Show simple item record

Optimalization of some parameters DNA isolation from ancient skeletal remains
dc.creatorEliášová, Irena
dc.date.accessioned2021-05-19T15:21:10Z
dc.date.available2021-05-19T15:21:10Z
dc.date.issued2009
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/25597
dc.description.abstractDNA analysis from skeletal materials is significant supplement of the anthropological methods nowadays, especially in cases, where is not possible to obtain required information pursuant to anthropological characteristics of skeletal remains. Many studies dealing with DNA extraction from ancient and recent bones concurred in fact that the most difficult phase in DNA analysis of skeletal materials is its initial manipulation and selection of suitable procedure for DNA isolation. For this thesis, four different isolating techniques (phenol- chloroform extraction, procedure based on silica adsorption - QIAamp DNA Mini kit a DNA IQ System, extraction with Dextran Blue adsorption) were chosen and their parameters were optimized for maximal DNA yield. At comparing the quantification of selected isolating methods performed on recent skeletal materials, the phenol-chloroform extraction resulted as acceptable. This protocol enhanced by PTB (N-phenylacylthiazolum bromide) reagent was used on the skeletal set of eleven specimens from settlement Kněževes near Prague. Further, sex assessment was carried out by the part of amelogenin gene amplification and genetic profiles determined by STR (Short Tandem Repeat) analysis. Probable relationships were estimated on the basic of comparison of genetic profiles among...en_US
dc.description.abstractAnalýza DNA z kosterního materiálu je dnes významným doplňkem antropologických metod, především v případech, kde podle antropologických znaků kosterních ostatků není možné získat požadovanou informaci. Problematikou získávání DNA ze starých a recentních pozůstatků se zabývá mnoho studií a shodují se v tom, že nejobtížnější fází v DNA analýze kosterních materiálu je jeho počáteční zpracování a výběr vhodného postupu pro izolaci DNA. Z tohoto důvodu byly pro tuto práci vybrány čtyři různé izolační postupy (fenol- chloroformová extrakce, metoda založená na adsorpci na silikát - QIAamp DNA Mini kit a DNA IQ System, extrakce s adsorpcí na Dextran Blue), jejichž některé parametry byly optimalizovány pro co největší výtěžnost DNA. Srovnáním kvantifikace vybraných izolačních metod provedené na recentním kosterním materiálu vyšla nejlépe fenol-chloroformová extrakce. Její protokol byl ještě obohacen o činidlo PTB (N-phenylacylthiazolum bromide) a použit na kosterní soubor jedenácti jedinců z pohřebiště Kněževes u Prahy. Dále bylo determinováno pohlaví, amplifikací části genu pro amelogenin, a určeny genetické profily jedinců pomocí STR (Short Tandem Repeat) analýzy. Porovnáním genetických profilů byly detekovány pravděpodobné příbuzenské vztahy mezi jedinci. U tří individuí patřících do skupiny infant...cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleOptimalizace některých parametrů izolace DNA z historického kosterního materiálucs_CZ
dc.typerigorózní prácecs_CZ
dcterms.created2009
dcterms.dateAccepted2009-10-05
dc.description.departmentDepartment of Anthropology and Human Geneticsen_US
dc.description.departmentKatedra antropologie a genetiky člověkacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId98122
dc.title.translatedOptimalization of some parameters DNA isolation from ancient skeletal remainsen_US
dc.identifier.aleph002048887
thesis.degree.nameRNDr.
thesis.degree.levelrigorózní řízenícs_CZ
thesis.degree.disciplineAnthropology and Human Geneticsen_US
thesis.degree.disciplineAntropologie a genetika člověkacs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
uk.thesis.typerigorózní prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra antropologie a genetiky člověkacs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Anthropology and Human Geneticsen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csAntropologie a genetika člověkacs_CZ
uk.degree-discipline.enAnthropology and Human Geneticsen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csUznánocs_CZ
thesis.grade.enRecognizeden_US
uk.abstract.csAnalýza DNA z kosterního materiálu je dnes významným doplňkem antropologických metod, především v případech, kde podle antropologických znaků kosterních ostatků není možné získat požadovanou informaci. Problematikou získávání DNA ze starých a recentních pozůstatků se zabývá mnoho studií a shodují se v tom, že nejobtížnější fází v DNA analýze kosterních materiálu je jeho počáteční zpracování a výběr vhodného postupu pro izolaci DNA. Z tohoto důvodu byly pro tuto práci vybrány čtyři různé izolační postupy (fenol- chloroformová extrakce, metoda založená na adsorpci na silikát - QIAamp DNA Mini kit a DNA IQ System, extrakce s adsorpcí na Dextran Blue), jejichž některé parametry byly optimalizovány pro co největší výtěžnost DNA. Srovnáním kvantifikace vybraných izolačních metod provedené na recentním kosterním materiálu vyšla nejlépe fenol-chloroformová extrakce. Její protokol byl ještě obohacen o činidlo PTB (N-phenylacylthiazolum bromide) a použit na kosterní soubor jedenácti jedinců z pohřebiště Kněževes u Prahy. Dále bylo determinováno pohlaví, amplifikací části genu pro amelogenin, a určeny genetické profily jedinců pomocí STR (Short Tandem Repeat) analýzy. Porovnáním genetických profilů byly detekovány pravděpodobné příbuzenské vztahy mezi jedinci. U tří individuí patřících do skupiny infant...cs_CZ
uk.abstract.enDNA analysis from skeletal materials is significant supplement of the anthropological methods nowadays, especially in cases, where is not possible to obtain required information pursuant to anthropological characteristics of skeletal remains. Many studies dealing with DNA extraction from ancient and recent bones concurred in fact that the most difficult phase in DNA analysis of skeletal materials is its initial manipulation and selection of suitable procedure for DNA isolation. For this thesis, four different isolating techniques (phenol- chloroform extraction, procedure based on silica adsorption - QIAamp DNA Mini kit a DNA IQ System, extraction with Dextran Blue adsorption) were chosen and their parameters were optimized for maximal DNA yield. At comparing the quantification of selected isolating methods performed on recent skeletal materials, the phenol-chloroform extraction resulted as acceptable. This protocol enhanced by PTB (N-phenylacylthiazolum bromide) reagent was used on the skeletal set of eleven specimens from settlement Kněževes near Prague. Further, sex assessment was carried out by the part of amelogenin gene amplification and genetic profiles determined by STR (Short Tandem Repeat) analysis. Probable relationships were estimated on the basic of comparison of genetic profiles among...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra antropologie a genetiky člověkacs_CZ
thesis.grade.codeU
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusU
dc.identifier.lisID990020488870106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV