge-reversing mutations R557E and R579E were partially rescued by charge-swapping mutations R557E/E570R and D576R/R579E, indicating that electrostatic interactions contribute to allosteric coupling between the voltage-, temperature- and capsaicin-dependent activation mechanisms. The mutant K571E was normal in all aspects of TRPV1 activation except for 2aminoethoxydiphenyl...en_US
dc.description.abstractTRPV1 receptor, iontový kanál z podrodiny vaniloidních TRP receptorů, je tetramerní proteinový komplex, jehož každá podjednotka obsahuje šest transmembránových segmentů S1-S6. Tento receptor je aktivován řadou podnětů schopných vyvolat bolest, jako jsou kapsaicin, protony, zvýšená teplota okolního prostředí a depolarizační napětí. Mechanizmus napěťové citlivosti TRPV1 receptoru není doposud znám. Předpokládá se, že součást napěťového senzoru tvoří nabité aminokyselinové zbytky v S4 transmembránovém segmentu a v S4-S5 spojovací kličce. Abychom určili, která rezidua se podílejí na napěťové citlivosti TRPV1 receptoru a příbuzných vaniloidních receptorů, vytvořili jsme mutantní formy těchto iontových kanálů se zaměněnými konzervovanými aminokyselinovými zbytky v S4/S4-S5 oblasti. Velká část námi vytvořených mutantních TRPV1 receptorů byla poškozena vzhledem k napěťové, chemické a/nebo teplotní aktivaci. Lokalizovali jsme dvě rezidua (R557 a D576), která by potenciálně mohla tvořit součást napěťového senzoru TRPV1. Prokázali jsme funkční interakci dvojic reziduí R557-E570 a D576-R579 u TRPV1 receptoru. Určili jsme aminokyselinový zbytek (K571), který specificky podmiňuje citlivost TRPV1 k 2aminoetoxydifenylborátu (2APB), společnému aktivátoru TRPV1, TRPV2 a TRPV3 iontových kanálů. I přes vysokou konzervovanost...cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleÚloha konzervovaných aminokyselinových zbytků v S4/S4-S5 oblasti vaniloidních TRP receptorůcs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2010
dcterms.dateAccepted2010-05-31
dc.description.departmentDepartment of Physiologyen_US
dc.description.departmentKatedra fyziologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId64766
dc.title.translatedThe role of conserved residues in the S4/S4-S5 region of vanilloid TRP channelsen_US
dc.contributor.refereeDoležal, Vladimír
dc.identifier.aleph001292503
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineFyziologie živočichůcs_CZ
thesis.degree.disciplineAnimal Physiologyen_US
thesis.degree.programBiologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra fyziologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Physiologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csFyziologie živočichůcs_CZ
uk.degree-discipline.enAnimal Physiologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csTRPV1 receptor, iontový kanál z podrodiny vaniloidních TRP receptorů, je tetramerní proteinový komplex, jehož každá podjednotka obsahuje šest transmembránových segmentů S1-S6. Tento receptor je aktivován řadou podnětů schopných vyvolat bolest, jako jsou kapsaicin, protony, zvýšená teplota okolního prostředí a depolarizační napětí. Mechanizmus napěťové citlivosti TRPV1 receptoru není doposud znám. Předpokládá se, že součást napěťového senzoru tvoří nabité aminokyselinové zbytky v S4 transmembránovém segmentu a v S4-S5 spojovací kličce. Abychom určili, která rezidua se podílejí na napěťové citlivosti TRPV1 receptoru a příbuzných vaniloidních receptorů, vytvořili jsme mutantní formy těchto iontových kanálů se zaměněnými konzervovanými aminokyselinovými zbytky v S4/S4-S5 oblasti. Velká část námi vytvořených mutantních TRPV1 receptorů byla poškozena vzhledem k napěťové, chemické a/nebo teplotní aktivaci. Lokalizovali jsme dvě rezidua (R557 a D576), která by potenciálně mohla tvořit součást napěťového senzoru TRPV1. Prokázali jsme funkční interakci dvojic reziduí R557-E570 a D576-R579 u TRPV1 receptoru. Určili jsme aminokyselinový zbytek (K571), který specificky podmiňuje citlivost TRPV1 k 2aminoetoxydifenylborátu (2APB), společnému aktivátoru TRPV1, TRPV2 a TRPV3 iontových kanálů. I přes vysokou konzervovanost...cs_CZ
uk.abstract.enThe vanilloid transient receptor potential channel TRPV1 is a tetrameric six-transmembrane segment (S1-S6) channel that can be synergistically activated by various proalgesic agents such as capsaicin, protons, heat or highly depolarizing voltages. In TRPV1 channel, the charged residues in the S4 region and intracellular S4-S5 linker have been proposed to constitute a part of a voltage sensor that acts in concert with other stimuli to regulate channel activation. Molecular basis of this gating event are poorly understood. We mutated charged residues all along the S4 and the S4-S5 linker of TRPV1 and related vanilloid receptors to identify potential voltage-sensing residues. The functionality of most of the TRPV1 mutants was altered with respect to voltage, capsaicin, heat and/or their interactions. We identified two amino acid residues (R557 and D576) that could potentially constitute part of TRPV1 voltage sensor. The non-functional charge-reversing mutations R557E and R579E were partially rescued by charge-swapping mutations R557E/E570R and D576R/R579E, indicating that electrostatic interactions contribute to allosteric coupling between the voltage-, temperature- and capsaicin-dependent activation mechanisms. The mutant K571E was normal in all aspects of TRPV1 activation except for 2aminoethoxydiphenyl...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra fyziologiecs_CZ
thesis.grade.code1
dc.contributor.consultantNovotný, Jiří
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO
dc.identifier.lisID990012925030106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV