Show simple item record

Mitochondrial DNA diversity in populations of sub-Saharan Africa - role of language and geographic patterns
dc.contributor.advisorČerný, Viktor
dc.creatorMusilová, Eliška
dc.date.accessioned2017-04-20T10:55:13Z
dc.date.available2017-04-20T10:55:13Z
dc.date.issued2009
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/26181
dc.description.abstractZa účelem popsání vztahů mezi genetickou, jazykovou a geografickou diverzitou v Africe byl v rámci diplomové práce sekvenován HVSI segment mitochondriálního genomu u 81 jedinců ze dvou západoafrických populací odlišných jazykových rodin. Získané sekvence byly porovnávány s obdobnými daty publikovanými jinými autory. Interpopulační analýza zahrnovala celkem 4550 sekvencí HVSI segmentu mtDNA 101 populačních celků reprezentujících hlavní geografické regiony a jazykové skupiny Afriky. AMOVA dokládá, že variabilita mtDNA mezi jednotlivými skupinami je vyšší, pokud jsou populace tříděny na základě jednotlivých regionů (9,85 %; p < 0,001) než podle jejich jazykové příslušnosti (4,09 %; p< 0,001). Také graf MDS založený na hodnotách FST odhaluje korelaci mezi genetickou a geografickou nikoli však jazykovou vzdáleností zkoumaných populací. Úloha jazykových faktorů nevzrůstá, ani pokud jsou odstraněny skupiny vnášející do analýzy největší podíl heterogenity (nigerokonžská a khoisanská jazyková rodina). Výsledky naznačují, že komplikované vztahy mezi jazykovou a genetickou diferenciací jednotlivých populací mohly být v minulosti ovlivněny jednostrannou výměnou partnerů a jazykovými výpujčkami mezi expandujícími bantuskými zemědělci a místními lovecko-sběračskými skupinami během uplynulých 3000 let. Jisté stopy...cs_CZ
dc.description.abstractTo investigate relationships between genetic, linguistic, and geographic variation in Africa, we sequenced HVSI segment of mtDNA genome in 81 individuals of two West African populations from different linguistic families. These sequences were compared to similar data published by other authors. The interpopulation analysis included 4550 mtDNA HVSI sequences of 101 populations in total representing main African geographic and linguistic diversity. AMOVA indicates that the mtDNA among-group variation is higher when populations are grouped by geography (9,85 %; p < 0,001) than by linguistics (4,09 %; p < 0,001). Also MDS plotting based on FST data reveal a correlation between genetic and geographic distances and hardly any correlation between genetic and linguistic distances. The linguistic relation does not strenghten even if the most heterogenous language families (Niger-Congo, Khoisan) were removed from the analysis. These data suggest that complex patterns of diferentiation and gene flow in sub-Saharan Africa were influenced mainly by the admixture and language borrowing between expanding Bantu agriculturists and local hunter-gatherers in the last 3000 years, but the descent of some recent populational-genetic events can be traced in other parts of Africa. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleDiverzita mitochondriální DNA subsaharských populací - úloha jazykových a geografických faktorůcs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2009
dcterms.dateAccepted2009-09-14
dc.description.departmentDepartment of Anthropology and Human Geneticsen_US
dc.description.departmentKatedra antropologie a genetiky člověkacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId52639
dc.title.translatedMitochondrial DNA diversity in populations of sub-Saharan Africa - role of language and geographic patternsen_US
dc.contributor.refereeBrdička, Radim
dc.identifier.aleph001230330
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineAntropologie a genetika člověkacs_CZ
thesis.degree.disciplineAnthropology and Human Geneticsen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra antropologie a genetiky člověkacs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Anthropology and Human Geneticsen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csAntropologie a genetika člověkacs_CZ
uk.degree-discipline.enAnthropology and Human Geneticsen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csZa účelem popsání vztahů mezi genetickou, jazykovou a geografickou diverzitou v Africe byl v rámci diplomové práce sekvenován HVSI segment mitochondriálního genomu u 81 jedinců ze dvou západoafrických populací odlišných jazykových rodin. Získané sekvence byly porovnávány s obdobnými daty publikovanými jinými autory. Interpopulační analýza zahrnovala celkem 4550 sekvencí HVSI segmentu mtDNA 101 populačních celků reprezentujících hlavní geografické regiony a jazykové skupiny Afriky. AMOVA dokládá, že variabilita mtDNA mezi jednotlivými skupinami je vyšší, pokud jsou populace tříděny na základě jednotlivých regionů (9,85 %; p < 0,001) než podle jejich jazykové příslušnosti (4,09 %; p< 0,001). Také graf MDS založený na hodnotách FST odhaluje korelaci mezi genetickou a geografickou nikoli však jazykovou vzdáleností zkoumaných populací. Úloha jazykových faktorů nevzrůstá, ani pokud jsou odstraněny skupiny vnášející do analýzy největší podíl heterogenity (nigerokonžská a khoisanská jazyková rodina). Výsledky naznačují, že komplikované vztahy mezi jazykovou a genetickou diferenciací jednotlivých populací mohly být v minulosti ovlivněny jednostrannou výměnou partnerů a jazykovými výpujčkami mezi expandujícími bantuskými zemědělci a místními lovecko-sběračskými skupinami během uplynulých 3000 let. Jisté stopy...cs_CZ
uk.abstract.enTo investigate relationships between genetic, linguistic, and geographic variation in Africa, we sequenced HVSI segment of mtDNA genome in 81 individuals of two West African populations from different linguistic families. These sequences were compared to similar data published by other authors. The interpopulation analysis included 4550 mtDNA HVSI sequences of 101 populations in total representing main African geographic and linguistic diversity. AMOVA indicates that the mtDNA among-group variation is higher when populations are grouped by geography (9,85 %; p < 0,001) than by linguistics (4,09 %; p < 0,001). Also MDS plotting based on FST data reveal a correlation between genetic and geographic distances and hardly any correlation between genetic and linguistic distances. The linguistic relation does not strenghten even if the most heterogenous language families (Niger-Congo, Khoisan) were removed from the analysis. These data suggest that complex patterns of diferentiation and gene flow in sub-Saharan Africa were influenced mainly by the admixture and language borrowing between expanding Bantu agriculturists and local hunter-gatherers in the last 3000 years, but the descent of some recent populational-genetic events can be traced in other parts of Africa. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)en_US
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra antropologie a genetiky člověkacs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV